| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-47页 |
| 1 定量蛋白质组学 | 第13-26页 |
| ·两维凝胶电泳为基础的定量蛋白质组学 | 第13-15页 |
| ·质谱为基础的稳定同位素标记的定量蛋白质组学 | 第15-26页 |
| ·稳定同位素的体外标记定量方法 | 第15-24页 |
| ·ICAT标记技术 | 第16-19页 |
| ·iTRAQ标记技术 | 第19-21页 |
| ·Proteolytic 18O标记技术 | 第21-22页 |
| ·其他稳定同位素化学标记技术 | 第22-24页 |
| ·稳定同位素的体内标记定量方法 | 第24-26页 |
| 2 蛋白质相互作用技术 | 第26-31页 |
| ·蛋白质芯片技术(protein microarray) | 第27页 |
| ·串联亲和纯化技术(tandem affinity purification,TAP) | 第27-29页 |
| ·体内双标记技术(in vivo dual tagging) | 第29-30页 |
| ·QUICK技术(quantitative immunoprecipitation combined with knockdown) | 第30-31页 |
| 3 本论文的选题目的及意义 | 第31-32页 |
| 4 参考文献 | 第32-47页 |
| 第二章 蛋白质组学解析特异性激动剂引起的巨噬细胞TLR的天然免疫应答 | 第47-89页 |
| 1 引言 | 第47-49页 |
| 2 实验部分 | 第49-54页 |
| ·化学试剂和抗体 | 第49页 |
| ·细胞系培养和刺激剂处理 | 第49-51页 |
| ·考染的胶内酶解 | 第51-52页 |
| ·酶解肽段的液相色谱分离 | 第52页 |
| ·分离肽段的质谱鉴定 | 第52页 |
| ·数据处理、蛋白鉴定和定量分析 | 第52-53页 |
| ·P3蛋白网络图 | 第53页 |
| ·Western Blotting | 第53-54页 |
| 3 结果与讨论 | 第54-80页 |
| ·Pam3CSK4刺激与未刺激巨噬细胞的差异表达蛋白的亚组分鉴定和定量分析 | 第54-56页 |
| ·AACT定量的S1组分蛋白的功能分类研究 | 第56-58页 |
| ·AACT定量的P3组分蛋白的功能分类研究 | 第58-68页 |
| ·AACT为基础的蛋白质组学方法鉴定的TLR2介导的Pam3CSK4引起的差异表达蛋白之间的功能联系 | 第68-75页 |
| ·鉴定的染色质相关蛋白之间的功能联系 | 第75-78页 |
| ·涉及到前炎症或抗微生物应答的调控机制的基因的鉴定 | 第78-80页 |
| 4 结论 | 第80页 |
| 5 参考文献 | 第80-89页 |
| 第三章 TNF-α引起的14-3-3 epsilon蛋白复合物的变化 | 第89-116页 |
| 1 前言 | 第89-91页 |
| 2 实验部分 | 第91-94页 |
| ·化学试剂和抗体 | 第91页 |
| ·细胞培养和体内标记 | 第91-92页 |
| ·稳定细胞系的TNF-α处理 | 第92页 |
| ·蛋白提取和14-3-3ε蛋白复合物的纯化 | 第92页 |
| ·LC-MS/MS分离分析 | 第92-93页 |
| ·数据库搜索和蛋白鉴定 | 第93页 |
| ·免疫共沉淀和免疫印迹 | 第93-94页 |
| 3 结果与讨论 | 第94-108页 |
| ·定量鉴定TNF-α引起的14-3-3ε蛋白复合物 | 第94-96页 |
| ·定量鉴定到的TNF-α引起的14-3-3ε蛋白复合物的验证 | 第96-97页 |
| ·TNF-α引起的14-3-3ε蛋白复合物的功能分类 | 第97-101页 |
| ·TNF-α引起的14-3-3ε相互作用的蛋白功能解析 | 第101-105页 |
| ·CDC37-HSP90 | 第102-103页 |
| ·TAK1 | 第103-104页 |
| ·PPM1B | 第104页 |
| ·RuvB-like 2 | 第104页 |
| ·DDX21 | 第104-105页 |
| ·TANK-binding kinase 1 | 第105页 |
| ·TNF-α刺激与未刺激条件下14-3-3ε蛋白复合物的变化情况 | 第105-107页 |
| ·鉴定到的TNF-α引起的单条肽匹配的14-3-3ε相互作用蛋白 | 第107-108页 |
| 4 结论 | 第108-109页 |
| 5 参考文献 | 第109-116页 |
| 第四章 微流控芯片反应器在复杂蛋白样品的酶解 | 第116-153页 |
| 1 引言 | 第116-117页 |
| 2 实验部分 | 第117-119页 |
| ·仪器和设备 | 第117-118页 |
| ·细胞培养和蛋白提取 | 第118页 |
| ·2D-LC-ESI-MS/MS分离分析 | 第118-119页 |
| ·数据库搜索和蛋白鉴定 | 第119页 |
| 3 结果与讨论 | 第119-123页 |
| ·比较多层纳米金胶组装的微流控反应器酶解结果和传统的溶液酶解结果 | 第119-120页 |
| ·比较多层纳米金胶组装的微流控反应器酶解结果和传统的胶上酶解结果 | 第120-123页 |
| 4 结论与展望 | 第123页 |
| 5 参考文献 | 第123-126页 |
| 6 附录 | 第126-153页 |
| 博士期间发表文章情况 | 第153-154页 |
| 致谢 | 第154-155页 |
