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辣椒疫霉(Phytophthora capsici)诱导坏死蛋白基因克隆及功能研究

符号说明第1-13页
中文摘要第13-16页
Abstract第16-19页
1 文献综述第19-70页
   ·辣椒疫病发生与防治研究进展第19-24页
     ·辣椒疫病的发生危害第19-20页
     ·辣椒疫病发生规律和发病条件第20-21页
     ·辣椒疫霉及其生物学特性第21页
     ·辣椒疫霉的生理分化第21-22页
     ·辣椒疫病的防治第22-24页
       ·农业防治第22页
       ·化学防治第22-23页
       ·生物防治第23-24页
   ·植物病原真菌致病基因的研究现状第24-35页
     ·与侵染结构产生有关的基因第25-26页
     ·与角质层及细胞壁降解有关的基因第26-27页
     ·真菌毒素类第27-29页
     ·与信号传导有关的基因第29-31页
     ·与寄主代谢反应相关的基因第31-33页
     ·其它致病基因第33-35页
   ·辣椒疫病的抗性遗传与抗病基因研究进展第35-37页
     ·辣椒对疫病的抗性特点第35-36页
     ·抗疫病基因的分子标记与 QTL 定位第36-37页
   ·卵菌效应蛋白研究进展第37-43页
     ·无毒基因(Avr)第38-40页
     ·毒素第40-43页
       ·NPP 蛋白第40-41页
       ·PcF/ScR 蛋白第41页
       ·CRN 蛋白第41-42页
       ·水解酶以及水解酶抑制子(hydrolase, hydrolase inhibitors)第42页
       ·蛋白酶抑制子(Proteinase inhibitors)第42-43页
       ·葡聚糖酶抑制子(Glucanase inhibitor)第43页
   ·NPP(NEP1-like protein)效应子研究进展第43-49页
     ·NPP 的发现与存在第43-44页
     ·NPP 蛋白的活性第44-45页
     ·NPP 基因结构第45-46页
     ·植物对 NPP 的防卫反应第46-47页
     ·NPP 蛋白致病功能研究第47-49页
   ·农杆菌介导的基因瞬时表达体系第49-51页
     ·瞬时表达的优点第49页
     ·农杆菌瞬时表达的原理第49-50页
     ·PVX 表达载体第50-51页
   ·基因沉默技术第51-57页
     ·转录水平的基因沉默第52页
     ·转录后水平的基因沉默第52-55页
     ·基因沉默原因第55-57页
       ·DNA 甲基化(DNA methylation)第55页
       ·重复序列第55-56页
       ·同源序列第56页
       ·位置效应(position effect)第56-57页
       ·共抑制现象(co-suppression)第57页
       ·反义RNA第57页
   ·卵菌基因沉默研究进展第57-64页
     ·卵菌沉默机制第58-60页
     ·卵菌稳定沉默第60-61页
     ·卵菌瞬时基因沉默第61-62页
     ·基因沉默与表型变化的关系第62-64页
   ·卵菌转化技术的进程与挑战第64-70页
     ·卵菌转化技术研究进展第64-66页
     ·卵菌转化载体系统第66页
     ·选择性标记第66-67页
     ·原生质体转化(protoplast transformation)第67-68页
     ·农杆菌转化(agrobacterium-mediated transformation)第68页
     ·粒子轰击方法转化(transformation by bombardent)第68-69页
     ·电转化(electroporation)第69-70页
2 材料与方法第70-96页
   ·材料第70-72页
     ·辣椒疫霉菌株第70页
     ·菌株与质粒第70页
     ·酶和生化试剂第70页
     ·仪器第70页
     ·培养基第70-71页
     ·溶液配制第71-72页
   ·实验方法第72-96页
     ·辣椒疫霉基因组内诱导坏死蛋白(NPP)基因信息分析第72-73页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白( PCNPP)基因家族成员克隆第73-76页
       ·基因克隆引物设计第73-74页
       ·辣椒疫霉 DNA 提取第74-75页
       ·PcNPP 基因克隆第75-76页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白( PCNPP)基因家族系统进化分析第76-77页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白( PCNPP)基因家族成员在菌丝体内表达第77-81页
       ·辣椒疫霉菌株SD33 总RNA 的提取和cDNA 的合成第77-78页
       ·紫外检测RNA 产率和纯度第78页
       ·反转录cDNA 第一链的合成第78-79页
       ·RT-PCR第79-81页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白(PCNPP)基因家族成员在病原寄主互作过程中表达模式分析第81-83页
       ·接种辣椒叶片第81页
       ·受试辣椒叶片总 RNA 的提取(Trizol 法)第81-82页
       ·RNA 紫外检测反转录第82页
       ·荧光定量 PCR第82-83页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白( PCNPP)基因在植物体内瞬时表达第83-87页
       ·农杆菌瞬时表达载体构建引物设计第83-85页
       ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白PVX 表达载体构建第85-86页
       ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白PVX 表达载体农杆菌转化第86-87页
       ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白PVX 表达载体接种辣椒和烟草第87页
     ·基因PcNPP1 活性位点定点突变第87-89页
       ·PcNPP1 活性位点定点突变引物设计第87-88页
       ·PcNPP1 活性位点定点突变基因PVX 载体构建第88-89页
       ·PcNPP1 定点突变基因接种烟草辣椒第89页
     ·辣椒疫霉菌株 SD33 诱导坏死蛋白(PCNPP)基因稳定沉默第89-94页
       ·卵菌稳定转化载体构建引物设计第89-91页
       ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白稳定沉默表达载体构建第91-92页
       ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白稳定沉默重组载体质粒提取第92页
