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丙酮丁醇梭菌纤维小体在毕赤酵母表面展示与组装的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
英文缩略词表第13-14页
第一章 绪论第14-33页
    1.1 纤维素酶第14-15页
    1.2 纤维小体第15-25页
        1.2.1 纤维素结合模块(CBM)或纤维素结合域(CBD)第16-17页
        1.2.2 纤维素酶的催化域第17-19页
        1.2.3 脚手架蛋白(Scaffoldin 或 Scaffolding Protein)第19-20页
        1.2.4 粘连蛋白(Cohesin)与对接蛋白(Dockerin)第20-22页
        1.2.5 纤维小体的酶单元第22-24页
        1.2.6 纤维小体的表达调控第24-25页
    1.3 毕赤酵母表达系统及其表面展示系统第25-27页
        1.3.1 毕赤酵母表达系统第25-26页
        1.3.2 毕赤酵母表面展示系统第26-27页
    1.4 表面展示纤维小体的研究进展第27-28页
    1.5 本项目的研究内容与研究意义第28-33页
        1.5.1 本论文的研究意义第28-29页
        1.5.2 本论文的研究内容第29-33页
第二章 融合蛋白E4SD及脚手架蛋白CipA的克隆表达与纯化和微型纤维小体的体外装配第33-60页
    2.1 简介第33页
    2.2 仪器与材料第33-41页
        2.2.1 仪器第33-34页
        2.2.2 质粒与菌株第34页
        2.2.3 试剂、分子克隆工具酶与耗材第34-35页
        2.2.4 培养基与溶液第35-41页
    2.3 实验流程第41-42页
    2.4 实验方法第42-49页
        2.4.1 丙酮丁醇梭菌基因组的提取第42-43页
        2.4.2 大肠杆菌感受态细胞的制备第43页
        2.4.3 质粒转化第43页
        2.4.4 质粒的少量提取第43-44页
        2.4.5 琼脂糖凝胶电泳第44-45页
        2.4.6 酶切质粒或 PCR 产物第45页
        2.4.7 酶切产物的连接第45页
        2.4.8 PCR 体系与步骤第45-46页
        2.4.9 目的蛋白在大肠杆菌中的诱导表达第46页
        2.4.10 亲和层析纯化蛋白质第46-47页
        2.4.11 蛋白的检测第47页
        2.4.12 蛋白质互相作用的检测第47-48页
        2.4.13 酶活力的测定第48-49页
    2.5 实验结果第49-58页
        2.5.1 脚手架蛋白基因 cipA 的克隆第49-50页
        2.5.2 重组纤维素酶 E4SD 的克隆与构建第50-56页
        2.5.3 脚手架蛋白 miniCipA 与重组蛋白 E4SD 的表达、纯化和纤维小体的组装第56-57页
        2.5.4 纤维素酶酶活力的测定第57-58页
    2.6 本章小结第58-60页
第三章 白蚁纤维素酶 NtEG 参与纤维小体组装的研究第60-82页
    3.1 简介第60-61页
    3.2 仪器与材料第61-69页
        3.2.1 仪器第61-62页
        3.2.2 质粒与菌株第62页
        3.2.3 试剂、分子克隆工具酶与耗材第62-63页
        3.2.4 培养基与溶液第63-69页
    3.3 实验流程第69页
    3.4 实验方法第69-72页
        3.4.1 目的基因的获得与拼接、克隆第69-70页
        3.4.2 目的基因在毕赤酵母的组成型表达第70-72页
    3.5 实验结果第72-80页
        3.5.1 NtEGD 融合蛋白三维空间结构的模拟与评估第72-77页
        3.5.2 NtEGD 基因片段的获得第77-78页
        3.5.3 质粒 pGND 的获得第78页
        3.5.4 毕赤酵母 X33-Gap-ND 转化子的鉴定第78-79页
        3.5.5 NtEGD 蛋白纤维素酶活的测定第79-80页
    3.6 本章小结第80-82页
第四章 丙酮丁醇梭菌脚手架蛋白 CipA 在毕赤酵母 X33 的表面展示第82-104页
    4.1 引言第82页
    4.2 材料与设备第82-90页
        4.2.1 设备第82-83页
        4.2.2 质粒与菌株第83页
        4.2.3 试剂、分子克隆工具酶与耗材第83-85页
        4.2.4 培养基与溶液第85-90页
    4.3 实验流程第90-91页
    4.4 实验方法第91-95页
        4.4.1 目的基因的获得与拼接、克隆第91-92页
        4.4.2 目的基因在毕赤酵母的组成型表达第92-95页
        4.4.3 表面展示纤维小体的组装第95页
        4.4.4 表面展示纤维小体的纤维素酶活的测定第95页
    4.5 实验结果第95-102页
        4.5.1 含目的蛋白基因片段的毕赤酵母表面展示载体构建与转化第95-96页
        4.5.2 融合蛋白在毕赤酵母细胞表面的展示第96-97页
        4.5.3 目的融合蛋白在毕赤酵母细胞表面的 Western blotting 检测第97-98页
        4.5.4 融合蛋白 FSCipA 上的纤维素结合单元活性的检测第98-99页
        4.5.5 融合蛋白 FSCipA 上的粘连蛋白活性的检测第99-100页
        4.5.6 表面展示纤维小体纤维素酶活的检测第100-102页
    4.6 本章小结第102-104页
结论与展望第104-108页
    结论第104-105页
    本研究的创新之处第105页
    讨论与展望第105-108页
参考文献第108-118页
攻读博士学位期间取得的研究成果第118-119页
致谢第119页

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