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小核盘菌多样性、致病力衰退机制及危害油菜的风险研究

摘要第10-12页
Abstract第12-14页
缩略词表(Abbreviation)第15-16页
第一章 文献综述第16-36页
    1 S.minor的研究进展第16-23页
        1.1 S.minor的分类地位第16页
        1.2 S.minor的生物学特性第16-17页
        1.3 S.minor的寄主范围第17页
        1.4 S.minor的侵染循环第17页
        1.5 S.minor的风险第17-18页
        1.6 S.minor的地理分布第18页
        1.7 S.minor的致病机制第18-19页
            1.7.1 草酸第18-19页
            1.7.2 致病相关酶类第19页
        1.8 S.minor交配型基因(MAT)的研究进展第19-20页
        1.9 S.minor的多样性第20-21页
        1.10 S.minor的防治第21-23页
    2 真菌病毒的研究进展第23-36页
        2.1 真菌病毒的分类第23-30页
            2.1.1 双链RNA病毒第23-27页
            2.1.2 正单链RNA病毒第27-28页
            2.1.3 逆转录RNA病毒第28-29页
            2.1.4 真菌DNA病毒第29页
            2.1.5 负单链RNA病毒第29-30页
        2.2 植物病原真菌弱毒现象第30页
        2.3 植物病原真菌弱毒现象的机制第30-31页
        2.4 真菌病毒的传播第31-32页
        2.5 真菌病毒与真菌之间的互作第32-34页
            2.5.1 CHV1-EP713的基因组信息第32页
            2.5.2 CHV1-EP713编码的相关蛋白(p29,p40和p48)对寄主真菌的影响第32-33页
            2.5.3 CHV1-EP713调节寄主的基因表达第33-34页
        2.6 真菌病毒应用于生物防治的研究进展第34-35页
        2.7 本文的研究目的与意义第35-36页
第二章 小核盘菌菌株生物学特性及遗传多样性研究第36-73页
    1 材料和方法第36-44页
        1.1 培养基及试剂第36-37页
        1.2 样品的采集与分离纯化第37页
            1.2.1 样品的采集第37页
            1.2.2 菌株的分离、纯化和保存第37页
        1.3 DNA的提取及PCR扩增第37-38页
            1.3.1 DNA的提取第37-38页
            1.3.2 PCR扩增第38页
        1.4 菌株种的鉴定及新寄主的鉴定第38-39页
        1.5 小核盘菌菌株间生物学特性比较第39-40页
            1.5.1 菌落形态的观察第39页
            1.5.2 菌株生长速率测定第39页
            1.5.3 菌株菌核产量测定第39页
            1.5.4 菌株致病力测定第39-40页
        1.6 菌丝亲和群(Mycelial compatibility grouping)的测定第40页
        1.7 小核盘菌菌株的MAT基因类型第40-41页
            1.7.1 MAT基因的PCR扩增第40页
            1.7.2 PCR产物的纯化、回收与测序第40-41页
        1.8 湖北省小核盘菌菌株SSR遗传多样性分析第41-43页
            1.8.1 供试菌株第41页
            1.8.2 引物的筛选第41页
            1.8.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳、染色和显影第41-43页
        1.9 数据处理第43-44页
            1.9.1 生物学特性相关数据分析第43页
            1.9.2 遗传多样性相关数据分析第43-44页
    2 结果与分析第44-69页
        2.1 小核盘菌菌株收集第44-46页
        2.2 小核盘菌菌株的分离及纯化第46-49页
        2.3 小核盘菌菌株的鉴定第49页
        2.4 小核盘菌新寄主的鉴定第49-51页
        2.5 S.minor菌株的菌落形态的差异第51页
        2.6 S.minor菌株菌落生长速度的差异第51-52页
        2.7 S.minor菌株菌核产量的差异第52页
        2.8 S.minor菌株致病力的分化第52-54页
        2.9 生长速率、菌核产量及致病力的相关性分析第54-55页
        2.10 95个S.minor的菌丝亲和性测定结果第55-57页
        2.11 不同菌丝亲和群的多样性分析第57-59页
        2.12 湖北省S.minor菌株的微卫星标记引物扩增结果第59页
        2.13 湖北省S.minor菌株的遗传多样性第59-64页
        2.14 湖北省Sclerotinia minor菌株中Inv-和Inv+菌株的分布情况第64-65页
        2.15 Inv-和Inv+ type在湖北省Sclerotinia minor菌株中稳定性评估第65-68页
        2.16 不同菌丝亲和群间生物学特性的比较第68-69页
        2.17 不同MAT类型菌株的生物学特性的比较第69页
    3 讨论第69-73页
第三章 小核盘菌菌株LC22中真菌病毒SmEV1的研究第73-110页
    1 材料和方法第73-84页
        1.1 小核盘菌菌株及培养基第73-74页
        1.2 细菌菌株及培养基第74页
        1.3 载体和引物第74-75页
        1.4 酶及其它试剂材料第75页
        1.5 仪器及设备第75-76页
        1.6 dsRNA片段cDNA序列的克隆第76-80页
            1.6.1 菌丝的培养第76页
            1.6.2 小核盘菌菌丝中dsRNA的提取第76页
            1.6.3 dsRNA样品的去DNA处理第76-77页
