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不同海拔藏川杨遗传多样性评估及苗期表型关联分析

中文摘要第1-7页
Abstract第7-13页
引言第13-14页
1. 文献综述及研究内容第14-33页
     ·种群遗传多样性对海拔变化响应的研究概况第14-18页
     ·单核苷酸位点(SNP)开发应用的研究概况第18-21页
     ·全基因组关联分析(GWAS)的研究概况第21-25页
     ·表型可塑性的研究概况第25-29页
     ·藏川杨的研究概况及杨属物种的最近进展第29-31页
     ·立题依据与技术路线第31-33页
2. 色季拉山不同海拔生长的藏川杨遗传多样性研究第33-48页
   ·材料与方法第33-37页
     ·样品收集第33-34页
     ·DNA提取及引物筛选第34-35页
     ·SSR引物的筛选第35-36页
     ·SSR扩增第36页
     ·数据分析第36-37页
   ·结果与分析第37-41页
     ·引物筛选第37-38页
     ·群体遗传多样性第38-39页
     ·标记的中性检验第39页
     ·群体遗传结构第39-41页
   ·小结第41-48页
3. 基于群体的藏川杨单核苷酸多态性位点(SNP)检测第48-62页
   ·材料与方法第49-51页
     ·实验材料第49页
     ·DNA质量的检测第49页
     ·内切酶的选择和接头拼接第49-50页
     ·测序文库的准备第50页
     ·原始数据的过滤第50-51页
     ·数据比对第51页
   ·结果与分析第51-60页
     ·测样样本基因组DNA的制备第51-54页
     ·read的数据和质量第54-56页
     ·SNP 位点第56-59页
     ·群体分析第59-60页
     ·群体聚类结果分析第60页
   ·小结第60-62页
4. 不同海拔种植的藏川杨群体表型性状比较第62-82页
   ·实验材料与方法第62-63页
     ·实验群体的描述第62-63页
     ·表型性状的观测第63页
   ·数据的统计与分析结果第63-81页
     ·测量群体第63-64页
     ·各性状数据的分布检测第64-67页
     ·各性状的相关性分析第67-72页
     ·栽植与不同海拔实验点的藏川杨的表型比较第72-73页
     ·不同处理间的差异分析第73-76页
     ·表型可塑性模型的设计第76-81页
   ·小结第81-82页
5. 苗期藏川杨生长性状的SNP关联分析第82-101页
   ·实验材料和方法第83-86页
     ·实验材料第83页
     ·实验材料基因型数据的获得第83页
     ·实验方法第83-86页
   ·关联结果第86-100页
     ·Fgwas 2.0第86-91页
     ·PLINK第91-100页
   ·小结第100-101页
6. 讨论第101-104页
   ·不同海拔藏川杨群体的遗传多样性第101页
   ·藏川杨群体的SNP标记开发第101-102页
   ·不同海拔群体与不同海拔栽植点正交设计的表型分析第102-103页
   ·各表型的SNP关联分析第103-104页
7. 主要结论及展望第104-106页
   ·主要结论第104-105页
   ·未来研究展望第105-106页
参考文献第106-115页
个人简介第115-117页
导师简介第117-119页
发表文章第119-121页
致谢第121-122页

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