摘要 | 第1-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
1 综述 | 第12-19页 |
·凹叶厚朴抗寒相关研究 | 第12页 |
·低温胁迫对植物分子机理的影响 | 第12-14页 |
·调控基因 | 第13页 |
·保护基因 | 第13-14页 |
·SSH差减文库构建原理介绍 | 第14-17页 |
·差减文库构建流程 | 第14-16页 |
·SSH技术的优缺点 | 第16-17页 |
·SSH差减文库构建技术与其他技术的对比 | 第17页 |
·论文的研究背景 | 第17-18页 |
·论文的研究意义 | 第18-19页 |
2 凹叶厚朴抗寒基因差减文库的构建及荧光定量pcr的验证 | 第19-35页 |
·材料准备 | 第19-21页 |
·植物材料 | 第19页 |
·主要仪器耗材 | 第19页 |
·试剂盒 | 第19页 |
·试验试剂 | 第19-20页 |
·主要试剂的配制与处理 | 第20页 |
·差减杂交引物序列 | 第20-21页 |
·实验方法 | 第21-22页 |
·电导率与logistic方程测定凹叶厚朴的半致死温度 | 第21-22页 |
·数据处理 | 第22页 |
·总RNA的提取 | 第22-23页 |
·植物顶芽的处理 | 第22页 |
·Trizol法提取凹叶厚朴顶芽总RNA | 第22-23页 |
·RNA质量、纯度检测 | 第23页 |
·凹叶厚朴顶芽cDNA的合成 | 第23-25页 |
·第一链cDNA的合成 | 第23-24页 |
·dscDNA的合成 | 第24-25页 |
·Rsal酶切 | 第25页 |
·cDNA的差减杂交 | 第25-30页 |
·低温胁迫凹叶厚朴酶切dscDNA(Testerds cDNA)两端接头的连接 | 第26页 |
·分析接头连接效率 | 第26-27页 |
·第一次杂交(FirstHybridization) | 第27页 |
·第二次杂交(SecondHybridization) | 第27-28页 |
·第一次抑制性PCR扩增(primerPCR) | 第28-29页 |
·第二次巢式抑制PCR扩增(NestedPCR) | 第29页 |
·消减效率检测 | 第29-30页 |
·PCR产物的纯化 | 第30页 |
·消减文库生成 | 第30-32页 |
·载体连接 | 第30-31页 |
·连接产物的电转 | 第31页 |
·cDNA文库条带质量检测 | 第31-32页 |
·ESTs测序与分析 | 第32-33页 |
·ESTs测序 | 第32页 |
·ESTs序列的初步处理 | 第32页 |
·ESTs序列的分析 | 第32-33页 |
·荧光定量PCR | 第33-35页 |
3 结果与分析 | 第35-52页 |
·半致死温度测定结果 | 第35-36页 |
·相对电导率 | 第35页 |
·Logistic回归模型的建立及低温半致死温度的确定 | 第35-36页 |
·cDNA的合成结果 | 第36-38页 |
·RNA提取结果 | 第36-37页 |
·双链cDNA的合成 | 第37-38页 |
·差减文库的构建结果 | 第38-42页 |
·双链cDNA(dscDNA)的酶切 | 第38-39页 |
·接头连接效率分析结果 | 第39页 |
·消减产物两次PCR结果 | 第39-40页 |
·消减效率检测 | 第40页 |
·文库质量评价 | 第40-41页 |
·EST长度统计 | 第41-42页 |
·测序数据的处理结果 | 第42-48页 |
·ESTs长度统计及片段拼接 | 第42页 |
·三次重复实验NCBI蛋白数据库注释结果 | 第42-43页 |
·第二次片段拼接 | 第43页 |
·unigene-3在NCBI蛋白数据库注释结果 | 第43-44页 |
·GO功能分类 | 第44-47页 |
·推定可能在逆境环境中有响应的基因 | 第47-48页 |
·荧光定量pcr结果 | 第48-52页 |
·RNA提取 | 第48-49页 |
·基因开放读码框架 | 第49-50页 |
·不同温度处理下的凹叶厚朴基因表达量 | 第50-52页 |
4 结论与讨论 | 第52-56页 |
·讨论 | 第52-54页 |
·文库构建注意事项 | 第52页 |
·两种cDNA合成方法的比较 | 第52-53页 |
·分离得到的抗寒基因评价 | 第53-54页 |
·结论 | 第54-56页 |
·电导率的测定 | 第54页 |
·RNA的提取及cDNA的合成 | 第54页 |
·差减文库的构建 | 第54-55页 |
·EST序列的统计分析 | 第55页 |
·基因的差异表达 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-59页 |
缩略词(Abbreviation) | 第59-61页 |
附表1 基因NCBI蛋白数据库注释结果(共计60个基因) | 第61-65页 |
附图1 推定基因的开放读码框序列及基因的结构域图 | 第65-77页 |
附表2 GO term | 第77-83页 |
附图2 供试植物凹叶厚朴 | 第83-85页 |
致谢 | 第85页 |