| 缩写词 | 第12-14页 |
| 摘要 | 第14-20页 |
| ABSTRACT | 第20-27页 |
| 第一章 引言 | 第28-58页 |
| 1 植物花青素研究概况 | 第28-43页 |
| 1.1 植物花青素与花青素苷 | 第28-30页 |
| 1.2 植物花青素苷的功能 | 第30-31页 |
| 1.3 植物花青素苷的提取和含量测定 | 第31-34页 |
| 1.4 植物花青素苷的生物合成途径及其调控 | 第34-39页 |
| 1.5 植物花青素苷合成的转录调控 | 第39-43页 |
| 1.6 环境因子对花青素苷合成的调控 | 第43页 |
| 2 转录组测序技术在观赏植物花青素研究中的应用 | 第43-46页 |
| 2.1 在花青素代谢通路关键基因分离的应用 | 第44-45页 |
| 2.2 在花青素分支调控中的应用 | 第45页 |
| 2.3 在花青素代谢分子调控上的应用 | 第45-46页 |
| 2.4 在花青素环境调控上的应用 | 第46页 |
| 3 植物花青素相关miRNA研究进展 | 第46-48页 |
| 3.1 高通量测序法在花青素miRNA研究中的应用 | 第46-47页 |
| 3.2 花青素合成相关的miRNA | 第47页 |
| 3.3 花青素相关miRNA的功能研究 | 第47-48页 |
| 3.4 诱导花青素合成相关miRNA的因子 | 第48页 |
| 4 观赏植物lncRNA研究进展 | 第48-50页 |
| 4.1 观赏植物长链非编码RNA的预测 | 第48-49页 |
| 4.2 观赏植物长链非编码RNA的生物学功能 | 第49-50页 |
| 5 芭蕉属植物花青素及miRNA的研究现状 | 第50-56页 |
| 5.1 芭蕉属植物的分类地位及其重要性 | 第50页 |
| 5.2 芭蕉属植物花青素的种类和含量 | 第50页 |
| 5.3 芭蕉属植物花青素的功能研究 | 第50-51页 |
| 5.4 芭蕉属植物花青素苷的调控 | 第51页 |
| 5.5 芭蕉属植物miRNA的研究 | 第51-56页 |
| 6 本项目研究的意义和主要内容 | 第56-58页 |
| 6.1 本研究的意义 | 第56-57页 |
| 6.2 本研究的主要内容 | 第57-58页 |
| 第二章 野生蕉果皮色素的分析与鉴定 | 第58-75页 |
| 第一节 野生蕉果皮色素相关代谢物的测定与分析 | 第58-68页 |
| 1 材料与方法 | 第58-62页 |
| 1.1 材料 | 第58-59页 |
| 1.2 方法 | 第59-62页 |
| 2 结果与分析 | 第62-66页 |
| 2.1 野生蕉果皮中花青素的初步定性 | 第62-64页 |
| 2.2 pH示差法测定参数的确定 | 第64页 |
| 2.3 不同提取液及提取方法对野生蕉果皮花青素含量测定的影响 | 第64-65页 |
| 2.4 不同颜色野生蕉果皮中的原花青素和类黄酮含量 | 第65页 |
| 2.5 不同颜色野生蕉果皮中的叶绿素和类胡萝卜素含量变化 | 第65页 |
| 2.6 不同颜色野生蕉果皮中的淀粉和蔗糖含量 | 第65-66页 |
| 3 讨论 | 第66-68页 |
| 3.1 野生蕉果皮中的色素差异 | 第66-67页 |
| 3.2 野生蕉果皮花青苷的提取和测定方法评价 | 第67页 |
| 3.3 蔗糖和淀粉是色素代谢重要的前体物质 | 第67-68页 |
| 第二节 HPLC法鉴定野生蕉果皮的花青苷种类 | 第68-75页 |
| 1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 1.1 供试材料 | 第68页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第68-69页 |
| 1.3 试验方法 | 第69-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-73页 |
| 2.1 混合标准样品的色谱结果 | 第70-71页 |
| 2.2 标准曲线的绘制 | 第71-72页 |
| 2.3 野生蕉果皮的花青素含量测定 | 第72-73页 |
| 3 讨论 | 第73-75页 |
| 3.1 飞燕草色素是紫色野生蕉果皮的主要色素 | 第73-74页 |
