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山核桃嫁接过程中Aux/IAA基因功能研究和小RNA测序分析

中文摘要第1-6页
Abstract第6-10页
前言第10-11页
1 文献综述第11-20页
   ·植物生长素原初响应基因Aux/IAA的研究进展第11-15页
     ·植物的生长素原初响应基因的结构特征第11-12页
     ·植物生长素原初响应基因的生物学功能第12-14页
     ·植物生长素原初响应基因的调控机制第14-15页
   ·植物miRNA的作用机制与功能第15-17页
   ·新一代高通量测序技术第17-18页
   ·本研究的目的与意义第18-20页
2 材料与方法第20-33页
   ·材料准备第20-21页
     ·植物材料第20-21页
     ·主要仪器第21页
     ·试剂与来源第21页
   ·实验方法第21-33页
     ·总RNA的提取第21-23页
       ·改良CTAB+Trizol法第21-22页
       ·改良CTAB+EASYspin试剂盒第22-23页
       ·总RNA质量的检测第23页
     ·山核桃Aux/IAA基因的RACE扩增第23-25页
       ·RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)引物设计第23页
       ·第一链cDNA的扩增第23页
       ·RACE扩增第23-24页
       ·阳性片段的回收第24页
       ·PCR回收产物和PMD18-T载体连接,制备感受态并转化第24-25页
       ·细菌检测第25页
     ·CcIAA基因验证和序列分析第25-26页
     ·CcIAA基因生物信息学的分析第26页
     ·CcIAA基因在转录水平上的分析第26-27页
       ·山核桃不同的嫁接时期嫁接茎总RNA的提取第26页
       ·内参与目的基因的引物设计第26页
       ·cDNA第一链合成第26页
       ·模板与引物的验证第26-27页
       ·实时荧光定量PCR第27页
     ·CcIAA基因在翻译水平上的表达分析第27-29页
       ·不同嫁接时期山核桃嫁接茎总蛋白提取与检测第27-28页
       ·Western blot第28-29页
     ·山核桃小RNA测序分析第29-33页
       ·总RNA提取,miRNA文库构建及Solexa测序第29页
       ·山核桃miRNA序列分析第29-30页
       ·山核桃miRNA差异表达分析第30页
       ·miRNA与靶基因qRT-PCR检测第30-33页
3 结果分析第33-63页
   ·CcIAA基因全长克隆第33-40页
     ·山核桃总RNA电泳分析第33页
     ·CcIAA基因的RACE扩增结果第33-35页
     ·序列分析第35-40页
       ·CcIAA的氨基酸组成及理化性质第35-36页
       ·CcIAA跨膜分析第36页
       ·CcIAA基因同源性的分析和构建系统进化树第36-40页
   ·CcIAA基因在转录水平的表达分析第40-45页
     ·不同嫁接时期山核桃茎的总RNA第40-41页
     ·不同激素处理条件下CcIAA基因在山核桃嫁接不同时期的表达分析第41-45页
   ·CcIAA基因在翻译水平上的表达分析第45-47页
   ·山核桃嫁接相关miRNA分析第47-63页
     ·山核桃嫁接相关miRNA序列的基本情况第47-50页
     ·山核桃嫁接过程中中保守miRNA的分析第50-52页
     ·山核桃中新miRNA分析第52-54页
     ·山核桃嫁接不同时期miRNA的差异性表达分析第54-58页
     ·山核桃miRNA靶基因预测以及表达模式第58-63页
4 讨论第63-67页
5 结论与展望第67-69页
参考文献第69-74页
附录第74-75页
作者简介及在学成果第75-76页
致谢第76页

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