| 缩略词表 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-21页 |
| 1．结核病简介 | 第12-13页 |
| 2．非编码 RNA 概述 | 第13-15页 |
| ·非编码 RNA 的种类及功能 | 第13-14页 |
| ·非编码 RNA 的发现方法 | 第14-15页 |
| 3．细菌非编码 RNA 概述 | 第15-19页 |
| 4．本论文的选题与研究目的 | 第19-21页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第21-40页 |
| 1. 实验材料 | 第21-28页 |
| ·菌株 | 第21页 |
| ·试剂和材料 | 第21-23页 |
| ·培养基和溶液 | 第23-26页 |
| ·试剂盒 | 第26-27页 |
| ·实验仪器 | 第27-28页 |
| 2. 实验方法 | 第28-40页 |
| ·结核分枝杆菌总 RNA 的提取 | 第28-29页 |
| ·总 RNA 去除 DNA 污染 | 第29页 |
| ·总 RNA 去除 rRNA | 第29-30页 |
| ·RNA 的质量检测 | 第30-31页 |
| ·构建 RNA 测序文库 | 第31-34页 |
| ·文库测序及数据分析 | 第34-35页 |
| ·Northern blot | 第35-37页 |
| ·RT-PCR 及测序 | 第37-39页 |
| ·定量 PCR | 第39页 |
| ·ncRNAs 的保守性分析 | 第39-40页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第40-57页 |
| 1. RNA 文库的构建和测序 | 第40-44页 |
| ·总 RNA 的提取及去除 rRNA | 第40页 |
| ·RNA 的质量检测 | 第40-41页 |
| ·RNA 测序结果及初步分析 | 第41-44页 |
| 2. 非编码 RNA 在 H37Rv 菌株中存在的实验验证 | 第44-49页 |
| ·挑选待验证的候选非编码 RNA | 第45-46页 |
| ·Northern blot | 第46-47页 |
| ·RT-PCR 及产物测序 | 第47-49页 |
| 3. 经验证的非编码 RNA 的基因组定位 | 第49-52页 |
| 4. 非编码 RNA 在细菌不同生长时期的表达情况 | 第52-54页 |
| ·不同生长时期 H37Rv 的 RNA 提取 | 第52-53页 |
| ·非编码 RNA 在 H37Rv 不同生长时期的表达定量 | 第53-54页 |
| 5. 非编码 RNA 的保守性分析 | 第54-57页 |
| ·根据与其它分枝杆菌的序列比对结果分析 ncRNAs 的保守性 | 第54-56页 |
| ·结合分枝杆菌属典型菌株的系统发育树分析 ncRNAs 的保守性 | 第56-57页 |
| 第四章 讨论和总结 | 第57-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 综述 细菌非编码 RNA 的功能研究进展 | 第73-100页 |
| 参考文献 | 第93-100页 |
| 附录 | 第100-105页 |
| 附录1 去除结核分枝杆菌中已知 rRNA 所用的探针 | 第100-101页 |
| 附录2 Northern blot 探针 | 第101-102页 |
| 附录3 RT-PCR 所用引物 | 第102-104页 |
| 附录4 定量 PCR 所用引物 | 第104-105页 |
| 攻读学位期间发表文章情况 | 第105-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
| 个人简历 | 第107页 |
