中文摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-13页 |
引言 | 第13-14页 |
1. 文献综述及研究内容 | 第14-33页 |
·种群遗传多样性对海拔变化响应的研究概况 | 第14-18页 |
·单核苷酸位点(SNP)开发应用的研究概况 | 第18-21页 |
·全基因组关联分析(GWAS)的研究概况 | 第21-25页 |
·表型可塑性的研究概况 | 第25-29页 |
·藏川杨的研究概况及杨属物种的最近进展 | 第29-31页 |
·立题依据与技术路线 | 第31-33页 |
2. 色季拉山不同海拔生长的藏川杨遗传多样性研究 | 第33-48页 |
·材料与方法 | 第33-37页 |
·样品收集 | 第33-34页 |
·DNA提取及引物筛选 | 第34-35页 |
·SSR引物的筛选 | 第35-36页 |
·SSR扩增 | 第36页 |
·数据分析 | 第36-37页 |
·结果与分析 | 第37-41页 |
·引物筛选 | 第37-38页 |
·群体遗传多样性 | 第38-39页 |
·标记的中性检验 | 第39页 |
·群体遗传结构 | 第39-41页 |
·小结 | 第41-48页 |
3. 基于群体的藏川杨单核苷酸多态性位点(SNP)检测 | 第48-62页 |
·材料与方法 | 第49-51页 |
·实验材料 | 第49页 |
·DNA质量的检测 | 第49页 |
·内切酶的选择和接头拼接 | 第49-50页 |
·测序文库的准备 | 第50页 |
·原始数据的过滤 | 第50-51页 |
·数据比对 | 第51页 |
·结果与分析 | 第51-60页 |
·测样样本基因组DNA的制备 | 第51-54页 |
·read的数据和质量 | 第54-56页 |
·SNP 位点 | 第56-59页 |
·群体分析 | 第59-60页 |
·群体聚类结果分析 | 第60页 |
·小结 | 第60-62页 |
4. 不同海拔种植的藏川杨群体表型性状比较 | 第62-82页 |
·实验材料与方法 | 第62-63页 |
·实验群体的描述 | 第62-63页 |
·表型性状的观测 | 第63页 |
·数据的统计与分析结果 | 第63-81页 |
·测量群体 | 第63-64页 |
·各性状数据的分布检测 | 第64-67页 |
·各性状的相关性分析 | 第67-72页 |
·栽植与不同海拔实验点的藏川杨的表型比较 | 第72-73页 |
·不同处理间的差异分析 | 第73-76页 |
·表型可塑性模型的设计 | 第76-81页 |
·小结 | 第81-82页 |
5. 苗期藏川杨生长性状的SNP关联分析 | 第82-101页 |
·实验材料和方法 | 第83-86页 |
·实验材料 | 第83页 |
·实验材料基因型数据的获得 | 第83页 |
·实验方法 | 第83-86页 |
·关联结果 | 第86-100页 |
·Fgwas 2.0 | 第86-91页 |
·PLINK | 第91-100页 |
·小结 | 第100-101页 |
6. 讨论 | 第101-104页 |
·不同海拔藏川杨群体的遗传多样性 | 第101页 |
·藏川杨群体的SNP标记开发 | 第101-102页 |
·不同海拔群体与不同海拔栽植点正交设计的表型分析 | 第102-103页 |
·各表型的SNP关联分析 | 第103-104页 |
7. 主要结论及展望 | 第104-106页 |
·主要结论 | 第104-105页 |
·未来研究展望 | 第105-106页 |
参考文献 | 第106-115页 |
个人简介 | 第115-117页 |
导师简介 | 第117-119页 |
发表文章 | 第119-121页 |
致谢 | 第121-122页 |