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ESE/ESS中的SNP引起的剪接方式差异的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第1章 绪论第9-18页
   ·课题研究的背景第9-11页
   ·RNA 的选择性剪接第11-13页
     ·选择性剪接方式第11-13页
   ·选择性剪接的研究现状第13-15页
   ·课题研究的目的和意义第15-17页
   ·论文结构第17-18页
第2章 外显子芯片数据分析技术第18-29页
   ·基因芯片原理第18-20页
   ·Affymetrix GeneChip Human Exon 1.0 ST Array 的设计第20-21页
   ·外显子芯片数据分析流程第21-28页
     ·数据正规化第22页
     ·外显子芯片数据背景校正第22-23页
     ·对外显子表达量和基因表达量进行估计第23-24页
     ·选择性剪接事件的检测第24-28页
   ·本章小结第28-29页
第3章 芯片数据分析与注释第29-39页
   ·对CEU/YRI 细胞系细胞毒性数据的分析第29-34页
     ·基于FIRMA 算法的分析流程第29页
     ·基于Affymetrix Power Tools 的分析流程第29-33页
     ·对表达量显著差异的探针集进行注释第33-34页
   ·CEU/YRI 细胞系中的SNP 位点第34-38页
     ·国际人类基因组单体型图计划第34-35页
     ·引起CEU/YRI 细胞系差异剪接的外显子中的候选SNP第35-38页
   ·本章小结第38-39页
第4章 引起外显子差异剪接的SNP 位点预测第39-52页
   ·选择性剪接的调控第39-42页
   ·对以不同方式进行剪接的外显子序列特征的分析第42-44页
   ·分类器的设计第44-46页
   ·分类器性能的评价第46-48页
     ·训练数据集和测试数据集的构造第46-47页
     ·分类器特异性和敏感性分析第47-48页
   ·造成CEU/YRI 细胞系外显子剪接差异的SNP 位点预测第48-51页
   ·本章小结第51-52页
结论第52-54页
参考文献第54-59页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果第59-61页
致谢第61页

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