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解淀粉芽孢杆菌NJN-6拮抗物质的分离鉴定及对土壤微生物区系的影响研究

摘要第10-13页
ABSTRACT第13-16页
缩略语及专有词汇检索表第17-18页
第一章 文献综述第18-28页
    1 根际促生有益菌第18-20页
        1.1 根际促生有益菌的作用机理与应用第18页
        1.2 芽孢杆菌类的拮抗物质第18-20页
    2 根际第20-21页
        2.1 根际与根系分泌物第20-21页
        2.2 根系分泌物对芽孢杆菌的影响第21页
    3 拮抗物质对土壤微生物的影响第21-22页
    4 土壤微生物群落结构和多样性的研究方法第22-24页
        4.1 土壤微生物群落结构和多样性概述第22-23页
        4.2 变性梯度凝胶电泳图谱(DGGE)第23页
        4.3 高通量测序技术第23-24页
    5 本研究的目的、意义和技术路线第24-28页
        5.1 本研究的目的和意义第24-25页
        5.2 问题与解决方法第25-26页
        5.3 本研究的技术路线第26-28页
第二章 菌株NJN-6非挥发性拮抗物质的分离鉴定第28-42页
    1 材料与方法第29-32页
        1.1 材料第29页
        1.2 方法第29-32页
            1.2.1 发酵液中Iturin A类物质的提取第29页
            1.2.2 粗提液的拮抗效果实验第29-30页
            1.2.3 粗提液IturinA类拮抗物质的鉴定第30页
            1.2.4 发酵液中Bacillomycin和macrolactin类拮抗物质的提取第30-31页
            1.2.5 粗提液中Bacillomycin和macrolactin类拮抗物质的纯化第31页
            1.2.6 Bacillomycin和macrolactin类拮抗物质的抗菌实验第31页
            1.2.7 Bacillomycin和macrolactin类拮抗物质的HPLC-ESI-MS鉴定第31-32页
    2 结果与分析第32-38页
        2.1 iturinA粗提物对FOC的抑制作用第32页
        2.2 粗提物中iturinA的鉴定第32-34页
        2.3 发酵液中Bacillomycin和macrolactin类拮抗物质的提取第34-35页
        2.4 Bacillomycin和macrolactin的纯化及抗菌实验第35-36页
        2.5 Bacillomycin和macrolactin的鉴定第36-38页
    3 讨论第38-40页
    4 小结第40-42页
第三章 发酵液中脂肽类物质的快速定量方法研究第42-48页
    1 材料与方法第42-44页
        1.1 材料第42-43页
        1.2 方法第43-44页
            1.2.1 IturinA的发酵制备第43页
            1.2.2 双水相系统的构建第43页
            1.2.3 双水相萃取第43页
            1.2.4 HPLC检测条件的优化第43页
            1.2.5 标准曲线的绘制及方法回收率测定第43-44页
    2 结果与分析第44-46页
        2.1 双水相系统的构建第44页
        2.2 双水相萃取中pH的优化第44-45页
        2.3 HPLC检测中柱温的优化第45页
        2.4 标准曲线的绘制第45-46页
        2.5 Iturin A的定量分析及回收率实验第46页
    3 讨论第46-47页
    4 小结第47-48页
第四章 NJN-6菌株挥发性拮抗物质的分离鉴定第48-60页
    1 材料与方法第49-51页
        1.1 材料第49页
        1.2 方法第49-51页
            1.2.1 菌株NJN-6产挥发性物质对真菌菌丝生长和孢子萌发的抑制第49-50页
            1.2.2 菌株NJN-6产挥发性物质对土壤中尖孢镰刀菌的抑制第50页
            1.2.3 菌株NJN-6所产VOCs的固相微萃取(SPME)富集第50页
            1.2.4 菌株NJN-6所产挥发性物质的GC-MS鉴定第50页
            1.2.5 挥发性物质的纯品对尖孢镰刀菌菌丝生长的抑制效率第50-51页
    2 结果与分析第51-57页
        2.1 菌株NJN-6产挥发性物质对真菌菌丝生长和孢子萌发的抑制第51页
        2.2 菌株NJN-6产挥发性物质对土壤中尖孢镰刀菌的抑制第51-52页
        2.3 菌株NJN-6产挥发性物质的GC-MS鉴定及其纯品的抗真菌效果第52-57页
    3 讨论第57-58页
    4 小结第58-60页
第五章 根系分泌物对菌株NJN-6根际定殖和拮抗物质产生的影响第60-70页
