中文摘要 | 第1-17页 |
英文摘要 | 第17-24页 |
缩略语 | 第24-27页 |
第一章 蜂猴属(Nycticebus)研究进展 | 第27-49页 |
第一节 蜂猴属研究背景 | 第27-29页 |
1.1.1.蜂猴的形态习性 | 第27-28页 |
1.1.2.倭蜂猴的形态习性 | 第28页 |
1.1.3.蜂猴属传统生物学研究方法的困难 | 第28-29页 |
第二节 蜂猴属研究的进展 | 第29-42页 |
1.2 蜂猴属的系统学研究 | 第29-42页 |
1.2.1 形态学和分类学 | 第29-31页 |
1.2.1.1 蜂猴属头骨差异的综合研究 | 第29-30页 |
1.2.1.2 蜂猴属分类研究 | 第30-31页 |
1.2.2 蜂猴属的细胞学研究 | 第31-33页 |
1.2.3 蜂猴属的叫声、生殖与行为 | 第33-38页 |
1.2.3.1 蜂猴的叫声与行为 | 第33-34页 |
1.2.3.2 蜂猴的生殖与行为 | 第34-35页 |
1.2.3.3 倭蜂猴的生殖与行为 | 第35-36页 |
1.2.3.4 蜂猴属的母—婴行为 | 第36-38页 |
1.2.4 蜂猴属物种的个体发育研究 | 第38-40页 |
1.2.5 蜂猴属的分子生物学研究 | 第40-42页 |
1.2.5.1 蜂猴的线粒体DNA RFLP分析 | 第40页 |
1.2.5.2 基于线粒体细胞色素b基因的蜂猴属系统发育研究 | 第40-41页 |
1.2.5.3 蜂猴属核糖体DNA的变异特性与其种间分化的关系 | 第41页 |
1.2.5.4 蜂猴属蛋白质多态与遗传分化 | 第41页 |
1.2.5.5 蜂猴属同工酶研究 | 第41-42页 |
第三节 蜂猴属的分子系统发育和分子群体遗传学研究的意义 | 第42-45页 |
1.3.1 蜂猴属的研究刻不容缓 | 第42页 |
1.3.2 蜂猴属分子系统发育和分子群体遗传多样性研究的意义 | 第42-45页 |
参考文献 | 第45-49页 |
第二章 动物线粒体D-Loop的结构和功能——蜂猴属研究运用的分子生物学理论平台1 | 第49-69页 |
第一节 动物线粒体D-Loop的结构划分和碱基组成特点 | 第49-51页 |
2.1.1 动物线粒体D-Loop的结构划分 | 第49-50页 |
2.1.2 动物线粒体D-Loop区域的碱基组成特点 | 第50-51页 |
第二节 动物线粒体D-Loop区域的结构特点和功能 | 第51-59页 |
2.2.1 概述 | 第51-52页 |
2.2.2 中心功能域 | 第52-53页 |
2.2.3 ETAS功能域 | 第53-56页 |
2.2.4 CSB功能域 | 第56-58页 |
2.2.5 二级结构 | 第58-59页 |
第三节 动物线粒体D-loop区域在进化研究中的应用 | 第59-62页 |
2.3.1 概述 | 第59-60页 |
2.3.2 在进化研究中的应用 | 第60-62页 |
参考文献 | 第62-69页 |
第三章 线粒体DNA长度变异及其形成机制——蜂猴属研究运用的分子生物学理论平台2 | 第69-103页 |
第一节 线粒体DNA长度变异和串联重复概述 | 第69-71页 |
第二节 串联重复形成的机制 | 第71-89页 |
3.2.1 串联重复序列的起源可能与其停止在复制过程相关 | 第71页 |
3.2.2 重组、转座、不等交换 | 第71-73页 |
3.2.3 链剪切错配 | 第73-78页 |
3.2.4 非法延伸模型 | 第78-81页 |
3.2.5 重链模型 | 第81-83页 |
3.2.6 轻链模型 | 第83-85页 |
3.2.7 TAS-限制复制模型 | 第85-86页 |
3.2.8 Taylor和Breden(2000)模型 | 第86-89页 |
第三节 进化动力学:进化动力与mtDNA长度变异 | 第89-97页 |
3.3.1 遗传漂变与突变的平衡 | 第89-91页 |
3.3.2 mtDNA的双亲遗传 | 第91-92页 |
3.3.3 进化动力——选择 | 第92-94页 |
3.3.4 mtDNA长度变异的进化动力学 | 第94-97页 |
参考文献 | 第97-103页 |
第四章 D-loop和细胞色素b基因序列与蜂猴属的分子系统发育分析 | 第103-121页 |
第一节 前言 | 第103-105页 |
第二节 实验材料和方法 | 第105-110页 |
4.2.1 实验材料 | 第105页 |
4.2.2 实验方法 | 第105-108页 |
4.2.2.1 DNA提取 | 第105-106页 |
4.2.2.2 来自GenBank的序列 | 第106页 |
