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几类金属酶和糖苷酶催化机理的理论研究

中文摘要第10-14页
ABSTRACT第14-18页
第一章 绪论第19-28页
    1.1 酶概论第19-24页
        1.1.1 酶的概念与化学本质第19页
        1.1.2 酶催化的特点第19-20页
        1.1.3 酶的分类和命名第20-21页
        1.1.4 酶催化的结构基础第21-23页
        1.1.5 酶催化作用机制第23-24页
    1.2 酶的应用及酶工程第24-25页
    1.3 本论文研究目的及内容第25-26页
    参考文献第26-28页
第二章 理论基础和计算方法第28-40页
    2.1 分子对接方法第28-29页
    2.2 分子动力学模拟方法第29-31页
    2.3 量子化学方法第31-33页
    2.4 量子力学与分子动力学组合(QM/MM)方法第33-36页
    参考文献第36-40页
第三章 AsqJ加双氧酶催化喹啉生物碱合成机理的理论研究第40-62页
    3.1 前言第40-42页
    3.2 计算细节第42-45页
        3.2.1 动力学模拟第42-44页
        3.2.2 QM/MM计算第44-45页
    3.3 结果与讨论第45-55页
        3.3.1 Fe~Ⅳ=O异构化反应第45-47页
        3.3.2 底物去饱和化反应第47-50页
        3.3.3 环氧化反应第50-53页
        3.3.4 N-4甲基对去饱和化反应的影响第53-55页
    3.4 结论第55页
    参考文献第55-62页
第四章 枯草芽孢杆菌中咪唑啉酮酸酶催化机理的理论研究第62-83页
    4.1 前言第62-64页
    4.2 计算细节第64-68页
        4.2.1 计算模型第64-66页
        4.2.2 QM/MM计算第66-68页
    4.3 结果与讨论第68-78页
        4.3.1 Zn~(2+)配位的水分子的活化第68-71页
        4.3.2 底物的水解第71-78页
    4.4 结论第78页
    参考文献第78-83页
第五章 枯草芽孢杆菌中氮-乙酰葡糖胺糖苷水解酶催化机理的理论研究第83-105页
    5.1 前言第83-85页
    5.2 计算方法第85-89页
        5.2.1 模型构建第85-88页
        5.2.2 QM/MM计算第88-89页
    5.3 结果与讨论第89-97页
        5.3.1 酶-底物复合物的结构第89页
        5.3.2 反应路径第89-96页
        5.3.3 底物扭曲对催化反应的影响第96-97页
    5.4 结论第97-98页
    参考文献第98-105页
第六章 龙须菜属红海藻中α-1,4-糖苷裂解酶催化机理的研究第105-125页
    6.1 前言第105-107页
    6.2 计算细节第107-110页
        6.2.1 计算模型第107-109页
        6.2.2 QM/MM计算第109-110页
    6.3 结果与讨论第110-118页
        6.3.1 糖苷裂解酶与麦芽四糖的复合结构第110-111页
        6.3.2 反应路径第111-118页
    6.4 结论第118页
    参考文献第118-125页
总结与结论第125-126页
致谢第126-127页
博士期间发表的论文第127-129页
附已发表论文第129-162页
学位论文评阅及答辩情况表第162页

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