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亚硝酸细菌的快速检测及荧光定量PCR检测试剂盒的创建

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第1章 绪论第13-27页
   ·益生菌概述第13-14页
     ·益生菌特性第13页
     ·水产养殖中益生菌作用第13页
     ·常作用于养殖水体的益生菌种类第13-14页
     ·益生菌快速检测研究现状第14页
     ·益生菌快速检测发展方向第14页
   ·亚硝酸细菌概述第14-16页
     ·亚硝酸细菌的系统发育第14-15页
     ·亚硝酸细菌在养殖水域的作用第15页
     ·亚硝酸细菌快速检测的研究现状第15-16页
     ·亚硝酸细菌快速检测的发展方向及展望第16页
   ·氨单加氧酶(Ammonia Monooxygenase,AMO)概述第16-18页
     ·氨单加氧酶(AMO)作用机理第17页
     ·氨单加氧酶(AMO)基本特性第17页
     ·亚硝酸细菌作用机理第17页
     ·氨单加氧酶编码基因(amo A)概述第17-18页
     ·氨单加氧酶编码基因(amo A)在亚硝酸细菌种群研究上的应用第18页
   ·实时荧光定量PCR检测技术概述第18-26页
     ·实时荧光定量PCR检测技术原理第19页
     ·实时荧光定量PCR检测方法的种类第19-23页
     ·实时荧光定量PCR检测技术的特点第23-24页
     ·实时荧光定量PCR检测技术的定量方法第24-25页
     ·实时荧光定量PCR检测技术的应用第25页
     ·实时荧光定量PCR检测技术存在的问题及应用前景第25-26页
   ·本文的研究目的和意义第26-27页
第2章 建立海科贝特氏菌(Cobetia marina)amo A基因实时荧光定量PCR检测体系第27-43页
   ·前言第27-28页
   ·实验材料第28-31页
     ·实验菌种的活化和扩培第28-29页
     ·实验试剂第29-30页
     ·实验仪器第30页
     ·LB培养基配制第30-31页
   ·实验方法第31-37页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取第31-32页
       ·海科贝特氏菌总DNA的提取第31页
       ·海科贝特氏菌总DNA的检测第31-32页
     ·海科贝特氏菌amo A基因全长的克隆第32-35页
       ·amo A基因全长引物设计第32页
       ·amo A全基因片段扩增第32-33页
       ·amo A基因PCR产物回收纯化第33-34页
       ·amo A基因PCR产物的连接转化及标准阳性模板的制备第34-35页
     ·建立海科贝特氏菌amo A基因片段实时荧光定量PCR检测体系第35-37页
       ·amo A基因片段特异性荧光定量PCR引物的设计第35-36页
       ·普通PCR对amo A基因片段特异性荧光定量PCR引物的检验第36页
       ·荧光定量PCR反应体系第36页
       ·制作标准曲线检验PCR扩增效率第36页
       ·海科贝特氏菌amo A基因片段特异性荧光定量PCR第36-37页
   ·实验结果第37-41页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取第37页
     ·海科贝特氏菌amo A基因全长的克隆第37-38页
     ·普通PCR对amo A基因片段特异性荧光定量PCR引物的检验第38-39页
     ·海科贝特氏菌amo A基因实时荧光定量PCR检测体系的建立第39-41页
   ·讨论第41-43页
     ·荧光定量PCR在基因表达分析上的优势第41页
     ·标准曲线的建立第41-42页
     ·海科贝特氏菌amo A基因实时荧光定量PCR检测体系的建立第42-43页
第3章 组装海科贝特氏菌(Cobetia marina)amo A基因实时荧光定量PCR检测试剂盒第43-51页
   ·前言第43页
   ·实验材料第43-44页
     ·实验细菌第43页
     ·实验试剂第43-44页
     ·实验仪器第44页
   ·实验方法第44-46页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取与检测第44页
       ·海科贝特氏菌总DNA的提取第44页
       ·海科贝特氏菌总DNA的检测第44页
     ·实时荧光定量PCR检测试剂盒的组装第44-46页
       ·试剂盒的组成第44-45页
       ·试剂盒的操作使用第45页
       ·试剂盒的结果判定第45页
       ·标准曲线的建立第45-46页
     ·实时荧光定量PCR检测试剂盒反应条件的优选第46页
       ·特异性引物用量的优选第46页
       ·反应退火温度的优选第46页
   ·实验结果第46-49页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取与检测第46-47页
     ·实时荧光定量PCR检测试剂盒的组装第47-48页
     ·特异性引物浓度的优选第48页
     ·反应退火温度的优选第48-49页
   ·讨论第49-51页
第4章 海科贝特氏菌(Cobetia marina)amo A基因实时荧光定量PCR检测试剂盒各项指标的检测第51-62页
   ·前言第51页
   ·实验材料第51-52页
     ·实验细菌第51页
     ·实验试剂第51-52页
     ·实验仪器第52页
   ·实验方法第52-53页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取与检测第52页
       ·海科贝特氏菌总DNA的提取第52页
       ·海科贝特氏菌总DNA的检测第52页
     ·试剂盒特异性检测第52页
     ·试剂盒灵敏度检测第52-53页
       ·阳性标准品梯度检测第52-53页
       ·菌液梯度检测第53页
     ·试剂盒重复性检测第53页
     ·试剂盒稳定性检测第53页
     ·确定试剂盒保存期第53页
   ·实验结果第53-60页
     ·海科贝特氏菌总DNA的提取与检测第53-54页
     ·试剂盒特异性检测第54-55页
     ·试剂盒灵敏度检测第55-58页
       ·阳性标准品梯度检测第55-56页
       ·菌液梯度检测第56-58页
     ·试剂盒重复性检测第58-59页
     ·试剂盒稳定性检测第59-60页
   ·讨论第60-62页
第5章 结论第62-63页
参考文献第63-70页
攻读学位期间发表的论文目录第70-73页
致谢第73页

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