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七筋菇植物遗传多样性与分子系统地理学研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
第一部分 前言第14-25页
 1 七筋菇属(Clintonia Raf.)的背景资料第14-15页
 2 七筋菇(Clintonia undensis)植物及其研究现状第15-18页
 3 本研究中所用的分子标记第18-23页
  3.1 ISSR分子遗传标记第18-19页
  3.2 DNA序列分析第19-23页
   3.2.1 DNA序列分析第19-20页
   3.2.2 DNA序列分析参数及模型第20-23页
 4 本研究的立题依据和主要内容第23-25页
  4.1 立题依据第23-24页
  4.2 研究内容第24-25页
第二部分 七筋菇种群的遗传多样性研究第25-56页
 1 植物材料与方法第25-33页
  1.1 植物材料第25-27页
  1.2 实验方法第27-33页
   1.2.1 染色体数目的计数第27页
   1.2.2 DNA的提取与纯化第27-28页
   1.2.3 引物的筛选第28-30页
   1.2.4 PCR扩增反应的优化及退火温度的确定第30-31页
   1.2.5 PCR扩增及产物检测第31页
   1.2.6 数据处理第31-33页
 2 实验结果与分析第33-44页
  2.1 DNA的提取第33-34页
  2.2 适于ISSR-PCR扩增的模板浓度第34-35页
  2.3 退火温度的确定第35页
  2.4 各引物适宜组合的确定第35-36页
  2.5 细胞型的确定第36页
  2.6 七筋菇种群的ISSR遗传多样性第36-38页
  2.7 七筋菇种群的遗传结构第38-44页
   2.7.1 七筋菇种群的遗传变异第38-40页
   2.7.2 种群的基因流格局第40页
   2.7.3 遗传距离与地理距离之间的相关分析第40-44页
 3 讨论第44-56页
  3.1 植物总基因组DNA的提取第44-45页
  3.2 ISSR-PCR反应体系的优化第45-46页
  3.3 七筋菇种群的遗传多样性第46-47页
  3.4 七筋菇种群的遗传结构第47-50页
  3.5 不同倍性种群的遗传多样性第50-52页
  3.6 七筋菇的起源中心以及多样性中心第52-56页
第三部分 七筋菇的分子系统地理学研究第56-88页
 1 植物材料与方法第56-62页
  1.1 植物材料第56页
  1.2 方法第56-62页
   1.2.1 DNA的提取与纯化第56-57页
   1.2.2 引物筛选第57-58页
   1.2.3 PCR扩增第58页
   1.2.4 克隆第58-62页
 2 数据处理与分析第62-64页
  2.1 序列编辑及序列比对第62页
   2.1.1 序列编辑与拼接第62页
   2.1.2 序列比对第62页
  2.2 序列组成分析第62页
  2.3 cpDNA单倍型的确定及多样性指数的计算第62-63页
  2.4 分子系统树的构建第63页
  2.5 种群进化历史第63-64页
 3 实验结果与分析第64-77页
  3.1 七筋菇atpB-rbcL非编码区序列的扩增与测序第64页
  3.2 七筋菇atpB-rbcL非编码区序列变异第64-71页
   3.2.1 碱基组成第64页
   3.2.2 序列的核苷酸变异第64-65页
   3.2.3 cpDNA单倍型分析第65页
   3.2.4 cpDNA单倍型间的核苷酸分歧度第65-71页
  3.3 系统进化树第71-75页
   3.3.1 NJ和MP系统进化树第71页
   3.3.2 NETWORK网络进化图第71-75页
  3.4 七筋菇cpDNA单倍型统计参数第75-77页
   3.4.1 cpDNA单倍型的多样性指数第75页
   3.4.2 AMOVA分析第75-76页
   3.4.3 种群动态分析第76-77页
 4 讨论第77-88页
  4.1 有关atpB-rbcL基因间隔区第77-79页
  4.2 关于系统进化树第79-80页
  4.3 七筋菇cpDNA遗传多样性第80-81页
  4.4 七筋菇基于cpDNA数据的系统地理结构第81-85页
  4.5 多倍体起源第85-88页
第四部分 结论第88-89页
参考文献第89-116页
致谢第116-117页
攻读博士学位期间发表论文第117页

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