| 3.2 野生蕉果皮中的花青素苷合成分支 | 第74-75页 |
| 第三章 不同发育期野生蕉果皮色素及相关酶活性变化分析 | 第75-85页 |
| 第一节 不同发育期野生蕉果皮色素变化分析 | 第75-81页 |
| 1 材料与方法 | 第75-76页 |
| 1.1 材料 | 第75页 |
| 1.2 方法 | 第75-76页 |
| 1.3 试剂与仪器 | 第76页 |
| 2 结果与分析 | 第76-79页 |
| 2.1 标准曲线的绘制 | 第76-77页 |
| 2.2 不同发育程度野生蕉果皮中的花青素、原花青素和类黄酮含量变化 | 第77-78页 |
| 2.3 不同发育程度野生蕉果皮中的类胡萝卜素和总叶绿素含量变化 | 第78页 |
| 2.4 不同发育程度野生蕉果皮中各种色素物质含量的相关性 | 第78-79页 |
| 3 讨论 | 第79-81页 |
| 3.1 果实发育对野生蕉果皮色素代谢物的影响 | 第79页 |
| 3.2 果实发育过程中不同色素代谢物的相关性 | 第79-81页 |
| 第二节 不同发育期野生蕉果皮色素相关酶活性变化分析 | 第81-85页 |
| 1 材料与方法 | 第81页 |
| 1.1 材料 | 第81页 |
| 1.2 方法 | 第81页 |
| 2 结果与分析 | 第81-83页 |
| 2.1 不同发育程度野生蕉果皮花青素合成相关酶的活性变化 | 第81-82页 |
| 2.2 花青素、原花青素和类黄酮与花青素合成关键酶活性的相关性分 | 第82-83页 |
| 3 讨论 | 第83-85页 |
| 3.1 野生蕉果实发育中果皮花青素合成相关酶活性的变化规律 | 第83页 |
| 3.2 野生蕉果皮花青苷积累与各酶活性之间的关系 | 第83-85页 |
| 第四章 野生蕉果皮不同颜色部位的转录组学分析 | 第85-133页 |
| 第一节 野生蕉果皮不同颜色部位的转录组学分析 | 第85-107页 |
| 1 材料与方法 | 第85-87页 |
| 1.1 试验材料 | 第85页 |
| 1.2 RNA提取 | 第85-86页 |
| 1.3 文库的构建及高通量测序 | 第86页 |
| 1.4 生物信息学分析 | 第86-87页 |
| 2 结果与分析 | 第87-105页 |
| 2.1 RNA提取质量检测 | 第87-88页 |
| 2.2 测序质量评估 | 第88页 |
| 2.3 测序序列与参考基因组的比对效率 | 第88-90页 |
| 2.4 基因结构分析 | 第90-91页 |
| 2.5 新基因的挖掘与功能注释 | 第91-96页 |
| 2.6 基因表达与差异表达基因的筛选 | 第96-97页 |
| 2.7 差异表达基因的功能注释和富集分析 | 第97-105页 |
| 3 讨论 | 第105-107页 |
| 3.1 野生蕉果皮转录组数据库的构建评价 | 第105页 |
| 3.2 野生蕉果皮转录组新基因的挖掘 | 第105-106页 |
| 3.3 野生蕉不同颜色果皮转录组的差异 | 第106-107页 |
| 第二节 野生蕉果皮花青素相关基因的分析 | 第107-122页 |
| 1 材料与方法 | 第107-108页 |
| 1.1 野生蕉果皮花青素相关基因的筛选 | 第107页 |
| 1.2 差异基因的表达分析 | 第107页 |
| 1.3 花青素合成相关的转录因子分析 | 第107-108页 |
| 1.4 差异表达基因蛋白互作网络分析 | 第108页 |
| 2 结果与分析 | 第108-119页 |
| 2.1 野生蕉果皮花青素合成相关基因的鉴定 | 第108-109页 |
| 2.2 野生蕉果皮色素相关差异表达基因的同源性比对 | 第109-112页 |
| 2.3 转录组中关于转录因子的预测 | 第112-115页 |
| 2.4 与野生蕉果皮花青素合成相关的转录因子分析 | 第115-116页 |
| 2.5 野生蕉果皮花色苷生物合成相关差异表达基因蛋白互作网络分析 | 第116-118页 |
| 2.6 野生蕉果皮花青素苷合成途径 | 第118-119页 |
| 3 讨论 | 第119-122页 |
| 3.1 野生蕉果皮中花色苷生物合成相关基因的挖掘 | 第119-120页 |
| 3.2 参与野生蕉果皮花青素生物合成的转录因子 | 第120-121页 |
| 3.3 野生蕉果皮花青素苷合成途径 | 第121-122页 |
