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利用mtDNA探究鲭科系统进化关系与鲣(Katsuwonus pelamis)分子系统地理学

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
目录第8-11页
第一章 引言第11-22页
   ·鲭科的分类地位与生物学特性第11-13页
     ·鲭科分类地位简介第11-12页
     ·鲭科鱼类的形态学特征第12-13页
   ·羽鳃鲐的生物学特性与研究概况第13-14页
     ·羽鳃鲐的生物学特性第13-14页
     ·羽鳃鲐的研究现状第14页
   ·鲣鱼的生物学多样性与研究概况第14-16页
     ·鲣鱼生物学特性与经济价值第14-15页
     ·鲣鱼的研究现状第15-16页
   ·鱼类 mtDNA 的研究进展第16-20页
     ·鱼类线粒体基因组结构第16-17页
     ·鱼类线粒体基因组的特征第17-18页
     ·线粒体基因的应用第18-20页
     ·鱼类线粒体基因的展望第20页
   ·本研究的目的与意义第20-22页
     ·研究目的第20页
     ·研究方案第20-21页
     ·研究意义第21-22页
第二章 羽鳃鲐线粒体全基因组的扩增和结构特征第22-34页
   ·材料与方法第22-26页
     ·实验材料试剂及仪器第22页
     ·实验试剂及仪器设备第22-23页
     ·总 DNA 的提取第23-24页
     ·引物设计与 PCR 扩增第24-25页
     ·序列拼接与分析第25-26页
   ·实验结果第26-31页
     ·DNA 提取第26页
     ·线粒体基因组的一般结构与碱基组成第26-28页
     ·蛋白质编码序列第28-29页
     ·tRNA 和核糖体 RNA第29-30页
     ·非编码区序列第30-31页
   ·讨论第31-34页
     ·线粒体基因组序列测序技术的探讨第31-32页
     ·羽鳃鲐线粒体基因组的一般特征第32-33页
     ·羽鳃鲐线粒体基因组氨基酸利用率分析第33-34页
第三章 鲭科鱼类线粒体基因组的系统进化信息分析第34-48页
   ·材料与方法第34-36页
     ·mtDNA 基因组序列的获取与分类第34-35页
     ·线粒体蛋白质编码基因的结构和碱基含量分析第35页
     ·系统进化分析的适用性第35-36页
   ·结果与分析第36-45页
     ·序列的基本特征与遗传距离分析第36-37页
     ·蛋白质编码基因碱基突变分析第37-39页
     ·基于线粒体全序列和 13 个蛋白拼接序列的系统进化分析第39-42页
     ·基于各蛋白序列的系统进化分析第42-45页
   ·讨论第45-48页
     ·分类阶元系统进化分析的 mtDNA 基因选择第45-46页
     ·序列长度对系统进化分析的影响第46-48页
第四章 8 个鲣鱼群体 Cytb 基因序列的测定及群体遗传多样性分析第48-66页
   ·材料与方法第48-50页
     ·样本采集第48-49页
     ·鲣鱼总 DNA 的提取第49页
     ·线粒体 Cytb 基因 PCR 扩增与测序第49页
     ·数据分处理与分析第49-50页
   ·实验结果第50-63页
     ·DNA 的提取第50页
     ·Cytb 基因的特征第50-55页
     ·系统进化与遗传距离分析第55-59页
     ·遗传多样性分析和中性检验第59-60页
     ·分子方差分析(AMOVA)第60-62页
     ·鲣鱼的种群历史分析第62-63页
   ·讨论第63-66页
     ·系统发生关系第63-64页
     ·遗传多样性第64页
     ·种群结构与遗传分化第64-66页
第五章 8 个鲣鱼群体 D-loop 序列的测定及群体遗传多样性分析第66-83页
   ·材料与方法第66-67页
     ·样本采集第66页
     ·鲣鱼总 DNA 的提取第66页
     ·线粒体 D-loop 基因 PCR 扩增与测序第66-67页
     ·数据分处理与分析第67页
   ·实验结果第67-80页
     ·DNA 的提取第67页
     ·D-loop 基因的特征第67-72页
     ·系统进化与遗传距离分析第72-76页
     ·遗传多样性分析和中性检验第76-77页
     ·分子方差分析(AMOVA)第77-79页
     ·鲣鱼的种群历史分析第79-80页
   ·讨论第80-83页
     ·系统发生关系第81页
     ·遗传多样性第81页
     ·种群结构与遗传分化第81-82页
     ·序列片段与群体遗传第82-83页
小结第83-84页
参考文献第84-91页
附录第91-98页
 1 附图第91-96页
 2 在学期间的科研情况第96-98页
   ·参加的课题第96页
   ·论文发表情况第96-98页
致谢第98页

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