            1.6.4 dsRNA样品回收与纯化第77页
            1.6.5 用随机引物合成cDNA第77-78页
            1.6.6 dsRNA中间部分序列的cDNA克隆第78页
            1.6.7 dsRNA末端cDNA序列的获取第78-79页
            1.6.8 cDNA的A-Tailing第79页
            1.6.9 dsRNA片段cDNA序列的拼接及分析第79-80页
        1.7 Northern杂交第80-82页
            1.7.1 试剂第80页
            1.7.2 RNA样品的预处理第80页
            1.7.3 变性胶的制备第80页
            1.7.4 电泳、转膜及固定第80-81页
            1.7.5 探针标记第81页
            1.7.6 预杂交与杂交第81-82页
            1.7.7 洗膜及显色第82页
        1.8 小核盘菌菌株LC22的生物学特性及致病力第82页
            1.8.1 菌落形态、生长速度及菌核产量的测定第82页
            1.8.2 致病力测定第82页
            1.8.3 菌丝顶端形态的观察第82页
        1.9 小核盘菌菌株LC22中dsRNA的传播特性第82-84页
            1.9.1 dsRNA在不同菌丝亲和群的小核盘菌菌株间的水平传播第82-83页
            1.9.2 dsRNA在小核盘菌菌株菌核后代中的垂直传播第83页
            1.9.3 dsRNA在小核盘菌菌株原生质体后代中的传播第83-84页
        1.10 数据分析第84页
    2 结果与分析第84-106页
        2.1 小核盘菌菌株LC22的弱致病性、培养特性和dsRNA的检测第84-85页
        2.2 小核盘菌菌株LC22中dsRNA片段全长cDNA序列的拼接及鉴定第85-86页
        2.3 病毒SmEV1基因组结构的分析以及缺刻特性的Northern杂交验证第86-87页
        2.4 SmEV1保守域序列分析及系统发育树的构建第87-98页
        2.5 SmEV1在不同菌株间水平传播特性第98-102页
            2.5.1 SmEV1在不同菌丝亲和群小核盘菌菌株间水平传播特性第98-99页
            2.5.2 不同S.minor菌株在传毒前后的生物学特性比较第99-102页
        2.6 SmEV1在小核盘菌LC22菌核后代中的垂直传播特性第102-105页
            2.6.1 SmEV1在小核盘菌LC22的菌核后代中能稳定的存在第102-103页
            2.6.2 8个不同S.minor菌株LC22的菌核后代的生物学特性第103-105页
        2.7 原生质体再生菌株的菌落形态第105页
        2.8 菌株LC22的生防潜能评估第105-106页
    3 讨论第106-110页
第四章 小核盘菌菌株LC38致病力衰退机制研究第110-123页
    1 材料和方法第110-113页
        1.1 供试菌株和植物第110页
        1.2 供试培养基及试剂第110-111页
        1.3 仪器设备第111页
        1.4 生物学特性第111页
        1.5 菌丝形态观察第111页
        1.6 致病力测定第111-112页
            1.6.1 离体烟草叶片的致病力测定第111-112页
            1.6.2 活体拟南芥植株的致病力测定第112页
        1.7 草酸的测定第112-113页
            1.7.1 草酸的定性测定第112页
            1.7.2 草酸的定量测定第112-113页
        1.8 数据分析第113页
    2 结果和分析第113-121页
        2.1 S.minor菌株LC38和LC41的菌落形态、生长速度及菌核产量第113-115页
        2.2 S.minor菌株LC41和LC38在培养基及病斑组织中的菌丝形态第115页
        2.3 S.minor菌株LC41和LC38在离体烟草叶片上的致病力测定第115-116页
        2.4 对不同生态型拟南芥的致病力测定第116-117页
        2.5 对不同拟南芥突变体的致病力测定第117-118页
        2.6 草酸的测定第118-121页
            2.6.1 草酸的定性测定第118-119页
            2.6.2 草酸的定量测定第119-121页
    3 讨论第121-123页
第五章 小核盘菌危害油菜的风险研究第123-134页
    1 材料和方法第123-126页
        1.1 供试菌株及培养基第123-124页
        1.2 油菜品种第124页
        1.3 对离体油菜叶片、茎杆及荚果的致病力测定第124页
        1.4 小核盘菌菌株对油菜的危害风险第124-125页
            1.4.1 小核盘菌菌核不同接种浓度对油菜的致病力测定第124-125页
            1.4.2 小核盘菌菌核不同接种距离对油菜的致病力测定第125页
        1.5 油菜菌核病的田间调查第125页
            1.5.1 油菜收获期病害的调查第125页
            1.5.2 油菜苗期病害的调查第125页
        1.6 数据分析第125-126页
    2 结果和分析第126-132页
        2.1 小核盘菌菌株对离体油菜叶片、茎杆和荚的致病力测定第126-129页
        2.2 小核盘菌菌核不同接种浓度对油菜的发病率第129-130页
        2.3 小核盘菌菌核不同接种距离对油菜的发病率第130页
        2.4 油菜收获期病害的调查结果第130-131页
        2.5 油菜苗期病害的调查结果第131-132页
    3 讨论第132-134页
第六章 全文结论、创新点及展望第134-137页
    1 结论第134-135页
    2 创新点第135-136页
    3 展望第136-137页
参考文献第137-153页
致谢第153-155页
发表论文情况第155页

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