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海岛棉纤维发育相关基因表达谱分析及功能基因的发掘

缩写名词表第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-13页
1 文献综述第13-33页
   ·棉花纤维发育过程第13-14页
   ·细胞壁与棉花纤维第14-16页
     ·细胞壁的化学组成第14-15页
     ·细胞壁的构架第15-16页
     ·细胞壁的生物合成与装配第16页
   ·植物基因功能研究策略第16-22页
     ·基因功能丧失方法第18-20页
       ·反义抑制和共抑制第18页
       ·插入突变第18-19页
       ·RNA干扰(RNAi)第19-20页
     ·基因功能增加方法第20-21页
       ·超量表达(Over expression)第20页
       ·基因诱导表达(Inducible expression)第20-21页
     ·DNA Microarray第21-22页
     ·酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid system)第22页
   ·棉花纤维发育分子生物学研究进展第22-30页
     ·棉花纤维特异或优势表达基因的克隆第22-23页
     ·棉花纤维发育相关基因的ESTs和表达谱研究第23-25页
     ·棉花纤维优势表达基因的功能验证第25-26页
     ·棉花纤维发育分子机理第26-30页
       ·棉花纤维细胞的分化起始第26-29页
       ·纤维细胞伸长假说第29-30页
   ·激素与棉纤维发育第30-32页
   ·本研究的目的与意义第32-33页
2 材料与方法第33-40页
   ·植物材料第33页
   ·RNA和DNA的抽提第33页
   ·独立cDNA文库及均一化cDNA文库的构建第33-35页
   ·DNA MICROARRAY的制作、杂交及数据处理第35-36页
   ·ESTs的分析第36页
   ·NORTHERN及SOUTHERN杂交分析第36-38页
     ·探针标记第36-37页
     ·Northern杂交第37页
     ·Southern杂交第37-38页
   ·超量表达载体的构建第38-39页
   ·RNAI抑制表达载体的构建第39页
   ·启动子的克隆及分析、启动子载体的构建第39页
   ·遗传转化第39页
   ·实时定量PCR(QRT-PCR)第39-40页
3 结果与分析第40-75页
   ·纤维发育时期均一化cDNA文库的构建第40-42页
   ·海岛棉PIMA 3-79纤维不同发育时期筛选均一化cDNA文库第42-44页
     ·差异克隆的筛选第42-43页
     ·ESTs的功能分析第43-44页
   ·已测序cDNA的表达分析第44-58页
     ·Type Ⅰ第44-45页
     ·Type Ⅱ第45页
     ·Type Ⅲ第45-52页
     ·Type Ⅳ第52-54页
     ·Type Ⅴ第54-57页
     ·Type Ⅵ第57页
     ·Type Ⅶ第57-58页
   ·海岛棉(G.BARBADENSE)与陆地棉(G.HIRSUTUM)表达谱的比较第58-60页
   ·棉花纤维特异或优势表达基因的功能验证第60-68页
     ·部分基因的Southern杂交基因组拷贝数分析第60页
     ·GbEX2和GbEX3的RNAi和超表达分析的设计第60-62页
     ·GbEX2和GbEX3的启动子克隆及其验证载体的构建第62-68页
   ·棉花纤维发育和体细胞胚发生过程中QRT-PCR数据平衡化合适内对照基因的筛选与验证第68-75页
4 讨论第75-85页
   ·关于棉花纤维发育CDNA均一化文库的构建第75-77页
   ·海岛棉ESTS的发掘第77页
   ·海岛棉纤维发育的可能机制及海岛棉与陆地棉的基因表达谱的差异第77-79页
   ·关于EXPANSIN的讨论第79-83页
   ·棉花QRT-PCR内对照基因的验证第83页
   ·总结与展望第83-85页
参考文献第85-100页
PROTOCOLS第100-105页
附录1 海岛棉纤维发育相关基因的表达谱第105-114页
附录2 海岛棉与陆地棉相同发育时期表达谱差异第114-122页
附录3 GBEX2和GBEX3启动子可能的反式作用元件第122-132页
附录4 简历和博士期间论文发表和投稿情况第132-133页
致谢第133页

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