摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-14页 |
第一部分 前言 | 第14-25页 |
1 七筋菇属(Clintonia Raf.)的背景资料 | 第14-15页 |
2 七筋菇(Clintonia undensis)植物及其研究现状 | 第15-18页 |
3 本研究中所用的分子标记 | 第18-23页 |
3.1 ISSR分子遗传标记 | 第18-19页 |
3.2 DNA序列分析 | 第19-23页 |
3.2.1 DNA序列分析 | 第19-20页 |
3.2.2 DNA序列分析参数及模型 | 第20-23页 |
4 本研究的立题依据和主要内容 | 第23-25页 |
4.1 立题依据 | 第23-24页 |
4.2 研究内容 | 第24-25页 |
第二部分 七筋菇种群的遗传多样性研究 | 第25-56页 |
1 植物材料与方法 | 第25-33页 |
1.1 植物材料 | 第25-27页 |
1.2 实验方法 | 第27-33页 |
1.2.1 染色体数目的计数 | 第27页 |
1.2.2 DNA的提取与纯化 | 第27-28页 |
1.2.3 引物的筛选 | 第28-30页 |
1.2.4 PCR扩增反应的优化及退火温度的确定 | 第30-31页 |
1.2.5 PCR扩增及产物检测 | 第31页 |
1.2.6 数据处理 | 第31-33页 |
2 实验结果与分析 | 第33-44页 |
2.1 DNA的提取 | 第33-34页 |
2.2 适于ISSR-PCR扩增的模板浓度 | 第34-35页 |
2.3 退火温度的确定 | 第35页 |
2.4 各引物适宜组合的确定 | 第35-36页 |
2.5 细胞型的确定 | 第36页 |
2.6 七筋菇种群的ISSR遗传多样性 | 第36-38页 |
2.7 七筋菇种群的遗传结构 | 第38-44页 |
2.7.1 七筋菇种群的遗传变异 | 第38-40页 |
2.7.2 种群的基因流格局 | 第40页 |
2.7.3 遗传距离与地理距离之间的相关分析 | 第40-44页 |
3 讨论 | 第44-56页 |
3.1 植物总基因组DNA的提取 | 第44-45页 |
3.2 ISSR-PCR反应体系的优化 | 第45-46页 |
3.3 七筋菇种群的遗传多样性 | 第46-47页 |
3.4 七筋菇种群的遗传结构 | 第47-50页 |
3.5 不同倍性种群的遗传多样性 | 第50-52页 |
3.6 七筋菇的起源中心以及多样性中心 | 第52-56页 |
第三部分 七筋菇的分子系统地理学研究 | 第56-88页 |
1 植物材料与方法 | 第56-62页 |
1.1 植物材料 | 第56页 |
1.2 方法 | 第56-62页 |
1.2.1 DNA的提取与纯化 | 第56-57页 |
1.2.2 引物筛选 | 第57-58页 |
1.2.3 PCR扩增 | 第58页 |
1.2.4 克隆 | 第58-62页 |
2 数据处理与分析 | 第62-64页 |
2.1 序列编辑及序列比对 | 第62页 |
2.1.1 序列编辑与拼接 | 第62页 |
2.1.2 序列比对 | 第62页 |
2.2 序列组成分析 | 第62页 |
2.3 cpDNA单倍型的确定及多样性指数的计算 | 第62-63页 |
2.4 分子系统树的构建 | 第63页 |
2.5 种群进化历史 | 第63-64页 |
3 实验结果与分析 | 第64-77页 |
3.1 七筋菇atpB-rbcL非编码区序列的扩增与测序 | 第64页 |
3.2 七筋菇atpB-rbcL非编码区序列变异 | 第64-71页 |
3.2.1 碱基组成 | 第64页 |
3.2.2 序列的核苷酸变异 | 第64-65页 |
3.2.3 cpDNA单倍型分析 | 第65页 |
3.2.4 cpDNA单倍型间的核苷酸分歧度 | 第65-71页 |
3.3 系统进化树 | 第71-75页 |
3.3.1 NJ和MP系统进化树 | 第71页 |
3.3.2 NETWORK网络进化图 | 第71-75页 |
3.4 七筋菇cpDNA单倍型统计参数 | 第75-77页 |
3.4.1 cpDNA单倍型的多样性指数 | 第75页 |
3.4.2 AMOVA分析 | 第75-76页 |
3.4.3 种群动态分析 | 第76-77页 |
4 讨论 | 第77-88页 |
4.1 有关atpB-rbcL基因间隔区 | 第77-79页 |
4.2 关于系统进化树 | 第79-80页 |
4.3 七筋菇cpDNA遗传多样性 | 第80-81页 |
4.4 七筋菇基于cpDNA数据的系统地理结构 | 第81-85页 |
4.5 多倍体起源 | 第85-88页 |
第四部分 结论 | 第88-89页 |
参考文献 | 第89-116页 |
致谢 | 第116-117页 |
攻读博士学位期间发表论文 | 第117页 |