       ·辣椒疫霉菌转化步骤第92-94页
     ·辣椒疫霉基因沉默转化子的筛选和分子验证第94页
       ·辣椒疫霉PCNPP 基因沉默转化子RT-PCR 分析第94页
       ·辣椒疫霉PCNPP 基因沉默转化子荧光定量PCR 分析第94页
     ·辣椒疫霉 PCNPP 基因沉默转化子筛选及其生物学性状分析第94-96页
       ·游动孢子诱导第94-95页
       ·转化子表型分析第95页
       ·致病性测定第95-96页
3 结果与分析第96-141页
   ·辣椒疫霉基因组信息分析结果第96页
   ·辣椒疫霉 PCNPP 基因克隆第96-117页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp1 基因的克隆及其序列分析第97-98页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp2 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第98-99页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp3 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第99-100页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp4 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第100-101页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp5 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第101-102页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp6 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第102-103页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp7 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第103-105页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp8 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第105-106页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp9 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第106-107页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp10 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第107-109页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp11 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第109-110页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp12 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第110-111页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp13 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第111-112页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp14 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第112-113页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp15 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第113页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp16 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第113-114页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp17 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第114-115页
     ·辣椒疫霉坏死诱导蛋白pcnpp18 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第115-117页
   ·辣椒疫霉PCNPP 基因系统进化分析第117-123页
     ·18 个PcNPP 基因序列比对第117-119页
     ·辣椒疫霉PcNPP 基因系统进化分析第119-123页
   ·PcNPP 基因在辣椒疫霉菌体内体表达分析第123页
   ·PcNPP 基因在辣椒疫霉与寄主互作中表达模式分析第123-126页
   ·PcNPP 基因农杆菌瞬时表达第126-129页
     ·PcNPP 基因PVX 载体构建及农杆菌转化第126-127页
     ·PcNPP 基因农杆菌转化子在辣椒体内瞬时表达第127-128页
     ·PcNPP 基因农杆菌转化子在烟草体内瞬时表达第128-129页
   ·PcNPP1 基因体外突变第129-133页
     ·PcNPP1 基因活性位点突变第129-132页
     ·PcNPP1 基因活性位点突变后农杆菌瞬时表达第132-133页
   ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白 PcNPP 基因稳定沉默突变体的获得第133-138页
   ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白 PcNPP 沉默转化子表型分析第138-139页
   ·辣椒疫霉诱导坏死蛋白PcNPP 沉默转化子致病性测定第139-141页
4 结论与讨论第141-147页
   ·辣椒疫霉基因组信息分析第141页
   ·辣椒疫霉诱导坏死基因确定第141-143页
   ·辣椒疫霉12 个诱导坏死基因在病原与寄主互作过程中表达模式异同第143-144页
   ·辣椒疫霉12 个诱导坏死基因 PVX 表达后农杆菌接种症状差异第144页
   ·辣椒疫霉诱导坏死基因沉默第144-145页
   ·辣椒疫霉 PcNPP 基因沉默突变体致病力降低第145-147页
参考文献第147-166页
附录第166-167页
致谢第167-168页
攻读博士学位期间发表文章第168-169页
博士学位论文内容简介及自评第169页

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