4.2.2.3 PCR扩增 | 第106页 |
4.2.2.4 PCR产物回收 | 第106页 |
4.2.2.5 DNA序列测定 | 第106-108页 |
4.2.3 数据分析 | 第108-110页 |
4.2.3.1 排序 | 第108页 |
4.2.3.2 序列信息分析 | 第108-109页 |
4.2.3.3 系统发育分析 | 第109-110页 |
第三节 结果和讨论 | 第110-119页 |
4.3.1 D-loop序列分析 | 第110页 |
4.3.2 细胞色素b基因序列分析 | 第110-116页 |
4.3.3 系统发育分析 | 第116-119页 |
参考文献 | 第119-121页 |
第五章 从线粒体基因探讨蜂猴属的分子系统发育关系 | 第121-142页 |
第一节 前言 | 第121-122页 |
第二节 实验材料和方法 | 第122-127页 |
5.2.1 实验材料 | 第122-125页 |
5.2.2 实验方法 | 第125-126页 |
5.2.2.1 DNA提取 | 第125页 |
5.2.2.2 PCR扩增 | 第125-126页 |
5.2.2.3 PCR产物回收 | 第126页 |
5.2.2.4 DNA序列测定 | 第126页 |
5.2.3 数据分析 | 第126-127页 |
5.2.3.1 排序 | 第126页 |
5.2.3.2 序列信息分析 | 第126-127页 |
5.2.3.3 系统发育分析 | 第127页 |
第三节 实验结果 | 第127-137页 |
5.3.1 序列变异 | 第127-130页 |
5.3.2 系统发育分析 | 第130-137页 |
5.3.2.1 转换饱和检验 | 第130-132页 |
5.3.2.2 系统发育分析 | 第132-137页 |
第四节 讨论 | 第137-139页 |
5.4.1 N.pygmaeus | 第137页 |
5.4.2 bengalensis | 第137页 |
5.4.3 N.coucang | 第137-139页 |
参考文献 | 第139-142页 |
第六章 蜂猴(Nycticebus bengalensis)和倭蜂猴(Nycticebus pygmaeus)的分子群体遗传学研究 | 第142-158页 |
第一节 前言 | 第142-143页 |
第二节 实验材料和方法 | 第143-144页 |
6.2.1 实验材料 | 第143页 |
6.2.2 实验方法 | 第143-144页 |
6.2.2.1 DNA提取 | 第143页 |
6.2.2.2 PCR扩增 | 第143页 |
6.2.2.3 PCR产物回收 | 第143页 |
6.2.2.4 DNA序列测定 | 第143-144页 |
6.2.3 数据分析 | 第144页 |
6.2.3.1 排序 | 第144页 |
6.2.3.2 序列信息分析 | 第144页 |
6.2.3.3 系统发育分析 | 第144页 |
第三节 实验结果 | 第144-152页 |
6.3.1 序列变异 | 第144-146页 |
6.3.2 单倍型网络图 | 第146-152页 |
6.3.3 参数估算 | 第152页 |
第四节 讨论 | 第152-155页 |
参考文献 | 第155-158页 |
总结 | 第158-162页 |
附录1 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因的核苷酸序列 | 第162-170页 |
附录2 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因的氨基酸序列 | 第170-173页 |
附录3 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因的部分核苷酸序列 | 第173-177页 |
附录4 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因的部分氨基酸序列 | 第177-178页 |
附录5 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因部分核苷酸序列的碱基组成 | 第178-179页 |
附录6 蜂猴(Nycticebus)细胞色素b基因部分序列中的转换颠换分布 | 第179-180页 |
附录7 蜂猴(Nycticebus)线粒体DNA D-loop的部分核苷酸序列 | 第180-211页 |
致谢 | 第211-213页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第213-214页 |