| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 β-内酰胺酶与β-内酰胺类抗生素的研究进展 | 第7-29页 |
| ·β-内酰胺酶简介 | 第7-15页 |
| ·β-内酰胺酶的结构功能及分类 | 第7-10页 |
| ·β-内酰胺类抗生素 | 第10-13页 |
| ·β-内酰胺类抗生素研究最新进展 | 第13-14页 |
| ·细菌耐药性产生的其它原因 | 第14-15页 |
| ·理论与方法简介 | 第15-20页 |
| ·分子对接理论基础 | 第15-18页 |
| ·分子动力学模拟 | 第18-20页 |
| ·结合自由能计算 | 第20页 |
| ·β-内酰胺酶与β-内酰胺类抗生素相互作用的的研究进展 | 第20-23页 |
| ·本论文的创新之处和研究意义 | 第23-24页 |
| 参考文献 | 第24-29页 |
| 第二章 TEM型β-内酰胺酶与药物分子氨曲南相互作用的分子模拟研究 | 第29-43页 |
| ·研究背景 | 第29-30页 |
| ·实验方法 | 第30-33页 |
| ·模拟体系初始结构的建立 | 第30-31页 |
| ·复合物体系的动力学模拟 | 第31-32页 |
| ·结合自由能的计算(MM-GBSA) | 第32页 |
| ·体系能量分解和熵的计算 | 第32-33页 |
| ·结果和讨论 | 第33-39页 |
| ·模拟复合物体系的平衡和结构柔性 | 第33-34页 |
| ·模拟体系的氢键和结合模式分析 | 第34-36页 |
| ·MM-GBSA结合自由能计算 | 第36-37页 |
| ·模拟体系的能量分解 | 第37-39页 |
| ·模拟体系的表面静电势能分析 | 第39页 |
| ·结论 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-43页 |
| 第三章 CTX-M型β-内酰胺酶与不同β-内酰胺类抗生素结合模式的分子动力学模拟研究 | 第43-59页 |
| ·研究背景 | 第43-45页 |
| ·实验方法 | 第45-47页 |
| ·初始结构的建立 | 第45-46页 |
| ·分子动力学模拟 | 第46页 |
| ·结合自由能的计算(MM-GBSA) | 第46-47页 |
| ·能量分解和熵的计算 | 第47页 |
| ·实验结果和讨论 | 第47-56页 |
| ·蛋白-配体体系的平衡和结构柔性 | 第47-49页 |
| ·模拟体系的结合自由能计算 | 第49-50页 |
| ·模拟体系的能量分解和关键残基的识别 | 第50-52页 |
| ·模拟体系结合模式和氢键分析 | 第52-56页 |
| ·结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-59页 |
| 在学期间的研究成果 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
