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目标区域捕获测序在不明原因癫痫遗传分析的应用

摘要第5-6页
abstract第6页
第一章 绪论第9-17页
    1.1 癫痫第9-12页
        1.1.1 定义第9页
        1.1.2 流行病学第9-10页
        1.1.3 分类第10-11页
        1.1.4 病因第11页
        1.1.5 遗传特征第11-12页
    1.2 基因检测第12-16页
        1.2.1 研究方法第13页
        1.2.2 研究平台第13-15页
        1.2.3 临床应用第15页
        1.2.4 基因检测的利弊第15-16页
    1.3 本研究工作第16-17页
第二章 材料与方法第17-27页
    2.1 材料第17页
        2.1.1 主要试剂第17页
        2.1.2 实验仪器及设备第17页
    2.2 方法第17-27页
        2.2.1 研究对象第17-18页
        2.2.2 基因芯片第18页
        2.2.3 DNA提取及检测第18-19页
            2.2.3.1 基因组DNA提取第18-19页
            2.2.3.2 DNA质量和浓度检测第19页
        2.2.4 目标区域捕获测序第19-24页
            2.2.4.1 DNA打断第19页
            2.2.4.2 磁珠纯化第19-20页
            2.2.4.3 末端修复第20页
            2.2.4.4 加A尾第20-21页
            2.2.4.5 连接Adapter第21页
            2.2.4.6 pre- Ligation Mediated PCR第21-22页
            2.2.4.7 基因芯片杂交第22页
            2.2.4.8 洗涤和洗脱第22-23页
            2.2.4.9 post- Ligation Mediated PCR及检测第23-24页
            2.2.4.10 Hiseq2000测序第24页
        2.2.5 生物信息分析第24-25页
            2.2.5.1 clean reads筛选第24-25页
            2.2.5.2 序列比对第25页
            2.2.5.3 Call Snp&Indel第25页
        2.2.6 Sanger测序验证第25-27页
            2.2.6.1 验证位点第25页
            2.2.6.2 PCR反应第25-26页
            2.2.6.3 PCR产物电泳、PCR产物纯化及测序第26页
            2.2.6.4 结果分析第26-27页
第三章 结果与讨论第27-50页
    3.1 结果及分析第27-29页
        3.1.1 整体结果第27页
        3.1.2 结果分析第27-29页
            3.1.2.1 数据过滤第27-28页
            3.1.2.2 遗传方式过滤第28页
            3.1.2.3 文献检索过滤第28页
            3.1.2.4 基因型对应表型过滤第28-29页
    3.2 阳性位点概况第29-33页
        3.2.1 GABRA1基因的c.889A>C突变第29-31页
            3.2.1.1 目标区域捕获测序结果第30页
            3.2.1.2 sanger测序结果第30-31页
        3.2.2 SCN2A基因的c.711T>G突变第31-32页
            3.2.2.1 目标区域捕获测序结果第31页
            3.2.2.2 sanger测序结果第31-32页
        3.2.3 SCN8A基因的c.3872T>C错义突变第32-33页
            3.2.3.1 目标区域捕获测序结果第32-33页
            3.2.3.2 sanger测序结果第33页
    3.3 阳性位点功能分析第33-44页
        3.3.1 GABRA1基因的c.889A>C突变第33-37页
        3.3.2 SCN2A基因的c.711T>G突变第37-41页
        3.3.3 SCN8A基因的c.3872T>C错义突变第41-44页
    3.4 检出率相关讨论第44-48页
        3.4.1 实验样本第44-45页
        3.4.2 目标基因第45-46页
        3.4.3 分析方法第46-47页
        3.4.4 检测平台第47-48页
    3.5 检测意义第48-50页
第四章 结论与展望第50-51页
参考文献第51-57页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第57-58页
致谢第58-59页
附件第59页

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