| 中文摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 缩略语对照表 | 第9-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 铜绿假单胞菌的致病机制 | 第13-14页 |
| 1.2 细菌的群体感应系统 | 第14-18页 |
| 1.2.1 细菌群体感应系统的信号分子 | 第15-16页 |
| 1.2.2 铜绿假单胞菌中群体感应系统的组成及调节机制 | 第16-17页 |
| 1.2.3 铜绿假单胞菌中群体感应系统的作用 | 第17-18页 |
| 1.2.4 研究铜绿假单胞菌的群体感应系统的意义 | 第18页 |
| 1.3 细胞内蛋白质的降解 | 第18-21页 |
| 1.3.1 细胞内的蛋白酶及其复合物 | 第19页 |
| 1.3.2 细胞内的蛋白质降解途径 | 第19-20页 |
| 1.3.3 研究细胞内蛋白质降解机制的意义 | 第20-21页 |
| 1.4 本课题的研究内容和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第23-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-26页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第23-25页 |
| 2.1.2 细菌培养基及其培养条件 | 第25页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-44页 |
| 2.2.1 染色质免疫共沉淀技术测序(ChIP-seq)分析 | 第26-27页 |
| 2.2.2 基因表达的测定 | 第27-29页 |
| 2.2.2.1 启动子报道载体的构建 | 第27-28页 |
| 2.2.2.2 融合体报道载体的构建 | 第28-29页 |
| 2.2.2.3 基因表达水平的检测 | 第29页 |
| 2.2.3 转座子突变 | 第29-32页 |
| 2.2.3.1 转座突变体库的构建 | 第30-31页 |
| 2.2.3.2 转座突变体库的筛选 | 第31页 |
| 2.2.3.3 转座子插入位点的确定 | 第31-32页 |
| 2.2.4 基因敲除菌株的构建 | 第32-34页 |
| 2.2.5 基因互补菌株的构建 | 第34页 |
| 2.2.6 基因过表达菌株的构建 | 第34-35页 |
| 2.2.7 蛋白的表达和纯化 | 第35-37页 |
| 2.2.8 电泳迁移率变动分析实验 | 第37-38页 |
| 2.2.9 DNA足迹实验 | 第38页 |
| 2.2.10 蛋白体内降解实验和免疫印迹分析 | 第38-40页 |
| 2.2.11 细菌双杂交实验 | 第40-41页 |
| 2.2.12 生物被膜的检测 | 第41-42页 |
| 2.2.13 绿脓菌素产量的测定 | 第42页 |
| 2.2.14 测定PQS产量及薄层层析实验 | 第42-43页 |
| 2.2.15 C_4-HSL的生物活性测定 | 第43-44页 |
| 第三章 实验结果 | 第44-65页 |
| 3.1 研究cdpR基因的功能 | 第44-53页 |
| 3.1.1 cdpR基因突变影响铜绿假单胞菌的表型 | 第44-45页 |
| 3.1.2 ChIP-seq确定CdpR蛋白在铜绿假单胞菌基因组中的作用基因 | 第45-49页 |
| 3.1.3 CdpR蛋白调节pqsH基因和cdpR基因的表达 | 第49-52页 |
| 3.1.4 cdpR基因的缺失导致小鼠实验中铜绿假单胞菌致病性的升高 | 第52-53页 |
| 3.2 研究CdpR蛋白的晶体结构 | 第53-58页 |
| 3.2.1 铜绿假单胞菌CdpR蛋白的晶体结构和N-末端区域的折叠 | 第53-55页 |
| 3.2.2 CdpR蛋白独特的HTH结构和该结构的DNA识别功能 | 第55-58页 |
| 3.3 CdpR蛋白在体内的降解机制 | 第58-65页 |
| 3.3.1 影响cdpR基因表达的转座突变体的筛选及鉴定 | 第58-61页 |
| 3.3.2 CdpR蛋白与衔接蛋白ClpS相互作用并被ClpAP蛋白酶降解 | 第61-62页 |
| 3.3.3 ClpS蛋白和ClpAP蛋白调控铜绿假单胞菌的致病性 | 第62-65页 |
| 第四章 实验讨论 | 第65-69页 |
| 参考文献 | 第69-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第83页 |
