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ABEEMσπ方法应用于蛋白质分子中的谷氨酸和天冬氨酸残基pK_a值的快速估算

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
引言第9-11页
1 理论方法第11-16页
    1.1 预测pK_a值方法第11-12页
        1.1.1 实验法预测pK_a值第11页
        1.1.2 理论法预测pK_a值第11-12页
    1.2 估算蛋白中的氨基酸残基的pK_a值第12-16页
        1.2.1 预测蛋白中氨基酸残基的pK_a值的基本思路第12-13页
        1.2.2 ABEEMσπ模型第13-16页
2 在ABEEMσπ理论方法下计算的羧酸分子的原子电荷与pK_a的关系第16-22页
    2.1 电荷分布与pK_a的关系第16-17页
    2.2 ABEEMσπ模型电荷参数的拟合第17-19页
    2.3 羧酸分子的pK_a值的预测第19-22页
3 在ABEEMσπ理论方法下计算的羧酸根负离子的原子电荷与pK_a的关系第22-27页
    3.1 电荷分布与pK_a的关系第22页
    3.2 ABEEMσπ模型参数的拟合第22-24页
    3.3 羧酸根负离子的pK_a值的预测第24-27页
4 生物大分子蛋白中氨基酸残基pK_a值的预测第27-60页
    4.1 溶菌酶蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第27-35页
        4.1.1 溶菌酶(7LYZ)蛋白分子氨基酸残基第27-30页
        4.1.2 溶菌酶(1HEL)蛋白分子氨基酸残基第30-33页
        4.1.3 溶菌酶(2LZT)蛋白分子氨基酸残基第33-35页
    4.2 硫氧还蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第35-43页
        4.2.1 硫氧还蛋白还原酶(1TRW)蛋白分子氨基酸残基第35-38页
        4.2.2 硫氧还蛋白氧化酶(1TRS)蛋白分子氨基酸残基第38-40页
        4.2.3 还原型硫氧还蛋白(1ERT)蛋白分子氨基酸残基第40-42页
        4.2.4 氧化型硫氧还蛋白(1ERU)蛋白分子氨基酸残基第42-43页
    4.3 卵类粘蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第43-47页
        4.3.1 卵类粘蛋白(1OMU)蛋白分子氨基酸残基第43-45页
        4.3.2 火鸡蛋清卵粘蛋白(2OVO)蛋白分子氨基酸残基第45-47页
    4.4 牛胰腺蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第47-50页
        4.4.1 牛胰抑制酶(5PTI)蛋白分子氨基酸残基第47-49页
        4.4.2 牛胰核糖核酸酶(3RN3)蛋白分子氨基酸残基第49-50页
    4.5 细菌蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第50-53页
        4.5.1 链球菌蛋白G(1PGA)蛋白分子氨基酸残基第50-51页
        4.5.2 结核菌素纯蛋白衍化物(1DE3)蛋白分子氨基酸残基第51-53页
    4.6 人类免疫缺陷病毒蛋白酶(1HPX)蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第53-54页
    4.7 重组人胰岛素(1MHI)蛋白分子氨基酸残基pK_a值的预测第54-60页
结论第60-61页
参考文献第61-65页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第65-66页
致谢第66页

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