| DEDICATION | 第3-4页 |
| DECLARATION | 第4-5页 |
| CERTIFICATION | 第5-6页 |
| ACKNOWLEDGMENT | 第6-7页 |
| LIST OF FIGURES AND TABLES | 第7-8页 |
| ABBREVIATIONS | 第8-10页 |
| UNIT ABBREVIATIONS | 第10-11页 |
| TABLE OF CONTENTS | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13页 |
| Chapter I Introduction and Literature Review | 第14-31页 |
| Introduction | 第14-17页 |
| Literature Review | 第17-28页 |
| 1．1 Rice | 第17-20页 |
| 1．1．1 Aspects about plant growth internodes elongation in stem rice | 第18-19页 |
| 1．1．2 Some genes that play role in elongation stem in rice plant induced by hormone | 第19-20页 |
| 1．2 Gibberellins | 第20-23页 |
| 1．2．1 Functions of Gibberellins | 第21-22页 |
| 1．2．2 GA-regulated gene expression | 第22-23页 |
| 1．3 Microarray technology and Expression Sequence Tags | 第23-28页 |
| 1．3．1 Microarray Technology | 第23页 |
| 1．3．2 Principle microarray technology | 第23-24页 |
| 1．3．3 Application | 第24-25页 |
| 1．3．4 Advantages of microarray | 第25-26页 |
| 1．3．5 General Aspects about ESTs | 第26-28页 |
| 1．3．6 Some applications of EST | 第28页 |
| Investigation aim and objectives | 第28-31页 |
| Chapter II． Materials and Methods | 第31-54页 |
| 2．1 Plant Materials | 第31页 |
| 2．1．1． GA treatment and samples | 第31页 |
| 2．2 Extraction of total RNA | 第31-32页 |
| 2．3 Purification of total RNA | 第32-33页 |
| 2．4 Isolation of Poly A~+ mRNA from total RNA | 第33-34页 |
| 2．5 cDNA Library construction | 第34-40页 |
| 2．5．1 First strand cDNA synthesis | 第34-36页 |
| 2．5．2 cDNA amplification by LD PCR | 第36-37页 |
| 2．5．3 Digestion in NotI and SalI | 第37-38页 |
| 2．5．4 Ligation of ds cDNA to pSPORT II (GIBCO/BRL company) vector | 第38-39页 |
| 2．5．5 Transformation into E．coli DH5 α | 第39-40页 |
| 2．6 cDNA library | 第40-41页 |
| 2．6．1 cDNA library plating | 第40页 |
| 2．6．2 Clones Inoculation | 第40-41页 |
| 2．6．3 Plasmid Store (LB/glycerol 1:1) | 第41页 |
| 2．7 Plasmid extraction by Mini-preparation using Multi-Screen 96-Well Filter plates | 第41-48页 |
| 2．7．1 Sequencing and analysis | 第43页 |
| 2．7．2 Preparation of sequencing reaction | 第43-44页 |
| 2．7．3 Post-reaction clean up | 第44-45页 |
| 2．7．4 Instruments setup and analysis of data | 第45页 |
| 2．7．5 Injection and run parameters | 第45-46页 |
| 2．7．6 Polymerase Chain Reaction (PCR) | 第46页 |
| 2．7．7 PCR product cleaning | 第46-47页 |
| 2．7．8 Database building | 第47页 |
| 2．7．9 ESTs data analysis | 第47-48页 |
| 2．8 Preparation of cDNA array | 第48-49页 |
| 2．9 Preparation of labeled cDNA | 第49页 |
| 2．10 Chip hybridization | 第49-51页 |
| 2．10．1 Prehybridization | 第49-50页 |
| 2．10．2 Hybridization | 第50页 |
| 2．10．3 Membranes washing | 第50-51页 |
| 2．11 Scanning the membrane | 第51页 |
| 2．12 Quantitative real-time PCR | 第51-54页 |
| Chapter III Results | 第54-68页 |
| 3．1 Characterization of the cDNA library | 第54-56页 |
| 3．2 Identification analysis of TUTs sequences and similarities found | 第56页 |
| 3．3 Functional annotation | 第56-59页 |
| 3．4 Highly expressed genes | 第59-61页 |
| 3．5 Homologous comparison to other organism | 第61-62页 |
| 3．6 Analysis of cDNA array data and identification of differentially expressed genes | 第62-66页 |
| 3．7 Quantitative real-time PCR analysis to validate array results | 第66-68页 |
| Chapter IV． Discussion and conclusions | 第68-86页 |
| 4．1 High genes expression profiles of the rice stem relate to ESTs functional annotation | 第68-71页 |
| 4．2 Genes with high expression library induced by gibberellin in 36h | 第71-74页 |
| 4．3 Differentially expressed genes related with metabolic process induced by gibberellin in 12 and 36 h | 第74-85页 |
| 4．4 Conclusion | 第85-86页 |
| Recommendation | 第86-87页 |
| Reference List | 第87-99页 |
