| 中文摘要 | 第1页 |
| 关键词 | 第5-6页 |
| 1. 研究背景 | 第6页 |
| 2. 理论背景 | 第6-16页 |
| ·分子力学概述 | 第6-7页 |
| ·分子力场作用项的一般形式 | 第7-11页 |
| ·键长的伸缩振动 | 第8页 |
| ·键角的弯曲振动 | 第8-9页 |
| ·二面角扭转相互作用 | 第9页 |
| ·Van der Walls相互作用 | 第9-10页 |
| ·静电相互作用 | 第10-11页 |
| ·各种相互作用的耦合 | 第11页 |
| ·分子力场的参数化 | 第11-13页 |
| ·蛋白质极化力场模型 | 第13页 |
| ·电负性均衡方法 | 第13-16页 |
| 3. ABEEM/MM蛋白质力场模型 | 第16-23页 |
| ·ABEEM/MM浮动电荷力场模型 | 第17-19页 |
| ·ABEEM/MM模型参数的确定 | 第19-23页 |
| 4. 应用ABEEM/MM蛋白质力场模型研究二肽构象的性质 | 第23-48页 |
| ·二肽构象的介绍 | 第23-24页 |
| ·二肽构象的分析 | 第24页 |
| ·丙氨酸二肽构象 | 第24-28页 |
| ·从头算的计算 | 第25-26页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第26-28页 |
| ·构象能 | 第26-27页 |
| ·氢键 | 第27-28页 |
| ·半肽氨酸二肽构象 | 第28-33页 |
| ·从头算的计算 | 第28-31页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第31-33页 |
| ·构象能 | 第31-32页 |
| ·氢键 | 第32-33页 |
| ·丝氨酸二肽构象 | 第33-38页 |
| ·从头算的计算 | 第33-35页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第35-38页 |
| ·构象能 | 第35-36页 |
| ·氢键 | 第36-38页 |
| ·苯基丙氨酸二肽构象 | 第38-41页 |
| ·从头算的计算 | 第38-39页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第39-41页 |
| ·构象能 | 第39-40页 |
| ·氢键 | 第40-41页 |
| ·天冬丙氨酸二肽构象 | 第41-45页 |
| ·从头算的计算 | 第41-42页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第42-45页 |
| ·构象能 | 第42-43页 |
| ·氢键 | 第43-45页 |
| ·异戊丙氨酸二肽构象 | 第45-48页 |
| ·从头算的计算 | 第45-46页 |
| ·ABEEM/MM蛋白质力场模型的应用 | 第46-48页 |
| ·构象能 | 第46-47页 |
| ·氢键 | 第47-48页 |
| 5. 结论与展望 | 第48-50页 |
| 英文摘要 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 学位论文独创性声明 | 第58页 |
| 学位论文版权的使用授权书 | 第58页 |