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MicroRNA在胚胎干细胞分化过程中作用机制研究

缩略词表第7-9页
中文摘要第9-11页
ABSTRACT第11-12页
前言第13-19页
第一部分 :促胚胎干细胞分化microRNA的筛选研究第19-58页
    实验材料第19-27页
        1 细胞株第19页
            1.1 小鼠胚胎干细胞第19页
        2 试剂及抗体第19-20页
            2.1 细胞培养试剂第19-20页
            2.2 生化试剂第20页
            2.3 抗体第20页
        3 工具酶及分子量Marker第20页
        4 试剂盒第20页
        5 核酸合成第20-22页
            5.1 引物合成第20-22页
            5.2 mimics、inhibitors及siRNA合成第22页
        6 生物信息学分析软件第22页
        7 主要耗材第22-23页
        8 主要仪器设备第23-24页
        9 主要试剂的配制第24-27页
            9.1 细胞培养基配制第24-25页
            9.2 细胞培养用溶液配制第25-27页
    实验方法第27-35页
        1 细胞培养第27-29页
            1.1 小鼠胚胎干细胞的培养第27-28页
            1.2 细胞转染实验第28-29页
        2 胚胎干细胞特征检测第29-32页
            2.1 碱性磷酸酶染色第29页
            2.2 免疫荧光第29-30页
            2.3 实时荧光定量PCR第30-31页
            2.4 流式细胞术检测细胞周期第31-32页
            2.5 流式细胞术检测ES细胞OCT4或SSEA1的表达第32页
        3 胚胎干细胞分化能力检测第32-35页
            3.1 拟胚体(Embryoid body,EB)形成实验第32-33页
            3.2 ES细胞向神经元细胞方向分化第33-34页
            3.3 ES细胞向心肌细胞方向分化第34-35页
    实验结果第35-54页
        1. ES细胞的培养及分化第35-37页
            1.1 V6.5和ES1细胞特征鉴定第35-37页
        2. 促ES细胞分化的候选microRNA的筛选第37-54页
            2.1 MicroRNA表达谱分析第38-42页
            2.2 microRNA靶基因预测第42-43页
            2.3 确定功能筛选候选microRNA第43-44页
            2.4 候选microRNA的功能验证第44-51页
            2.5 筛选结果排序第51-52页
            2.6 流式检测Oct4表达情况第52页
            2.7 促ES细胞分化的microRNA在野生型细胞中的功能验证第52-54页
    讨论第54-58页
        1 microRNA功能筛选结果分析第54-56页
            1.1 促ES细胞分化microRNAs第55页
            1.2 促ES细胞自我更新的microRNAs第55-56页
        2 与类似研究的对比和分析第56-58页
第二部分 :miR-23a~27a~24基因簇功能和机制研究第58-119页
    实验材料第58-71页
        1 菌株与质粒第58页
            1.1 菌株第58页
            1.2 质粒第58页
        2 细胞株第58-59页
            2.1 小鼠胚胎干细胞第58页
            2.2 饲养层细胞第58-59页
            2.3 其余细胞系第59页
        3 试剂及抗体第59-61页
            3.1 细胞培养试剂第59-60页
            3.2 生化试剂第60页
            3.3 抗体第60-61页
        4 工具酶及分子量Marker第61页
        5 试剂盒第61-62页
        6 核酸合成第62-65页
            6.1 引物合成第62-65页
            6.2 mimics、inhibitors及siRNA合成第65页
        7 免疫缺陷小鼠第65页
        8 生物信息学分析软件第65-66页
        9 主要耗材第66页
        10 主要仪器设备第66页
        11 主要试剂的配制第66-71页
            11.1 抗生素溶液第66页
            11.2 细菌培养基的配制第66-67页
            11.3 细胞培养基配制第67页
            11.4 Western blot常用溶液配制第67-69页
            11.5 常用试剂的配制第69-71页
    实验方法第71-97页
        1 载体的制备第71-74页
            1.1 感受态细胞的制备第71页
            1.2 质粒的快速热激活转化第71页
            1.3 质粒的小量提取(QIAGEN质粒小提试剂盒)第71-72页
            1.4 质粒的中量或大量提取(QIAGEN质粒中提或大提试剂盒)第72-73页
            1.5 质粒的鉴定第73-74页
        2 细胞培养第74-79页
            2.1 饲养层细胞的制备第74-75页
            2.2 小鼠胚胎干细胞的培养第75-76页
            2.3 Plat-E细胞系复苏、培养及冻存第76-77页
            2.4 NIH-3T3或HEK-293T细胞系复苏、培养及冻存第77页
            2.5 细胞转染实验第77-78页
            2.6 逆转录病毒包装及感染第78-79页
            2.7 小鼠成纤维细胞的重编程第79页
        3 胚胎干细胞或诱导多能干细胞的特征检测第79-84页
            3.1 碱性磷酸酶染色第79页
            3.2 免疫荧光第79-80页
            3.3 实时荧光定量PCR第80页
            3.4 免疫印记(Western Blot)第80-81页
            3.5 流式细胞术检测细胞周期第81页
            3.6 启动子甲基化水平检测第81-83页
            3.7 iPS细胞内外源基因的检测第83-84页
        4 胚胎干细胞分化能力检测第84-86页
            4.1 维甲酸(retinoic acid,RA)诱导分化第84页
            4.2 拟胚体(Embryoid body,EB)形成实验第84页
            4.3 畸胎瘤形成实验第84-86页
        5 microRNA相关实验第86-97页
            5.1 TaqMan stem-loop RT-PCR检测microRNAs的表达第86-87页
            5.2 miRNA的PAGE及Northern杂交第87-88页
            5.3 靶基因3'UTR荧光报告载体的构建第88-89页
            5.4 含有miR-23a-27a-24-2启动子的荧光报告载体的构建第89页
            5.5 双荧光报告实验第89页
            5.6 染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)第89-94页
            5.7 RNA-ChIP第94-97页
    实验结果第97-115页
        1 miR-23a~27a~24-2功能研究第97-103页
            1.1 miR-23a~27a~24-2结构和表达谱分析第97-99页
            1.2 miR-24,miR-27a抑制胚胎干细胞的自我更新第99-102页
            1.3 miR-24,miR-27a促进ES细胞的分化第102-103页
        2 miR-27a,miR-24作用机制研究第103-109页
            2.1 miR-27a,miR-24-2的靶基因预测及验证第103-106页
            2.2 miR-27a,miR-24-2的上游调控研究第106-108页
            2.3 c-myc和miR-27a,miR-24-2靶基因的关系第108-109页
        3 抑制成体细胞中miR-27a和miR-24的表达能提高重编程效率第109-115页
            3.1 重编程过程中抑制miR-27a和miR-24的表达能提高iPSCs的形成效率第110-111页
            3.2 iPSCs自我更新和分化能力鉴定第111-115页
    讨论第115-119页
        1 miR-23a~27a~24-2功能和作用机制第115-116页
        2 microRNA对于ES细胞自我更新和分化调节的作用机理第116-117页
        3 miR-27a和miR-24促分化功能探讨第117-119页
总结第119-120页
参考文献第120-130页
文献综述第130-141页
    参考文献第134-141页
致谢第141-142页

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