| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 1 前言 | 第10-17页 |
| ·研究目的与意义 | 第10页 |
| ·国内外研究进展 | 第10-14页 |
| ·不同土地利用方式对土壤氮流失的影响 | 第10-11页 |
| ·不同环境对硝化功能微生物多样性的影响 | 第11-12页 |
| ·土壤硝化作用过程及其功能基因 | 第12页 |
| ·氨氧化细菌和氨氧化古菌在硝化过程中的作用 | 第12-14页 |
| ·土壤微生物多样性研究方法进展 | 第14页 |
| ·研究内容、研究方案与技术路 | 第14-17页 |
| ·研究内容与目标 | 第15页 |
| ·研究方案 | 第15-16页 |
| ·技术路线 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-31页 |
| ·土壤样品 | 第17-20页 |
| ·土壤样品背景 | 第17-18页 |
| ·土壤样品采集与预处理 | 第18-19页 |
| ·土壤理化性质测定 | 第19-20页 |
| ·土壤DNA的提取 | 第20-22页 |
| ·仪器与试剂 | 第20-21页 |
| ·提取方法 | 第21-22页 |
| ·氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)amoA基因的扩增及条件优化 | 第22-24页 |
| ·仪器与试剂 | 第22-23页 |
| ·方法 | 第23页 |
| ·PCR扩增及条件优化 | 第23-24页 |
| ·氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)amoA基因的酶切反应和T-RFLP检测 | 第24-27页 |
| ·材料 | 第24页 |
| ·方法 | 第24-27页 |
| ·PCR产物纯化 | 第24-25页 |
| ·酶切反应和T-RFLP检测 | 第25-26页 |
| ·T-RFLP分析 | 第26-27页 |
| ·氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)amoA基因的克隆与序列分析 | 第27-30页 |
| ·材料 | 第27页 |
| ·方法 | 第27-30页 |
| ·PCR产物的纯化(同2.4.2.1) | 第27页 |
| ·克隆 | 第27-29页 |
| ·测序及序列分析 | 第29-30页 |
| ·文库分析 | 第30页 |
| ·核苷酸序列登录号 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-46页 |
| ·土壤微生物总DNA提取 | 第31-33页 |
| ·DNA的质量 | 第31-32页 |
| ·DNA质量的检测 | 第32-33页 |
| ·不同利用方式下氨氧化古菌和氨氧化细菌的多样性及组成 | 第33-38页 |
| ·氨氧化古菌和氨氧化细菌的PCR扩增 | 第33-34页 |
| ·T-RFLP分析氨氧化古菌和氨氧化细菌的多样性及组成 | 第34-38页 |
| ·酶切检测 | 第34页 |
| ·不同土地利用方式AOA和AOB多样性变化 | 第34-35页 |
| ·不同利用方式对硝化势的影响 | 第35页 |
| ·硝化势与多样性的关系 | 第35-36页 |
| ·不同利用方式对AOA和AOB群落的影响 | 第36-37页 |
| ·土壤理化性状对AOA和AOB分布的影响 | 第37-38页 |
| ·克隆文库构建与系统发育树 | 第38-46页 |
| ·目的基因片段的克隆与测序分析 | 第38-39页 |
| ·文库分析 | 第39-46页 |
| ·多样性指数分析 | 第39页 |
| ·稀疏曲线、库容及优势种分析 | 第39-41页 |
| ·文库显著性差异分析 | 第41页 |
| ·系统发育树分析 | 第41-46页 |
| 4 讨论 | 第46-49页 |
| ·土壤微生物总DNA提取 | 第46页 |
| ·不同利用方式对氨氧化功能微生物多样性的影响 | 第46-48页 |
| ·不同利用方式氨氧化古菌和氨氧化细菌amoA基因的系统发育分析 | 第48-49页 |
| 5 全文结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-58页 |
| 符号表 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 个人简历 | 第60页 |
