摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第1章 绪论 | 第9-18页 |
·课题研究的背景 | 第9-11页 |
·RNA 的选择性剪接 | 第11-13页 |
·选择性剪接方式 | 第11-13页 |
·选择性剪接的研究现状 | 第13-15页 |
·课题研究的目的和意义 | 第15-17页 |
·论文结构 | 第17-18页 |
第2章 外显子芯片数据分析技术 | 第18-29页 |
·基因芯片原理 | 第18-20页 |
·Affymetrix GeneChip Human Exon 1.0 ST Array 的设计 | 第20-21页 |
·外显子芯片数据分析流程 | 第21-28页 |
·数据正规化 | 第22页 |
·外显子芯片数据背景校正 | 第22-23页 |
·对外显子表达量和基因表达量进行估计 | 第23-24页 |
·选择性剪接事件的检测 | 第24-28页 |
·本章小结 | 第28-29页 |
第3章 芯片数据分析与注释 | 第29-39页 |
·对CEU/YRI 细胞系细胞毒性数据的分析 | 第29-34页 |
·基于FIRMA 算法的分析流程 | 第29页 |
·基于Affymetrix Power Tools 的分析流程 | 第29-33页 |
·对表达量显著差异的探针集进行注释 | 第33-34页 |
·CEU/YRI 细胞系中的SNP 位点 | 第34-38页 |
·国际人类基因组单体型图计划 | 第34-35页 |
·引起CEU/YRI 细胞系差异剪接的外显子中的候选SNP | 第35-38页 |
·本章小结 | 第38-39页 |
第4章 引起外显子差异剪接的SNP 位点预测 | 第39-52页 |
·选择性剪接的调控 | 第39-42页 |
·对以不同方式进行剪接的外显子序列特征的分析 | 第42-44页 |
·分类器的设计 | 第44-46页 |
·分类器性能的评价 | 第46-48页 |
·训练数据集和测试数据集的构造 | 第46-47页 |
·分类器特异性和敏感性分析 | 第47-48页 |
·造成CEU/YRI 细胞系外显子剪接差异的SNP 位点预测 | 第48-51页 |
·本章小结 | 第51-52页 |
结论 | 第52-54页 |
参考文献 | 第54-59页 |
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第59-61页 |
致谢 | 第61页 |