基于遗传模板的电子密度图解释方法的研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 本课题研究背景 | 第8页 |
| 1.2 本课题研究现状 | 第8-12页 |
| 1.2.1 蛋白质结构解析简介 | 第8-11页 |
| 1.2.2 国外蛋白质结构解析的发展和分析 | 第11页 |
| 1.2.3 国内蛋白质结构解析的发展和分析 | 第11-12页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第12页 |
| 1.4 研究内容 | 第12-13页 |
| 1.5 本章小结 | 第13-14页 |
| 2 蛋白质预测的经典算法及方法介绍 | 第14-24页 |
| 2.1 本研究相关方法学的介绍 | 第14-17页 |
| 2.1.1 蛋白质晶体学研究介绍 | 第14页 |
| 2.1.2 X射线晶体学与电子密度图解析 | 第14-17页 |
| 2.2 蛋白质结构预测的经典算法 | 第17-22页 |
| 2.2.1 ARP/wARP算法 | 第17-18页 |
| 2.2.2 TEXTAL算法 | 第18-19页 |
| 2.2.3 RESOLVE算法 | 第19-20页 |
| 2.2.4 Buccaneer算法 | 第20页 |
| 2.2.5 ACMI算法简述 | 第20-21页 |
| 2.2.6 基于模版的预测方法 | 第21-22页 |
| 2.3 本章小结 | 第22-24页 |
| 3 基于遗传模板的电子密度图解释方法的研究 | 第24-48页 |
| 3.1 技术路线 | 第25-29页 |
| 3.1.1 电子密度图的预处理 | 第25-27页 |
| 3.1.2 目标蛋白质结构模板的构造 | 第27-28页 |
| 3.1.3 结构模板的优化 | 第28-29页 |
| 3.2 ACMI算法详述 | 第29-39页 |
| 3.2.1 算法综述 | 第29页 |
| 3.2.2 局部匹配 | 第29-34页 |
| 3.2.3 全局限制 | 第34-39页 |
| 3.3 搜索模版结构与序列比对 | 第39-43页 |
| 3.4 球函数和快速旋转函数 | 第43页 |
| 3.5 快速模版匹配的方法 | 第43-47页 |
| 3.6 本章小结 | 第47-48页 |
| 4 结果分析和讨论 | 第48-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
