| 英汉缩略语名词对照 | 第6-8页 |
| 中文摘要 | 第8-14页 |
| 英文摘要 | 第14-20页 |
| 前言 | 第21-24页 |
| 第一部分 免疫抑制剂对活动期BD病患者肠道微生物的影响 | 第24-44页 |
| 1 材料和方法 | 第24-31页 |
| 1.1 研究对象和分组 | 第24页 |
| 1.2 主要实验仪器、试剂与耗材 | 第24-26页 |
| 1.3 粪便样本采集 | 第26页 |
| 1.4 粪便DNA抽提 | 第26-27页 |
| 1.5 Illumina测序实验流程 | 第27-29页 |
| 1.6 生物信息学分析 | 第29-31页 |
| 2 研究结果 | 第31-43页 |
| 2.1 OTU结果分析 | 第31-35页 |
| 2.2 显著性差异物种分析 | 第35-40页 |
| 2.3 物种LEfSe差异分析 | 第40-43页 |
| 3 讨论 | 第43-44页 |
| 第二部分 未用药活动期BD病患者肠道微生物宏基因组学研究 | 第44-69页 |
| 1 材料和方法 | 第44-54页 |
| 1.1 研究对象和分组 | 第44页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第44-46页 |
| 1.3 粪便样本采集 | 第46页 |
| 1.4 粪便DNA抽提 | 第46-47页 |
| 1.5 DNA质检 | 第47-48页 |
| 1.6 文库构建 | 第48-51页 |
| 1.6.1 DNA片段化 | 第48-49页 |
| 1.6.2 NEBNext End Prep 末端修复 | 第49页 |
| 1.6.3 Adaptor Ligation 连接接头 | 第49-50页 |
| 1.6.4 Size Section 片段选择 | 第50页 |
| 1.6.5 PCR 扩增 | 第50页 |
| 1.6.6 文库质检 | 第50-51页 |
| 1.7 Cluster簇生成 | 第51页 |
| 1.8 Illumina HiSeq测序 | 第51页 |
| 1.9 生物信息分析 | 第51-54页 |
| 2 结果 | 第54-63页 |
| 2.1 基因集构建 | 第54-55页 |
| 2.2 物种注释与差异物种分析 | 第55-56页 |
| 2.3 物种LEfSe差异分析 | 第56-58页 |
| 2.4 差异基因群聚类分析 | 第58-59页 |
| 2.5 功能注释分析 | 第59-61页 |
| 2.6 硫酸盐还原菌、产乳酸菌、产丁酸菌、产甲烷菌间相互关系 | 第61-63页 |
| 3 讨论 | 第63-69页 |
| 第三部分 未用药活动期BD病患者口腔微生物多样性的研究 | 第69-77页 |
| 1 材料和方法 | 第69-72页 |
| 1.1 研究对象和分组 | 第69页 |
| 1.2 主要实验仪器、试剂与耗材 | 第69-71页 |
| 1.3 唾液样本采集 | 第71页 |
| 1.4 唾液DNA抽提 | 第71-72页 |
| 1.5 Illumina Miseq测序实验 | 第72页 |
| 1.6 生物信息学分析 | 第72页 |
| 2 研究结果 | 第72-76页 |
| 2.1 显著性差异OTU结果分析 | 第72-73页 |
| 2.2 显著性差异物种分析 | 第73-75页 |
| 2.3 物种LEfSe差异分析 | 第75-76页 |
| 3 讨论 | 第76-77页 |
| 全文总结 | 第77-79页 |
| 研究展望 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-87页 |
| 文献综述：热休克蛋白与Behcet病相关性的研究 | 第87-96页 |
| 参考文献 | 第91-96页 |
| 附表一 宏基因组学研究中BD患者与正常人肠道微生物属水平分显著性差异 | 第96-105页 |
| 附表二 宏基因研究中BD患者与正常人肠道微生物种水平分显著性差异 | 第105-138页 |
| 附表三 BD患者和正常人肠道微生物基于KEGG数据库显著差异性KO | 第138-155页 |
| 附表四 BD患者和正常人肠道微生物基于eggNOG数据库显著差异性OG | 第155-212页 |
| 附表五 BD患者与正常人差异性模块及通路 | 第212-220页 |
| 致谢 | 第220-221页 |
| 攻读博士学位期间的学术论文 | 第221-222页 |
| 攻读博士学位期间主持和参与的课题 | 第222页 |
