猪全基因组拷贝数变异草图构建及体尺性状全基因组关联分析
| 附件 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| ·拷贝数变异研究进展 | 第13-21页 |
| ·CNV 的形成机制 | 第14-16页 |
| ·CNV 的作用机制 | 第16-17页 |
| ·CNV 的检测方法 | 第17-19页 |
| ·CNV 在动物中的研究 | 第19-21页 |
| ·全基因组关联分析 | 第21-28页 |
| ·GWAS 的基础 | 第21-24页 |
| ·GWAS 样本量大小 | 第24-25页 |
| ·GWAS 试验设计 | 第25页 |
| ·GWAS 统计分析方法 | 第25-26页 |
| ·GWAS 在家畜中的研究进展 | 第26-28页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-41页 |
| ·试验材料 | 第29-32页 |
| ·试验动物 | 第29页 |
| ·组织样品的采集 | 第29页 |
| ·主要试剂及溶液配制 | 第29-32页 |
| ·试验方法 | 第32-41页 |
| ·试验技术路线 | 第32页 |
| ·猪全基因组 DNA 的提取与检测 | 第32-33页 |
| ·SNP 基因型判定 | 第33-34页 |
| ·芯片数据预处理 | 第34-35页 |
| ·全基因组 CNV 的检测 | 第35页 |
| ·Q-PCR 验证 | 第35-37页 |
| ·CNVR 包括的基因及基因功能分析 | 第37-38页 |
| ·体型性状的全基因关联分析 | 第38-41页 |
| 第三章 结果与分析 | 第41-71页 |
| ·质控结果 | 第41-42页 |
| ·猪 CNV 推断结果 | 第42-56页 |
| ·不同方法推断 CNV 结果 | 第42页 |
| ·猪全基因组 CNVR 图谱构建结果 | 第42-53页 |
| ·QPCR 验证结果 | 第53-54页 |
| ·猪 CNVR 包括的基因及基因功能 | 第54-56页 |
| ·全基因组关联分析结果 | 第56-71页 |
| ·体尺性状的描述性统计分析 | 第56-57页 |
| ·九个指标 GWAS 结果 | 第57-69页 |
| ·群体分层分析结果 | 第69-71页 |
| 第四章 讨论 | 第71-80页 |
| ·试验动物 | 第71页 |
| ·基因组 SNP 分型的质量控制 | 第71页 |
| ·全基因组 CNV 推断方法及结果 | 第71-78页 |
| ·CNV 推测的效率和准确性 | 第71-72页 |
| ·部分 CNV 区域功能 | 第72-78页 |
| ·全基因组关联分析 | 第78-79页 |
| ·GWAS 分析显著性位点上的基因及功能 | 第78页 |
| ·群体分层 | 第78-79页 |
| ·下一步工作 | 第79-80页 |
| 第五章 全文结论 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-94页 |
| 附录 | 第94-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 作者简历 | 第100页 |