    1 材料与方法第61-63页
        1.1 材料第61-62页
        1.2 方法第62-63页
            1.2.1 香蕉根系分泌物的收集第62页
            1.2.2 菌株NJN-6在香蕉根系定殖能力研究第62-63页
            1.2.3 香蕉根系定殖后菌株NJN-6中拮抗物质基因和生物膜形成基因的表达第63页
            1.2.4 香蕉根系分泌物中菌株NJN-6活性物质的产生第63页
    2 结果与分析第63-68页
        2.1 菌株NJN-6生物膜形成及其在香蕉根际定殖能力分析第63-64页
        2.2 香蕉根系分泌物中菌株NJN-6产活性物质的检测第64-65页
        2.3 香蕉根系定殖后菌株NJN-6功能基因的表达第65-68页
    3 讨论第68-69页
    4 小结第69-70页
第六章 抗细菌性拮抗物质对土壤细菌区系及PKS基因丰度的影响第70-84页
    1 材料与方法第71-74页
        1.1 材料第71页
        1.2 方法第71-74页
            1.2.1 抗细菌性拮抗物质的获得第71-72页
            1.2.2 抗细菌性拮抗物质的HPLC检测第72页
            1.2.3 土壤处理第72-73页
            1.2.4 土壤总DNA的提取及16S rRNA基因的扩增第73页
            1.2.5 高通量数据基本分析第73-74页
            1.2.6 总细菌和PKS基因的定量第74页
            1.2.7 生物数据统计分析第74页
    2 结果与分析第74-81页
        2.1 抗细菌性拮抗物质的提取第74-76页
        2.2 抗细菌性拮抗物质对土壤中16S rRNA和PKS基因丰度的影响第76-77页
        2.3 抗细菌性拮抗物质对土壤细菌群落组成的影响第77-78页
        2.4 抗细菌性拮抗物质对土壤细菌群落多样性的影响第78-80页
        2.5 抗细菌性拮抗物质对土壤细菌功能的潜在影响第80-81页
    3 讨论第81-83页
    4 小结第83-84页
第七章 抗真菌性拮抗物质对土壤真菌区系及NRPS基因丰度的影响第84-98页
    1 材料与方法第85-88页
        1.1 材料第85页
        1.2 方法第85-88页
            1.2.1 抗真菌性拮抗物质的获得第85-86页
            1.2.2 抗真菌性拮抗物质的HPLC检测第86页
            1.2.3 土壤处理第86页
            1.2.4 土壤总DNA的提取及ITS基因的扩增第86-87页
            1.2.5 高通量数据基本分析第87页
            1.2.6 总真菌和NRPS基因的定量第87-88页
            1.2.7 生物数据统计分析第88页
    2 结果与分析第88-95页
        2.1 抗真菌性拮抗物质的分离第88-89页
        2.2 抗真菌性拮抗物质对土壤真菌群落组成的影响第89-94页
        2.3 抗真菌性拮抗物质对土壤真菌群落alpha多样性的影响第94-95页
        2.4 抗真菌性拮抗物质对土壤真菌丰度和NRPS基因丰度的影响第95页
    3 讨论第95-97页
    4 小结第97-98页
第八章 NJN-6菌株产挥发性有机物对土壤微生物区系和功能基因丰度的影响第98-110页
    1 材料与方法第99-100页
        1.1 材料第99页
        1.2 方法第99-100页
            1.2.1 VOCs类物质的产生第99页
            1.2.2 土壤处理第99页
            1.2.3 土壤总DNA的提取及16S和ITS基因的扩增第99-100页
            1.2.4 高通量数据基本分析第100页
            1.2.5 土壤总真菌、总细菌、PKS基因、NRPS基因和N循环相关基因的定量第100页
            1.2.6 生物数据统计分析第100页
    2 结果与分析第100-108页
        2.1 挥发性物质对土壤细菌丰度、真菌丰度、PKS基因、NRPS基因和N循环相关基因的影响第100-102页
        2.2 挥发性物质对土壤细菌群落组成的影响第102-104页
        2.3 挥发性物质对土壤细菌群落多样性的影响第104-105页
        2.4 挥发性物质对土壤真菌群落组成的影响第105-106页
        2.5 挥发性物质对土壤真菌群落多样性的影响第106-108页
    3 讨论第108-109页
    4 小结第109-110页
参考文献第110-130页
全文总结及展望第130-132页
创新点第132-134页
博士期间发表论文第134-136页
致谢第136-137页

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