| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第9-24页 |
| 1.1 海洋石油污染 | 第9-14页 |
| 1.2 石油降解菌 | 第14-18页 |
| 1.3 不动杆菌属石油降解菌研究现状 | 第18-20页 |
| 1.3.1 不动杆菌属的降解优势 | 第18-19页 |
| 1.3.2 不动杆菌属降解石油烃的机理 | 第19-20页 |
| 1.4 比较基因组学 | 第20-22页 |
| 1.5 几种常见烷烃降解基因研究现状 | 第22页 |
| 1.5.1 AlkB烷烃单加氧酶 | 第22页 |
| 1.5.2 AlmA长链烷烃降解酶 | 第22页 |
| 1.6 本文的研究目的与意义 | 第22-24页 |
| 2 研究数据、材料与方法 | 第24-33页 |
| 2.1 菌株基因数据 | 第24-25页 |
| 2.1.1 Acinetobacter sp. Tust-DM21基因组数据 | 第24页 |
| 2.1.2 Acinetobacter sp. Tust-DM21的石油烃降解基因 | 第24-25页 |
| 2.1.3 比较基因组数据 | 第25页 |
| 2.2 实验材料 | 第25-27页 |
| 2.2.1 菌体 | 第25页 |
| 2.2.2 实验试剂及培养基 | 第25-26页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第26-27页 |
| 2.3 实验方法 | 第27-33页 |
| 2.3.1 必需基因分析 | 第27-28页 |
| 2.3.2 Acinetobater sp. TUST-DM21与4株不动杆菌的比较基因组分析 | 第28-29页 |
| 2.3.3 Acinetobater sp. TUST-DM21降解能力研究 | 第29-30页 |
| 2.3.4 AlkB和AlmA的分析和转录表达研究 | 第30-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-63页 |
| 3.1 必需基因分析结果 | 第33-38页 |
| 3.1.1 必需基因分析结果 | 第33-37页 |
| 3.1.2 基因组GO功能分类结果 | 第37-38页 |
| 3.1.3 小结 | 第38页 |
| 3.2 Acinetobater sp. TUST-DM21与4株不动杆菌的比较基因组分析结果 | 第38-51页 |
| 3.2.1 系统进化树分析结果 | 第38页 |
| 3.2.2 共线性分析结果 | 第38-39页 |
| 3.2.3 开放阅读框(ORF)分析结果结果 | 第39-40页 |
| 3.2.4 前噬菌体分析结果 | 第40-45页 |
| 3.2.5 基因岛分析结果 | 第45-48页 |
| 3.2.6 CRISPR分析结果 | 第48页 |
| 3.2.7 启动子及转录因子结合位点分析结果 | 第48-50页 |
| 3.2.8 小结 | 第50-51页 |
| 3.3 Acinetobater sp. TUST-DM21降解能力研究 | 第51-57页 |
| 3.3.1 对原油的降解率及降解趋势 | 第51-55页 |
| 3.3.2 对烷烃、环烃、芳香烃的降解率及降解趋势 | 第55-56页 |
| 3.3.3 小结 | 第56-57页 |
| 3.4 AlkB和AlmA的分析和转录表达研究 | 第57-63页 |
| 3.4.1 RNA电泳及浓度 | 第57页 |
| 3.4.2 扩增熔解曲线 | 第57-59页 |
| 3.4.3 表达趋势和生长趋势 | 第59-61页 |
| 3.4.4 小结 | 第61-63页 |
| 4 结论 | 第63-64页 |
| 4.1 全文总结 | 第63页 |
| 4.2 论文的创新点 | 第63页 |
| 4.3 论文的不足之处 | 第63-64页 |
| 5 参考文献 | 第64-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
