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低温胁迫下凹叶厚朴差减文库的构建及ESTs序列分析

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
1 综述第12-19页
   ·凹叶厚朴抗寒相关研究第12页
   ·低温胁迫对植物分子机理的影响第12-14页
     ·调控基因第13页
     ·保护基因第13-14页
   ·SSH差减文库构建原理介绍第14-17页
     ·差减文库构建流程第14-16页
     ·SSH技术的优缺点第16-17页
     ·SSH差减文库构建技术与其他技术的对比第17页
   ·论文的研究背景第17-18页
   ·论文的研究意义第18-19页
2 凹叶厚朴抗寒基因差减文库的构建及荧光定量pcr的验证第19-35页
   ·材料准备第19-21页
     ·植物材料第19页
     ·主要仪器耗材第19页
     ·试剂盒第19页
     ·试验试剂第19-20页
     ·主要试剂的配制与处理第20页
     ·差减杂交引物序列第20-21页
   ·实验方法第21-22页
     ·电导率与logistic方程测定凹叶厚朴的半致死温度第21-22页
     ·数据处理第22页
   ·总RNA的提取第22-23页
     ·植物顶芽的处理第22页
     ·Trizol法提取凹叶厚朴顶芽总RNA第22-23页
     ·RNA质量、纯度检测第23页
   ·凹叶厚朴顶芽cDNA的合成第23-25页
     ·第一链cDNA的合成第23-24页
     ·dscDNA的合成第24-25页
     ·Rsal酶切第25页
   ·cDNA的差减杂交第25-30页
     ·低温胁迫凹叶厚朴酶切dscDNA(Testerds cDNA)两端接头的连接第26页
     ·分析接头连接效率第26-27页
     ·第一次杂交(FirstHybridization)第27页
     ·第二次杂交(SecondHybridization)第27-28页
     ·第一次抑制性PCR扩增(primerPCR)第28-29页
     ·第二次巢式抑制PCR扩增(NestedPCR)第29页
     ·消减效率检测第29-30页
     ·PCR产物的纯化第30页
   ·消减文库生成第30-32页
     ·载体连接第30-31页
     ·连接产物的电转第31页
     ·cDNA文库条带质量检测第31-32页
   ·ESTs测序与分析第32-33页
     ·ESTs测序第32页
     ·ESTs序列的初步处理第32页
     ·ESTs序列的分析第32-33页
   ·荧光定量PCR第33-35页
3 结果与分析第35-52页
   ·半致死温度测定结果第35-36页
     ·相对电导率第35页
     ·Logistic回归模型的建立及低温半致死温度的确定第35-36页
   ·cDNA的合成结果第36-38页
     ·RNA提取结果第36-37页
     ·双链cDNA的合成第37-38页
   ·差减文库的构建结果第38-42页
     ·双链cDNA(dscDNA)的酶切第38-39页
     ·接头连接效率分析结果第39页
     ·消减产物两次PCR结果第39-40页
     ·消减效率检测第40页
     ·文库质量评价第40-41页
     ·EST长度统计第41-42页
   ·测序数据的处理结果第42-48页
     ·ESTs长度统计及片段拼接第42页
     ·三次重复实验NCBI蛋白数据库注释结果第42-43页
     ·第二次片段拼接第43页
     ·unigene-3在NCBI蛋白数据库注释结果第43-44页
     ·GO功能分类第44-47页
     ·推定可能在逆境环境中有响应的基因第47-48页
   ·荧光定量pcr结果第48-52页
     ·RNA提取第48-49页
     ·基因开放读码框架第49-50页
     ·不同温度处理下的凹叶厚朴基因表达量第50-52页
4 结论与讨论第52-56页
   ·讨论第52-54页
     ·文库构建注意事项第52页
     ·两种cDNA合成方法的比较第52-53页
     ·分离得到的抗寒基因评价第53-54页
   ·结论第54-56页
     ·电导率的测定第54页
     ·RNA的提取及cDNA的合成第54页
     ·差减文库的构建第54-55页
     ·EST序列的统计分析第55页
     ·基因的差异表达第55-56页
参考文献第56-59页
缩略词(Abbreviation)第59-61页
附表1 基因NCBI蛋白数据库注释结果(共计60个基因)第61-65页
附图1 推定基因的开放读码框序列及基因的结构域图第65-77页
附表2 GO term第77-83页
附图2 供试植物凹叶厚朴第83-85页
致谢第85页

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