| 目录 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 第一章 绪论 | 第6-22页 |
| ·研究背景 | 第6-14页 |
| ·蛋白质折叠和聚集的研究现状 | 第6-9页 |
| ·人类微球蛋白和淀粉纤维症 | 第9-14页 |
| ·蛋白质结构的相关知识 | 第14-22页 |
| ·蛋白质结构分类 | 第17-20页 |
| ·蛋白质分子间作用力 | 第20-22页 |
| 第二章 分子力场和分子动力学方法简介 | 第22-29页 |
| ·经验力场和GROMACS简介 | 第22-25页 |
| ·分子动力学方法概述 | 第25-29页 |
| 第三章 人类微球蛋白片段83-99的结构和聚集动力学 | 第29-40页 |
| ·模拟方法和系统参数 | 第29-30页 |
| ·单体(monomer)的结构和折叠自由能 | 第30-33页 |
| ·二聚体(dimer)的聚集动力学过程 | 第33-37页 |
| ·原纤维(protofibril)模型的结构稳定性分子动力学模拟 | 第37-39页 |
| ·结论 | 第39-40页 |
| 第四章 K3片段中顺式和反式Pro32的折叠自由能图 | 第40-49页 |
| ·K3纤维模型的结构稳定性分子动力学模拟 | 第40-42页 |
| ·K3片段单体的的结构和折叠自由能 | 第42-48页 |
| ·结论 | 第48-49页 |
| 第五章 总结与展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 攻读硕士阶段发表文章 | 第56页 |
| 攻读硕士阶段参加的学术会议 | 第56-57页 |