| 第三节 野生蕉果皮MYB基因的生物信息学分析 | 第122-133页 |
| 1 材料与方法 | 第122-123页 |
| 1.1 野生蕉果皮MYB基因的获得 | 第122页 |
| 1.2 野生蕉果皮R2R3-MYB基因的结构域分析 | 第122页 |
| 1.3 野生蕉转录组R2R3-MYB基因系统发育分析 | 第122-123页 |
| 2 结果与分析 | 第123-131页 |
| 2.1 野生蕉果皮R2R3-MYB基因的鉴定 | 第123-124页 |
| 2.2 野生蕉果皮R2R3-MYB蛋白基序结构分析 | 第124-126页 |
| 2.3 野生蕉转录组R2R3-MYB基因保守元件分析 | 第126-127页 |
| 2.4 野生蕉转录组R2R3-MYB基因系统发育分析 | 第127-131页 |
| 3 讨论 | 第131-133页 |
| 3.1 野生蕉果皮R2R3-MYB基因及其序列保守性 | 第131页 |
| 3.2 野生蕉果皮中参与花青素合成的MYB基因推测 | 第131-133页 |
| 第五章 野生蕉果皮不同颜色部位的lncRNA分析 | 第133-149页 |
| 1 材料与方法 | 第133-135页 |
| 1.1 转录本组装 | 第133页 |
| 1.2 lncRNA鉴定与分析 | 第133页 |
| 1.3 LncRNA靶基因的预测 | 第133-134页 |
| 1.4 LncRNA表达量分析和差异表达LncRNA筛选 | 第134页 |
| 1.5 差异表达lncRNA靶基因的功能注释和富集分析 | 第134页 |
| 1.6 lncRNA保守性分析及已知lncRNA的鉴定 | 第134页 |
| 1.7 差异表达lncRNA靶基因蛋白质互作网络构建 | 第134页 |
| 1.8 mRNA与lncRNA 比较分析 | 第134-135页 |
| 2 结果与分析 | 第135-147页 |
| 2.1 转录本的拼接 | 第135页 |
| 2.2 野生蕉果皮lncRNA的筛选和鉴定 | 第135-136页 |
| 2.3 野生蕉lncRNA序列结构分析 | 第136-139页 |
| 2.4 野生蕉不同颜色果皮差异表达lncRNA筛选 | 第139-140页 |
| 2.5 差异表达lncRNA靶基因的预测及功能注释 | 第140-143页 |
| 2.6 差异表达lncRNA靶基因的富集分析 | 第143-146页 |
| 2.7 野生蕉果皮差异表达lncRNA靶基因蛋白互作网络分析 | 第146页 |
| 2.8 lncRNA与mRNA差异表达交互式分析 | 第146-147页 |
| 3 讨论 | 第147-149页 |
| 3.1 野生蕉果皮lncRNA的序列特征 | 第148页 |
| 3.2 野生蕉果皮lncRNA表达模式及功能预测 | 第148页 |
| 3.3 野生蕉果皮差异表达lncRNA靶基因的蛋白互作网络预测 | 第148-149页 |
| 第六章 野生蕉果皮不同颜色部位的miRNA分析 | 第149-174页 |
| 1 材料与方法 | 第149-151页 |
| 1.1 小RNA文库的构建及高通量测序 | 第149-150页 |
| 1.2 生物信息学分析 | 第150页 |
| 1.3 miRNA差异表达分析及靶基因注释和功能富集 | 第150-151页 |
| 2 结果与分析 | 第151-170页 |
| 2.1 测序数据质量评估 | 第151-153页 |
| 2.2 不同颜色野生蕉果皮的小RNA差异分析 | 第153页 |
| 2.3 野生蕉果皮miRNA的鉴定 | 第153-157页 |
| 2.4 miRNA的表达分析和差异基因筛选 | 第157-160页 |
| 2.5 miRNA靶基因预测和差异表达miRNA靶基因注释 | 第160-163页 |
| 2.6 差异表达miRNA靶基因GO功能和KEGG通路富集分析 | 第163-164页 |
| 2.7 野生蕉果皮miRNA-mRNA联合分析 | 第164-168页 |
| 2.8 野生蕉果皮miRNA-lncRNA联合分析 | 第168-169页 |
| 2.9 野生蕉果皮花青素相关miRNA-mRNA-lncRNA调控网络分析 | 第169-170页 |
| 3 讨论 | 第170-174页 |
| 3.1 野生蕉果皮miRNA的品种特异性 | 第170-171页 |
