基于网络结构分析脓毒血症诊断标志物的特征和功能
中文摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
第1章 引言 | 第8-17页 |
1.1 研究背景 | 第8-11页 |
1.1.1 脓毒血症 | 第8-9页 |
1.1.2 诊断标志物 | 第9页 |
1.1.3 基因微阵列数据及其应用 | 第9-10页 |
1.1.4 蛋白质相互作用网络及其应用 | 第10-11页 |
1.2 脓毒血症诊断标志物的研究现状 | 第11-13页 |
1.2.1 优势与发展概述 | 第11页 |
1.2.2 常见的诊断标志物 | 第11-12页 |
1.2.3 发展局限 | 第12-13页 |
1.3 研究内容及意义 | 第13-17页 |
1.3.1 研究内容 | 第13-15页 |
1.3.2 研究目的及意义 | 第15-16页 |
1.3.3 创新性分析 | 第16-17页 |
第2章 数据收集、处理与分析 | 第17-26页 |
2.1 脓毒血症诊断标志物数据 | 第17-21页 |
2.1.1 数据收集与处理 | 第17-20页 |
2.1.2 数据分析 | 第20-21页 |
2.2 基因表达谱数据 | 第21-25页 |
2.2.1 数据收集 | 第21-22页 |
2.2.2 差异表达处理 | 第22-23页 |
2.2.3 诊断标志物的差异表达分析 | 第23-25页 |
2.3 蛋白质相互作用数据的收集与处理 | 第25-26页 |
第3章 网络构建与结构分析 | 第26-43页 |
3.1 脓毒血症特异性网络的构建与分析 | 第26-32页 |
3.1.1 参考网络的构建 | 第26-28页 |
3.1.2 最优子网络的寻找 | 第28-30页 |
3.1.3 脓毒血症特异性网络的构建 | 第30页 |
3.1.4 脓毒血症特异性网络的分析 | 第30-32页 |
3.2 诊断标志物的网络结构特征分析 | 第32-34页 |
3.2.1 脓毒血症特异性网络 | 第32-33页 |
3.2.2 脓毒血症最优子网络 | 第33-34页 |
3.2.3 小结 | 第34页 |
3.3 诊断标志物的网络拓扑结构分析 | 第34-43页 |
3.3.1 脓毒血症特异性网络 | 第35-40页 |
3.3.2 蛋白质相互作用网络 | 第40-42页 |
3.3.3 小结 | 第42-43页 |
第4章 功能研究 | 第43-67页 |
4.1 脓毒血症特异性网络的生物功能验证 | 第43-47页 |
4.1.1 基因本体论验证 | 第43-45页 |
4.1.2 疾病与生物功能验证 | 第45-47页 |
4.2 诊断标志物的生物功能分析 | 第47-62页 |
4.2.1 功能注释 | 第47-51页 |
4.2.2 通路富集分析 | 第51-59页 |
4.2.3 生物功能分类 | 第59-62页 |
4.3 差异表达基因的通路富集分析 | 第62-65页 |
4.4 诊断标志物与差异表达基因通路的比较 | 第65-67页 |
第5章 总结与展望 | 第67-72页 |
5.1 研究总结 | 第67-70页 |
5.2 研究展望 | 第70-72页 |
参考文献 | 第72-77页 |
附录 | 第77-97页 |
致谢 | 第97-98页 |