| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第8-9页 |
| 第一部分 文章综述 | 第9-26页 |
| 1 传染性支气管炎流行病学的国内外研究现状 | 第9-12页 |
| ·传染性支气管炎的国外流行情况 | 第9-11页 |
| ·传染性支气管炎的国内流行情况 | 第11-12页 |
| 2 传染性支气管炎病毒的病原生物学研究 | 第12-14页 |
| ·传染性支气管炎病毒的分类地位 | 第12页 |
| ·IBV的粒子结构 | 第12-14页 |
| 3 IBV的生物学特性 | 第14-15页 |
| ·IBV的理化特性 | 第14页 |
| ·血凝性 | 第14-15页 |
| 4 IBV的临床特征、组织嗜性和病理学特征 | 第15-16页 |
| ·肾型 | 第15页 |
| ·呼吸型 | 第15页 |
| ·腺胃型 | 第15页 |
| ·肠型 | 第15-16页 |
| ·变异型 | 第16页 |
| 5 IBV的检测方法 | 第16-18页 |
| ·病原学诊断 | 第16-17页 |
| ·血清学诊断 | 第17-18页 |
| ·分子生物学诊断技术 | 第18页 |
| 6 IBV的分子生物学 | 第18-26页 |
| ·IBV基因组结构 | 第18-20页 |
| ·IBV非编码区与编码蛋白的生物学功能 | 第20-23页 |
| ·结构蛋白 | 第23-26页 |
| 第二部分 研究内容 | 第26-61页 |
| 1 材料 | 第27-28页 |
| ·病料及分离的病毒 | 第27页 |
| ·主要试剂 | 第27-28页 |
| 2 方法 | 第28-34页 |
| ·病毒的分离 | 第28页 |
| ·增殖与纯化 | 第28页 |
| ·化病毒RNA的抽提 | 第28-29页 |
| ·引物设计 | 第29-31页 |
| ·cDNA第一条链合成的方法 | 第31页 |
| ·PCR扩增体系 | 第31页 |
| ·PCR产物的纯化回收 | 第31-32页 |
| ·连接 | 第32页 |
| ·感受态制备(CaCl2法) | 第32-33页 |
| ·转化 | 第33页 |
| ·鉴定 | 第33页 |
| ·序列的测定 | 第33页 |
| ·序列分析 | 第33页 |
| ·参考毒株的IBV基因序列 | 第33-34页 |
| 3 结果分析 | 第34-47页 |
| ·IBV JH06111株分离株致鸡胚病变 | 第34-35页 |
| ·电泳鉴定结果 | 第35-36页 |
| ·IBV JH06111株全基因组大小与结构 | 第36-38页 |
| ·全基因组同源性及系统进化树分析 | 第38-41页 |
| ·基因重组分析 | 第41-44页 |
| ·分离株S基因序列的变异情况 | 第44-46页 |
| ·S蛋白糖基化位点及结构分析 | 第46-47页 |
| 4 系统进化分析 | 第47-57页 |
| ·JH06111毒株与参考毒株全基因组的遗传进化树分析 | 第47页 |
| ·JH06111毒株与参考毒株lab序列的遗传进化树分析 | 第47页 |
| ·IBV分离株与参考毒株S基因的遗传进化树分析 | 第47-57页 |
| 5 讨论 | 第57-61页 |
| ·基因1 | 第57-58页 |
| ·基因2 | 第58-60页 |
| ·基因4和基因6 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 附录 | 第68-76页 |
| 致谢 | 第76页 |