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基于nLSU rDNA和ITS序列对侧耳属系统发育关系的研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-12页
缩略语第12-13页
1 前言第13-27页
   ·侧耳属蕈菌概述第13-14页
   ·侧耳属蕈菌系统分类研究第14-16页
     ·传统的形态分类第14-15页
     ·以生化特性(同工酶)为依据的分类第15页
     ·以交配试验为依据进行的分类第15-16页
     ·基于现代分子生物学的分类第16页
   ·侧耳属蕈菌DNA分子标记研究第16-20页
     ·限制性片段长度多态性(RFLP)第17页
     ·随机扩增多态性DNA(RAPD)第17-18页
     ·扩增片段长度多态性(AFLP)第18页
     ·简单重复序列间区(ISSR)第18-19页
     ·内转录间隔区(ITS)第19页
     ·基因内间隔区(IGS)第19-20页
   ·侧耳属蕈菌分子系统发育研究第20-25页
     ·分子系统发育概述第20-21页
     ·分子系统发育分析方法第21-23页
       ·距离法第22页
       ·简约法第22-23页
       ·似然法第23页
       ·分析软件第23页
     ·侧耳属簟菌分子系统发育研究进展第23-25页
       ·rDNA-RFLP分析在侧耳分子系统发育关系中的应用第24页
       ·ITS和LSU序列分析在侧耳分子系统发育关系中的应用第24-25页
       ·其它标记技术在侧耳分子系统发育关系中的应用第25页
   ·研究目的和意义第25-27页
2 材料和方法第27-39页
   ·试验材料第27-31页
     ·供试菌株第27-29页
     ·供试培养基第29页
     ·实验试剂第29-31页
       ·贮存溶液第29页
       ·DNA提取液第29页
       ·PCR反应试剂第29-30页
       ·电泳试剂第30页
       ·克隆试剂第30-31页
     ·实验主要仪器第31页
   ·试验方法第31-39页
     ·菌丝体形态观察第31页
     ·栽培出菇试验第31页
     ·菌丝体培养与收集第31页
     ·DNA提取第31-33页
       ·DNA提取步骤第32页
       ·琼脂糖凝胶电泳检测第32-33页
       ·紫外分光光度计检测第33页
     ·引物设计与合成第33页
     ·PCR反应第33-35页
       ·LSU-PCR反应第33-34页
       ·ITS-PCR反应第34-35页
     ·PCR产物纯化回收第35-36页
       ·LSU-PCR产物的回收第35页
       ·ITS-PCR产物的回收第35-36页
     ·ITS-PCR产物的克隆第36-37页
     ·克隆检测第37-38页
     ·测序第38页
     ·数据分析第38-39页
3 结果与分析第39-59页
   ·菌丝体形态特征第39页
   ·子实体外部形态特征第39-44页
   ·总DNA质量检测图谱第44页
   ·LSU-PCR扩增产物检测图谱第44页
   ·ITS-PCR扩增产物检测图谱第44-45页
   ·克隆检测图谱第45-46页
   ·序列特征分析第46-49页
   ·基于LSU序列的分子系统发育树第49-53页
   ·基于ITS序列的分子系统发育树第53-57页
   ·综合比较分析两种序列构建的侧耳属系统发育树第57-59页
4 讨论第59-63页
   ·形态特征对侧耳菌株的分类鉴定第59页
   ·基于LSU序列和ITS序列对侧耳属的系统发育分析第59-61页
   ·侧耳属系统发育与分类研究第61-63页
参考文献第63-70页
附录一 LSU序列第70-73页
附录二 ITS序列第73-75页
附录三 在校期间发表文章第75-76页
致谢第76页

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