| 致谢 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第9-19页 |
| 1.1 亲缘地理学 | 第9-15页 |
| 1.1.1 亲缘地理学简介 | 第9页 |
| 1.1.2 亲缘地理学相关理论 | 第9-11页 |
| 1.1.3 亲缘地理学研究中常用的分子标记 | 第11-14页 |
| 1.1.3.1 序列分析法 | 第12-13页 |
| 1.1.3.2 基因组扫描的分子标记 | 第13-14页 |
| 1.1.4 亲缘地理学主要探讨的问题 | 第14-15页 |
| 1.1.4.1 推断冰期避难所 | 第14页 |
| 1.1.4.2 探讨物种遗传多样性分布格局 | 第14页 |
| 1.1.4.3 估计近缘种间的分歧时间（Divergence Time） | 第14页 |
| 1.1.4.4 确定保护单元（Conservation Units） | 第14-15页 |
| 1.1.5 本研究目的与意义 | 第15页 |
| 1.2 景观遗传学 | 第15-17页 |
| 1.2.1 景观遗传学概念 | 第15-16页 |
| 1.2.2 景观遗传学研究方法 | 第16页 |
| 1.2.2.1 确定空间遗传格局 | 第16页 |
| 1.2.2.2 景观格局与环境特征的相关性分析 | 第16页 |
| 1.2.3 景观遗传学研究中的分子标记 | 第16-17页 |
| 1.3 黄栌的研究概况 | 第17-19页 |
| 1.3.1 物种介绍 | 第17-18页 |
| 1.3.2 生物形态学 | 第18页 |
| 1.3.3 黄栌的研究进展 | 第18-19页 |
| 2 黄栌的亲缘地理学研究 | 第19-34页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-22页 |
| 2.1.1 采样方法 | 第19-20页 |
| 2.1.2 提取基因组DNA | 第20页 |
| 2.1.3 PCR扩增与测序 | 第20-21页 |
| 2.1.4 数据分析 | 第21-22页 |
| 2.1.4.1 遗传多样性分析 | 第21页 |
| 2.1.4.2 遗传结构分析 | 第21页 |
| 2.1.4.3 单倍型网络图 | 第21页 |
| 2.1.4.4 IBD效应分析 | 第21页 |
| 2.1.4.5 分化时间的估算 | 第21-22页 |
| 2.1.4.6 失配分布与中性检验分析 | 第22页 |
| 2.1.4.7 过去和现在分布的推测 | 第22页 |
| 2.2 结果 | 第22-31页 |
| 2.2.1 黄栌序列变异分析和单倍型分布特点 | 第22-27页 |
| 2.2.2 遗传多样性 | 第27页 |
| 2.2.3 遗传结构的分析 | 第27-29页 |
| 2.2.4 IBD效应分析 | 第29页 |
| 2.2.5 分化时间 | 第29页 |
| 2.2.6 中性检验和失配分布的分析 | 第29-30页 |
| 2.2.7 通过生态位模型推分布情况 | 第30-31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-33页 |
| 2.3.1 遗传多样性和空间群体遗传结构 | 第31-32页 |
| 2.3.2 黄栌亲缘地理历史事件的推测 | 第32-33页 |
| 2.4 结论 | 第33-34页 |
| 3 黄栌的景观遗传学研究 | 第34-45页 |
| 3.1 微卫星标记的开发 | 第35-38页 |
| 3.1.1 实验部分 | 第35-36页 |
| 3.1.1.1 微卫星标记的分离 | 第35页 |
| 3.1.1.2 PCR扩增和基因分型 | 第35-36页 |
| 3.1.1.3 数据分析 | 第36页 |
| 3.1.2 结果与讨论 | 第36页 |
| 3.1.3 结论 | 第36-38页 |
| 3.2 黄栌景观遗传学研究 | 第38-45页 |
| 3.2.1 材料和方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1.1 采样方法 | 第38-40页 |
| 3.2.1.2 分子技术 | 第40页 |
| 3.2.1.3 数据分析 | 第40-41页 |
| 3.2.2 结果 | 第41-43页 |
| 3.2.2.1 基因多样性和群体结构 | 第41-42页 |
| 3.2.2.2 环境相关性分析 | 第42-43页 |
| 3.2.3 讨论 | 第43-44页 |
| 3.2.3.1 空间群体遗传结构 | 第43-44页 |
| 3.2.3.2 降雨促进适应性遗传变异 | 第44页 |
| 3.2.4 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-55页 |
| 附表 | 第55-64页 |
| 附录 | 第64-65页 |
| Abstract | 第65-66页 |