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利用外显子捕获测序技术筛选及验证肝癌相关突变基因

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
缩略词表第9-11页
第一章 前言第11-18页
   ·肝癌的现状第11-12页
   ·全基因组测序简介第12-13页
   ·全外显子组测序简介第13-16页
   ·外显子测序在揭示基因遗传变异中的应用第16页
   ·本实验研究背景第16-18页
第二章 材料与方法第18-31页
   ·试验材料和试剂第18-20页
     ·试验仪器第18-19页
     ·生化试剂第19-20页
   ·实验方法第20-31页
     ·细胞培养第20-21页
     ·细胞冻存、复苏及传代第21页
     ·肝癌组织标本的获得与处理第21页
     ·组织DNA提取第21-22页
     ·PCR扩增第22页
     ·文库构建,外显子捕获及测序第22-23页
     ·测序数据分析第23页
     ·基于PCR反应的Sanger测序第23页
     ·RNA干扰筛选第23-25页
     ·质粒转染及克隆形成第25页
     ·细胞裂解及蛋白定量第25页
     ·蛋白印迹(Western Blot)第25-27页
     ·transwell实验第27页
     ·细胞RNA抽提第27页
     ·组织RNA抽提第27-28页
     ·半定量PCR第28-29页
     ·实时定量PCR第29页
     ·软琼脂克隆形成实验第29-30页
     ·细胞凋亡分析第30-31页
第三章 实验结果与讨论第31-66页
   ·实验室前期研究发现的体细胞突变进行分析第31-33页
   ·Sanger测序法对381个候选突变进行验证第33-35页
   ·PVTT中的体细胞突变第35-43页
   ·突变基因所参与的信号通路第43-47页
   ·肝细胞癌形成的潜在驱动基因第47-54页
   ·重要基因在肝细胞癌中作用的研究第54-58页
   ·TMEM35基因表达对肝癌细胞生长及细胞周期的影响第58-64页
     ·人TMEM35基因编码四跨膜蛋白第59页
     ·TMEM35在肝癌病例中表达紊乱第59-60页
     ·RNA干扰TMEM35基因表达抑制肝癌细胞生长第60-61页
     ·RNA干扰TMEM35基因表达影响细胞周期第61-62页
     ·TMEM35蛋白预测的功能搭档第62-64页
   ·讨论第64-66页
参考文献第66-71页
致谢第71页

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