网络对称性及其在蛋白质交互网络中的应用
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-11页 |
·研究背景及意义 | 第7页 |
·蛋白质交互网络模块检测的研究现状 | 第7-8页 |
·本文的主要工作与论文结构 | 第8-11页 |
第二章 网络的对称性 | 第11-17页 |
·网络的基本概念 | 第11-13页 |
·网络的基本定义 | 第11-12页 |
·网络的矩阵表示 | 第12-13页 |
·网络对称性的数学基础 | 第13-17页 |
·集合和群 | 第13-14页 |
·群的置换 | 第14-16页 |
·自映射与轨道 | 第16-17页 |
第三章 基于对称性的网络度量 | 第17-31页 |
·传统的网络度量 | 第17-19页 |
·基于顶点的 Jaccard 系数 | 第17-18页 |
·基于边的中心性 | 第18页 |
·基于网络结构的桥系数 | 第18-19页 |
·传统网络度量分析 | 第19-20页 |
·对称性网络度量 | 第20-31页 |
·对称性度量的定义 | 第20-23页 |
·对称性度量与蛋白质交互网络的弱连接效应 | 第23-28页 |
·对称性度量与蛋白质交互网络拓扑相似性的关系 | 第28-29页 |
·蛋白质交互网络中对称性形成机理 | 第29-31页 |
第四章 对称性在蛋白质交互网络模块检测中的应用 | 第31-39页 |
·根据对称性度量建立蛋白质交互虚拟网络 | 第31-33页 |
·定义蛋白质交互网络中边的权值 | 第31页 |
·虚拟网络的定义 | 第31-32页 |
·基于虚拟网络的“核-附件”模块检测算法 | 第32-33页 |
·实验结果与分析 | 第33-39页 |
·实验数据 | 第33页 |
·评价指标 | 第33-34页 |
·结果分析 | 第34-39页 |
第五章 总结与展望 | 第39-41页 |
致谢 | 第41-43页 |
参考文献 | 第43-47页 |