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IRF5基因多态性及表达水平在社区获得性肺炎患者中的作用研究

提要第4-5页
中文摘要第5-9页
abstract第9-14页
英文缩略词第19-21页
第1章 文献综述第21-40页
    第1节 肺炎的炎症机制研究进展第21-29页
        1 前言第21-23页
            1.1 肺炎的一般炎症过程第21-22页
            1.2 肺炎炎症过程的相关因素第22-23页
        2 细胞因子在肺炎炎症应答中的研究进展第23-26页
            2.1 细胞因子的分类及作用第23-24页
            2.2 细胞因子与不同类型的肺炎第24页
            2.3 不同细胞因子的作用时间第24-25页
            2.4 细胞因子与临床预后第25-26页
        3 中性粒细胞在肺炎炎症应答中的研究进展第26-28页
            3.1 中性粒细胞抗感染机制第26页
            3.2 中性粒细胞的活化和迁移第26-27页
            3.3 中性粒细胞凋亡在肺炎炎症反应中的作用第27-28页
        4 展望第28-29页
    第2节 IRF5的研究进展第29-40页
        1 IRF5的生理功能第29-30页
        2 IRF5基因结构和剪接体第30-31页
        3 IRF5基因多态性第31-33页
        4 IRF5与临床疾病第33-38页
            4.1 IRF5和系统性红斑狼疮第33-35页
            4.2 IRF5和类风湿性关节炎第35-37页
            4.3 IRF5和炎症性肠病第37-38页
            4.4 IRF5与其他疾病第38页
        5 展望第38-40页
第2章 实验研究第40-93页
    第1节 IRF5及其相关细胞因子在社区获得性肺炎患者中的表达研究第40-71页
        1 前言第40-41页
        2 研究对象第41-44页
            2.1 研究对象纳入与排除标准第42-43页
                2.1.1 CAP患者纳入与排除标准第42-43页
                2.1.2 肺癌患者(对照组)纳入与排除标准第43页
            2.2 标本采集第43页
            2.3 临床指标采集第43-44页
        3 主要仪器与试剂第44-46页
            3.1 主要仪器第44页
            3.2 主要试剂第44-46页
        4 实验方法第46-51页
            4.1 流式细胞术检测肺炎患者IRF5及淋巴细胞亚群的表达水平第46-47页
                4.1.1 外周血的处理第46页
                4.1.2 制备工作液第46页
                4.1.3 流式细胞术实验步骤第46-47页
            4.2 微量样本多指标流式蛋白定量技术(Cytometric bead array,CBA)检测血浆中IRF5相关细胞因子的浓度第47-48页
                4.2.1 绘制细胞因子标准曲线第47页
                4.2.2 检测待测血清标本第47-48页
            4.3 RT-qPCR法检测外周血及肺泡灌洗液白细胞中IRF5及相关细胞因子mRNA表达水平第48-51页
                4.3.1 外周血及肺泡灌洗液白细胞中IRF5及相关细胞因子总RNA的提取第48页
                4.3.2 逆转录第48-49页
                4.3.3 qPCR引物的设计第49-50页
                4.3.4 实时荧光定量PCR(real-time quantitive PCR,qPCR)反应第50-51页
                4.3.5 mRNA相对表达量计算第51页
            4.4 统计学方法第51页
        5 结果分析第51-68页
            5.1 患者与健康志愿者的一般信息和临床特点第51-53页
            5.2 CAP患者外周血中各型免疫细胞及淋巴细胞亚群的比例分析第53-56页
                5.2.1 CAP患者与对照组外周血中各型免疫细胞的比例对比第53页
                5.2.2 CAP患者与对照组外周血中淋巴细胞亚群分布第53-56页
            5.3 肺炎病人和正常人末梢血WBC中IRF5及下游因子mRNA表达水平的检测第56-58页
            5.4 肺炎病人和正常人末梢血WBC中IRF5及下游因子蛋白水平的检测第58-65页
                5.4.1 流式细胞术检测IRF5在肺炎患者末梢血中的表达第58-61页
                5.4.2 CBA试剂盒检测肺炎患者血清中IRF5下游细胞因子的表达第61-65页
            5.5 肺泡灌洗液中IRF5及下游因子mRNA水平的表达第65-67页
            5.6 IRF5在流感病毒性肺炎中的表达分析第67-68页
        6 讨论第68-70页
        7 小结第70-71页
    第2节 IRF5基因多态性与社区获得性肺炎患者的相关性研究第71-93页
        1 前言第71-72页
        2 研究对象第72-73页
            2.1 研究对象纳入标准及排除标准第72-73页
            2.2 标本采集第73页
            2.3 临床指标采集第73页
        3 主要仪器与试剂第73-75页
            3.1 主要仪器第73-74页
            3.2 主要试剂第74-75页
        4 实验方法第75-79页
            4.1 外周血IRF5rs77571059,rs2004640,rs10954213及rs3807306位点基因型的检测第75-78页
                4.1.1 外周血基因组DNA的提取第75-76页
                4.1.2 DNA浓度及纯度检测第76页
                4.1.3 基因多态性位点的选择及目标片段的引物设计第76-77页
                4.1.4 聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)扩增目的片段第77-78页
                4.1.5 琼脂糖凝胶电泳第78页
                4.1.6 Sanger法测序目的片段第78页
            4.2 微量样本多指标流式蛋白定量技术(Cytometric bead array,CBA)检测血浆中IFN-α及TNF-α的浓度第78页
            4.3 RT-qPCR法检测CAP患者外周血IRF5mRNA表达水平第78页
            4.4 统计学方法第78-79页
                4.4.1 均衡性检验第79页
                4.4.2 Hardy-Weinberg平衡检验第79页
                4.4.3 关联性分析第79页
        5 实验结果第79-91页
            5.1 研究对象的基本信息和临床特点第79-81页
            5.2 PCR扩增目的片段检测与测序结果第81-82页
            5.3 Hardy-Weinberg平衡检验结果第82页
            5.4 IRF5基因SNP位点与CAP易感性的关联性分析第82-86页
                5.4.1 IRF5基因多态性与肺炎敏感性的关系第82-85页
                5.4.2 IRF5基因多态性与肺炎患者炎症程度的关系第85-86页
            5.5 IRF5单体型与CAP易感性的关联性分析第86-89页
                5.5.1 连锁不平衡分析第86-87页
                5.5.2 单体型分析第87-89页
            5.6 IRF5基因多态性与肺炎患者IRF5及其下游因子表达水平的关系第89-91页
        6 讨论第91-92页
        7 小结第92-93页
结论第93-95页
创新性第95-97页
参考文献第97-113页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第113-115页
致谢第115页

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