摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7页 |
第1章 引言 | 第10-22页 |
1.1 基因突变及其研究现状 | 第11-15页 |
1.1.1 基因突变的种类 | 第12-13页 |
1.1.2 基因突变的影响 | 第13-15页 |
1.2 单核苷酸多态性(SNPs) | 第15-17页 |
1.2.1 单核苷酸多态性简介 | 第15-16页 |
1.2.2 单核苷酸多态性特点及研究方法 | 第16页 |
1.2.3 单核苷酸多态性研究现状 | 第16-17页 |
1.3 蛋白质组学及其研究现状 | 第17-22页 |
1.3.1 蛋白质组学简介 | 第17-18页 |
1.3.2 基于质谱的鸟枪法蛋白质组学实验 | 第18-20页 |
1.3.3 鸟枪法蛋白质组学数据分析 | 第20-22页 |
第2章 研究数据及方法 | 第22-37页 |
2.1 变异信息收集 | 第22-28页 |
2.1.1 dbSNP-单核苷酸多态性数据库 | 第23页 |
2.1.2 COSMIC-癌症体细胞突变库 | 第23-24页 |
2.1.3 HPMD-人类蛋白质变异数据库 | 第24页 |
2.1.4 Ensembl变异数据库 | 第24-25页 |
2.1.5 Uniprot变异数据库 | 第25-26页 |
2.1.6 PMD-蛋白质变异数据库 | 第26页 |
2.1.7 CanProVar-人类癌症蛋白质组变异数据库 | 第26-27页 |
2.1.8 MSIPI数据库 | 第27-28页 |
2.2 变异信息库的构建 | 第28-29页 |
2.3 原始数据收集 | 第29-31页 |
2.4 数据整合及处理 | 第31-37页 |
2.4.1 质谱数据原始格式 | 第31页 |
2.4.2 通用质谱数据格式 | 第31-32页 |
2.4.3 数据分析流程及质量控制 | 第32-36页 |
2.4.4 数据整合 | 第36-37页 |
第3章 数据库介绍及使用 | 第37-47页 |
3.1 数据库存储设计 | 第37-39页 |
3.2 技术方法 | 第39-42页 |
3.2.1 Linux操作系统 | 第40页 |
3.2.2 Apache服务器 | 第40页 |
3.2.3 MySQL数据库 | 第40-41页 |
3.2.4 PHP脚本语言 | 第41页 |
3.2.5 HTML语言、JavaScript及CSS | 第41-42页 |
3.3 数据库使用指南 | 第42-47页 |
3.4 数据下载 | 第47页 |
第4章 总结与展望 | 第47-49页 |
4.1 讨论 | 第47-48页 |
4.2 展望 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-52页 |
后记 | 第52-53页 |
附录 | 第53-64页 |