| 3.2 野生蕉果皮miRNA及其靶基因的调控 | 第171页 |
| 3.3 miRNA对野生蕉果皮花青素合成的调控作用 | 第171-172页 |
| 3.4 mRNA-miRNA-lncRNA互作调控网络 | 第172-174页 |
| 第七章 野生蕉果皮花青素合成相关基因的克隆及表达分析 | 第174-226页 |
| 第一节 野生蕉果皮花青素合成相关基因的克隆与生物信息学分析 | 第174-211页 |
| 1 材料与方法 | 第174-176页 |
| 1.1 材料 | 第174页 |
| 1.2 方法 | 第174-176页 |
| 2 结果与分析 | 第176-208页 |
| 2.1 野生蕉果皮花青素合成差异表达基因的克隆 | 第176-177页 |
| 2.2 花青素合成关键基因的序列分析 | 第177-208页 |
| 3 讨论 | 第208-211页 |
| 3.1 野生蕉果皮中花青素合成上游基因(EBGs)的克隆 | 第209-210页 |
| 3.2 野生蕉果皮中花青素合成下游基因(LBGs)及转运蛋白的克隆 | 第210-211页 |
| 3.3 与花青素苷合成相关的MYB基因克隆 | 第211页 |
| 第二节 野生蕉果皮花青素苷合成相关基因的表达模式分析 | 第211-219页 |
| 1 材料与方法 | 第211-214页 |
| 1.1 材料 | 第211-212页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第212页 |
| 1.3 方法 | 第212-214页 |
| 2 结果与分析 | 第214-218页 |
| 2.1 关键酶基因表达模式分析 | 第214-216页 |
| 2.2 调节基因表达模式分析 | 第216-218页 |
| 3 讨论 | 第218-219页 |
| 3.1 野生蕉果皮中花青素合成结构基因的表达模式分析 | 第218-219页 |
| 3.2 野生蕉果皮中花青素相关转录因子基因表达模式分析 | 第219页 |
| 第三节 miRNA及其靶基因qRT-PCR检测 | 第219-226页 |
| 1 材料与方法 | 第219-221页 |
| 1.1 材料 | 第219页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第219页 |
| 1.3 方法 | 第219-221页 |
| 2 结果与分析 | 第221-223页 |
| 3 讨论 | 第223-226页 |
| 3.1 野生蕉果皮miRNA及其靶基因的表达模式 | 第224页 |
| 3.2 野生蕉果皮中与花青素合成相关的miRNA调控 | 第224-226页 |
| 第八章 结论与展望 | 第226-234页 |
| 1 研究小结 | 第226-232页 |
| 1.1 野生蕉果皮色素的分析与鉴定 | 第226页 |
| 1.2 不同发育期野生蕉果皮色素及相关生理生化指标的变化分析 | 第226-227页 |
| 1.3 野生蕉果皮不同颜色部位的转录组学分析 | 第227-229页 |
| 1.4 野生蕉果皮不同颜色部位的lncRNA分析 | 第229页 |
| 1.5 野生蕉果皮不同颜色部位的miRNA分析 | 第229-230页 |
| 1.6 野生蕉果皮花青素合成相关基因的克隆及表达分析 | 第230页 |
| 1.7 野生蕉果皮mRNA-miRNA-lncRNA的互作调控网络 | 第230-231页 |
| 1.8 野生蕉果皮花青素合成及调控途径 | 第231-232页 |
| 2 创新点 | 第232-233页 |
| 3 展望 | 第233-234页 |
| 参考文献 | 第234-254页 |
| 附录1 克隆得到的野生蕉果皮花青素相关基因的cDNA序列 | 第254-268页 |
| 附录2 克隆得到的野生蕉果皮花青素相关基因的氨基酸序列 | 第268-273页 |
| 附录3 野生蕉果皮中预测的新miRNA序列信息 | 第273-276页 |
| 附录4 野生蕉果皮差异miRNA-lncRNA互作网络 | 第276-277页 |
| 附录5 野生蕉果皮差异miRNA-mRNA互作网络 | 第277-278页 |
| 攻读学位期间的学术论文与研究成果 | 第278-279页 |
| 致谢 | 第279页 |
