| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 符号说明及缩略词 | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-26页 |
| ·粘细菌简介 | 第15-18页 |
| ·粘细菌的分类地位和典型特征 | 第15-17页 |
| ·粘细菌的次级代谢产物及其生物学活性 | 第17-18页 |
| ·纤维堆囊菌介绍 | 第18-20页 |
| ·纤维堆囊菌的基本性质 | 第18-19页 |
| ·纤维堆囊菌的次级代谢产物 | 第19-20页 |
| ·埃博霉素及其生物合成特征 | 第20-22页 |
| ·埃博霉素的应用价值及研究现状 | 第20-21页 |
| ·Epothilone合成酶基因簇相关特征 | 第21-22页 |
| ·粘细菌社群中的竞争互助平衡 | 第22-24页 |
| ·微生物社会性行为介绍 | 第22-23页 |
| ·粘细菌竞争互助关系的研究进展 | 第23-24页 |
| ·本课题开展思路及研究内容 | 第24-26页 |
| 第二章 纤维堆囊菌的生物多样性 | 第26-52页 |
| ·引言 | 第26-27页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第27-32页 |
| ·土样和菌株 | 第27-28页 |
| ·培养基和试剂 | 第28-31页 |
| ·仪器设备 | 第31-32页 |
| ·生物信息学网站及分析软件 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-42页 |
| ·土壤样品的性质及选择 | 第32-33页 |
| ·纤维堆囊菌的富集分离 | 第33-35页 |
| ·纤维堆囊菌的形态学观察 | 第35页 |
| ·纤维堆囊菌基因组的提取 | 第35-36页 |
| ·纤维堆囊菌16S rDNA序列对比分析 | 第36-40页 |
| ·埃博霉素的发酵制备 | 第40-42页 |
| ·实验结果及讨论 | 第42-51页 |
| ·纤维堆囊菌的分离纯化 | 第42页 |
| ·纤维堆囊菌的形态学观察及比较 | 第42-46页 |
| ·纤维堆囊菌16S rDNA序列对比分析 | 第46-49页 |
| ·纤维堆囊菌的epothilone合成能力差异 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第三章 纤维堆囊菌株系间的竞争互助 | 第52-87页 |
| ·引言 | 第52-53页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第53-56页 |
| ·菌株 | 第53-54页 |
| ·培养基和试剂 | 第54-56页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第56页 |
| ·生物学软件 | 第56页 |
| ·实验方法 | 第56-65页 |
| ·纤维堆囊菌的混接和点接 | 第56-57页 |
| ·真菌孢子悬液的制备及抑菌试验 | 第57-58页 |
| ·总核酸法菌体定量 | 第58页 |
| ·Epothilone合成酶基因簇特异性探针的设计及扩增 | 第58-59页 |
| ·探针标记及标记效率测定 | 第59-61页 |
| ·Epothilone合成酶基因簇的杂交验证 | 第61-62页 |
| ·纤维堆囊菌总RNA提取及cDNA的制备 | 第62-65页 |
| ·Real-time PCR定量 | 第65页 |
| ·实验结果及讨论 | 第65-85页 |
| ·土样及菌株的性质 | 第65-67页 |
| ·混合菌株的形态学观察 | 第67-70页 |
| ·菌落扩展过程中的相互抑制 | 第70-72页 |
| ·Epothilone总产量的变化 | 第72-74页 |
| ·混合菌株的根霉抑制活性 | 第74-80页 |
| ·混合菌株生长比例的测定 | 第80-81页 |
| ·Epothilone合成酶基因簇的杂交验证 | 第81-83页 |
| ·Epothilone单位产量的换算 | 第83-84页 |
| ·Epothilone合成酶基因簇转录水平的验证 | 第84-85页 |
| ·本章小结 | 第85-87页 |
| 第四章 Epothilone A/B合成差异机制研究 | 第87-111页 |
| ·引言 | 第87-89页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第89-92页 |
| ·菌株和质粒 | 第89页 |
| ·培养基 | 第89页 |
| ·扩增及突变引物 | 第89-90页 |
| ·主要实验试剂 | 第90-92页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第92页 |
| ·实验方法 | 第92-102页 |
| ·野生型AT_(modC2)的巢式PCR扩增 | 第92-93页 |
| ·AT_(modC2)的定点突变 | 第93-95页 |
| ·pET-22b表达质粒的构建 | 第95-97页 |
| ·AT_(modC2)的异源表达 | 第97-98页 |
| ·His-tag蛋白的FPLC纯化 | 第98-100页 |
| ·包涵体的透析复性及柱上复性 | 第100-101页 |
| ·酶活测定 | 第101-102页 |
| ·实验结果及讨论 | 第102-109页 |
| ·野生型AT_(modC2)的巢式PCR扩增 | 第102-103页 |
| ·AT_(modC2)的定点突变 | 第103-104页 |
| ·pET-22b表达质粒的构建 | 第104-105页 |
| ·AT_(modC2)的异源表达 | 第105-106页 |
| ·AT_(modC2)的纯化及复性 | 第106-108页 |
| ·AT_(modC2)的底物选择性差异测定 | 第108-109页 |
| ·AT_(modC2)其它位点的突变及对底物选择性的影响 | 第109页 |
| ·本章小结 | 第109-111页 |
| 第五章 EpothiloneosideA的生物合成能力研究 | 第111-137页 |
| ·引言 | 第111-112页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第112-114页 |
| ·菌株 | 第112-113页 |
| ·培养基 | 第113页 |
| ·主要实验试剂 | 第113页 |
| ·仪器设备 | 第113-114页 |
| ·实验方法 | 第114-116页 |
| ·Epothiloneoside A的制备、分离及检测 | 第114-115页 |
| ·Epothiloneoside A标准曲线的绘制 | 第115页 |
| ·So0157-2生长曲线及Epothiloneoside A合成曲线的绘制 | 第115-116页 |
| ·单因子实验设计 | 第116页 |
| ·实验结果及讨论 | 第116-136页 |
| ·Epothiloneoside A分离检测条件的摸索 | 第116-124页 |
| ·So0157-2生长曲线及Epothiloneoside A合成曲线 | 第124-126页 |
| ·不同发酵条件下epothilone A糖基化率的变化 | 第126-128页 |
| ·碳氮源单因子泛筛 | 第128-136页 |
| ·本章小结 | 第136-137页 |
| 第六章 新型埃博霉素类化合物结构的质谱分析 | 第137-150页 |
| ·引言 | 第137页 |
| ·实验材料与仪器试剂 | 第137-138页 |
| ·主要实验试剂 | 第137-138页 |
| ·仪器设备 | 第138页 |
| ·LC/MS分析软件 | 第138页 |
| ·实验方法 | 第138-140页 |
| ·So157-2的液体摇瓶发酵及其产物制备 | 第138-139页 |
| ·LC-MS分离和检测 | 第139页 |
| ·LF-8和LF-11标准曲线的绘制 | 第139-140页 |
| ·实验结果及讨论 | 第140-149页 |
| ·14 /18元环埃博霉素类化合物的基本性质 | 第140-143页 |
| ·LF-8和LF-11标准曲线的绘制 | 第143-144页 |
| ·基于14/18元环埃博霉素结构的质谱预测分析 | 第144-149页 |
| ·本章小结 | 第149-150页 |
| 总结与展望 | 第150-151页 |
| 参考文献 | 第151-158页 |
| 致谢 | 第158-159页 |
| 攻读硕士期间主要研究成果 | 第159-161页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第161页 |
