| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第一部分 前言 | 第12-22页 |
| 1 线粒体基因组结构 | 第12-15页 |
| ·动物线粒体及线粒体基因组简介 | 第12-13页 |
| ·线粒体基因组的基因排列顺序 | 第13-15页 |
| 2 昆虫纲及直翅目昆虫线粒体基因组测序现状 | 第15页 |
| 3 直翅目昆虫线粒体基因组及系统发育研究进展 | 第15-18页 |
| ·直翅目昆虫线粒体基因组组成及特征 | 第15-16页 |
| ·直翅目昆虫系统发育研究进展 | 第16-17页 |
| ·斑腿蝗科与斑翅蝗科的系统发育研究进展 | 第17-18页 |
| 4 研究物种简介 | 第18-20页 |
| ·长翅素木蝗简介 | 第18-19页 |
| ·短角外斑腿蝗简介 | 第19页 |
| ·花胫绿纹蝗简介 | 第19-20页 |
| ·疣蝗简介 | 第20页 |
| 5 研究目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第22-36页 |
| 1 实验材料 | 第22-24页 |
| ·标本的采集、保存与鉴定 | 第22页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第22-24页 |
| 2 实验方法 | 第24-29页 |
| ·总DNA提取及检测 | 第24-25页 |
| ·PCR引物设计 | 第25-27页 |
| ·PCR扩增的体系和条件 | 第27-29页 |
| ·PCR产物测序 | 第29页 |
| 3 原始数据处理 | 第29-30页 |
| ·全线粒体基因组序列拼接 | 第29页 |
| ·线粒体基因组全序列的基因定位及注释 | 第29页 |
| ·线粒体全基因组的组成分析 | 第29-30页 |
| ·4种蝗虫线粒体基因组RNA二级结构预测 | 第30页 |
| 4 基于线粒体全基因组的直翅目昆虫系统发育分析 | 第30-36页 |
| ·序列数据来源 | 第30-33页 |
| ·序列比对及组成特征 | 第33页 |
| ·系统发育信号检验及模型选择 | 第33-34页 |
| ·不同系统发生树的构建 | 第34-36页 |
| 第三部分 实验结果 | 第36-40页 |
| 1 4物种总DNA提取结果 | 第36页 |
| 2 L-PCR扩增及纯化结果 | 第36-37页 |
| 3 Sub-PCR扩增及纯化结果 | 第37-38页 |
| 4 序列的拼接 | 第38-40页 |
| 第四部分 直翅目4种蝗虫全线粒体基因组组成分析 | 第40-76页 |
| 1 长翅素木蝗的线粒体基因组的组成及分析 | 第40-49页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第40-42页 |
| ·基因间隔区与重叠区 | 第42页 |
| ·全基因组碱基组成特征 | 第42页 |
| ·蛋白质编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第42-44页 |
| ·tRNA二级结构预测 | 第44-46页 |
| ·rRNA二级结构预测 | 第46页 |
| ·控制区 | 第46-49页 |
| 2 短角外斑腿蝗的线粒体基因组的组成及分析 | 第49-58页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第49-51页 |
| ·基因间隔区与重叠区 | 第51页 |
| ·全基因组碱基组成特征 | 第51页 |
| ·蛋白质编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第51-53页 |
| ·tRNA二级结构预测 | 第53-55页 |
| ·rRNA二级结构预测 | 第55页 |
| ·控制区分析 | 第55-58页 |
| 3 花胫绿纹蝗的线粒体基因组的组成及分析 | 第58-67页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第58-60页 |
| ·基因间隔区与重叠区 | 第60页 |
| ·全基因组碱基组成特征 | 第60页 |
| ·蛋白质编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第60-62页 |
| ·tRNA二级结构预测 | 第62-64页 |
| ·rRNA二级结构预测 | 第64页 |
| ·控制区分析 | 第64-67页 |
| 4 疣蝗的线粒体基因组的组成及分析 | 第67-76页 |
| ·基因组结构与基因顺序 | 第67-69页 |
| ·基因间隔区与重叠区 | 第69页 |
| ·全基因组碱基组成特征 | 第69页 |
| ·蛋白质编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第69-71页 |
| ·tRNA二级结构预测 | 第71-73页 |
| ·rRNA二级结构预测 | 第73页 |
| ·控制区分析 | 第73-76页 |
| 第五部分 线粒体基因组比较分析及讨论 | 第76-82页 |
| 1 53种线粒体基因组的基因排序比较 | 第76页 |
| 2 53种线粒体基因组的基本组成特征比较 | 第76-77页 |
| ·线粒体基因组碱基组成及偏向性 | 第76-77页 |
| ·线粒体基因组的间隔区和重叠区的比较 | 第77页 |
| 3 53种线粒体基因组蛋白质编码基因的比较 | 第77-79页 |
| ·线粒体基因组蛋白质编码基因密码子比较 | 第77-78页 |
| ·线粒体基因组蛋白质编码基因的氨基酸组成 | 第78-79页 |
| 4 线粒体基因组tRNA二级结构的比较 | 第79页 |
| 5 线粒体基因组rRNA二级结构的比较 | 第79-82页 |
| 第六部分 直翅目昆虫线粒体谱系基因组学分析 | 第82-102页 |
| 1 系统发生数据集及组成分析 | 第82-83页 |
| 2 碱基替换饱和性分析 | 第83-84页 |
| 3 g1检验与PTP检验 | 第84页 |
| 4 直翅目昆虫的遗传距离分析 | 第84-85页 |
| 5 直翅目不同数据集构建的系统树分析 | 第85-94页 |
| ·线粒体全基因组(37genes数据集)构建的系统树 | 第86-88页 |
| ·蛋白质编码基因(13PCGs)构建的系统树 | 第88-90页 |
| ·2个rRNA(2rRNA)构建的系统树 | 第90-92页 |
| ·去掉密码子第三位点的PCG数据集构建的系统树 | 第92-94页 |
| 6 讨论 | 第94-102页 |
| ·直翅目昆虫mtDNA基因序列数据集系统发育关系分析和讨论 | 第94页 |
| ·mtDNA的不同数据集对蝗总科内部系统发育关系的研究 | 第94-97页 |
| ·不同数据集不同建树方法结果的比较 | 第97-102页 |
| 结论 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-116页 |
| 致谢 | 第116-118页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第118页 |
