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根肿病菌侵染茎瘤芥差减文库的构建及其差异表达基因鉴定

摘要第3-6页
ABSTRACT第6-9页
1 绪论第13-33页
    1.1 引言第13页
    1.2 根肿病的生物学特性第13-15页
        1.2.1 根肿病菌的分类第13-14页
        1.2.2 根肿病菌的生活史第14页
        1.2.3 根肿病的症状第14-15页
    1.3 根肿病的检测方法第15-17页
        1.3.1 诱饵检测法第15页
        1.3.2 镜检和血清学检测第15-16页
        1.3.3 PCR 检测第16-17页
    1.4 根肿病的防治措施第17-20页
        1.4.1 综合防控措施第17-18页
        1.4.2 化学防治第18-19页
        1.4.3 生物防治第19页
        1.4.4 抗病品种的培育第19-20页
    1.5 根肿病致病机理的研究第20-23页
        1.5.1 根肿病菌与寄主互作的研究第20页
        1.5.2 根肿病病程的激素调控研究第20-23页
    1.6 植物抗病机制第23-25页
        1.6.1 植物天然免疫第23-24页
        1.6.2 “基因对基因”学说第24页
        1.6.3 植物防御机理第24-25页
    1.7 植物病程差异表达基因的筛选第25-28页
        1.7.1 抑制差减杂交技术的主要原理第25页
        1.7.2 抑制差减杂交技术的操作流程第25-26页
        1.7.3 抑制差减杂交技术的优缺点第26-28页
    1.8 立题依据第28-29页
    1.9 研究内容和技术路线第29-31页
        1.9.1 研究内容第29页
        1.9.2 技术路线第29-31页
    1.10 本研究的创新点第31-33页
2 利用抑制差减杂交技术筛选根肿菌侵染茎瘤芥差异表达基因第33-57页
    2.1 引言第33页
    2.2 材料与方法第33-44页
        2.2.1 实验材料第33页
        2.2.2 主要试剂及其配制第33-35页
        2.2.3 主要仪器设备第35页
        2.2.4 茎瘤芥 RNA 的提取第35页
        2.2.5 cDNA 的合成与回收第35-36页
        2.2.6 抑制消减杂交第36-39页
        2.2.7 差减产物的克隆与文库构建第39-41页
        2.2.8 差异显示基因的测序和生物信息学分析第41-43页
        2.2.9 实时荧光定量 qRT-pPCR 检测验证特定基因在根肿菌接种后的表达水平第43-44页
    2.3 结果与分析第44-53页
        2.3.1 茎瘤芥 RNA 的质量检测第45页
        2.3.2 茎瘤芥 cDNA 的合成及循环数优化第45-46页
        2.3.3 茎瘤芥抑制差减杂交第46-48页
        2.3.4 差减文库验证和分析第48-50页
        2.3.5 在抑制差减杂交文库中差异表达的基因分析第50页
        2.3.6 差异表达基因的荧光定量 PCR 验证结果第50-53页
    2.4 讨论第53-57页
3 罹病茎瘤芥胁迫与防御反应基因的表达分析第57-71页
    3.1 引言第57页
    3.2 材料与方法第57-59页
        3.2.1 实验材料第57页
        3.2.2 主要仪器设备第57-58页
        3.2.3 主要试剂第58页
        3.2.4 茎瘤芥根 RNA 的提取第58页
        3.2.5 反转录,合成单链 cDNA第58-59页
        3.2.7 茎瘤芥胁迫与防御基因的 qPCR第59页
    3.3 结果与分析第59-66页
        3.3.1 根肿病菌侵染胁迫防御基因的表达第59-62页
        3.3.2 激素诱导后 CDPK5 和 PR4 基因的表达第62-66页
    3.4 讨论第66-71页
4 乙烯反应转录因子 ERF 和病程相关蛋白基因 PR4 的全长克隆及生物信息学分析第71-85页
    4.1 材料与方法第71-76页
        4.1.1 主要试剂第71页
        4.1.2 实验材料第71页
        4.1.3 引物设计与合成第71-72页
        4.1.4 乙烯反应转录因子 ERF 和病程相关蛋白基因 PR43' RACE 扩增第72-74页
        4.1.5 ERF 和 PR4 目的片段的扩增第74-75页
        4.1.6 生物信息学分析第75-76页
    4.2 结果与分析第76-84页
        4.2.1 ERF 和 PR4 的全长序列及分析第76页
        4.2.2 ERF 和 PR4 氨基酸序列预测及结构分析第76-83页
        4.2.3 ERF 和 PR4 系统进化分析第83-84页
    4.3 讨论第84-85页
5 乙烯反应转录因子基因超表达载体的构建及遗传转化研究第85-95页
    5.1 材料与方法第85-91页
        5.1.1 材料第85-87页
        5.1.2 方法第87-91页
    5.2 结果与分析第91-94页
        5.2.1 pVCT2024 载体质粒酶切第91页
        5.2.2 线性化载体与插入片段的连接第91-93页
        5.2.3 转基因植株的筛选第93-94页
    5.3 讨论第94-95页
6 主要结论与后续研究第95-97页
    6.1 主要结论第95-96页
    6.2 后续研究工作第96-97页
致谢第97-99页
参考文献第99-111页
附录第111-118页
    A. 作者在攻读博士学位期间发表的论文第111页
    B. 作者在攻读博士学位期间参加的科研项目第111页
    C. 根肿病菌侵染过程中茎瘤芥上调表达基因第111-118页
    D. 抑制差减杂交接头序列第118页

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