大白菜根响应根肿菌侵染的基因表达研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 符号及缩写语说明 | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-19页 |
| 1.1 十字花科根肿病症状 | 第10-11页 |
| 1.2 根肿菌分类 | 第11页 |
| 1.3 根肿菌的生物学特征 | 第11-12页 |
| 1.4 根肿菌的保存、分离及检测 | 第12-13页 |
| 1.5 根肿菌生理小种划分 | 第13页 |
| 1.6 根肿菌侵染生理机制研究进展 | 第13-15页 |
| 1.7 高通量测序技术 | 第15-18页 |
| 1.7.1 转录组学测序技术 | 第16-17页 |
| 1.7.2 RNA-seq技术 | 第17页 |
| 1.7.3 转录组学测序技术在植物中的应用 | 第17-18页 |
| 1.8 本研究的目的意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-25页 |
| 2.1 材料 | 第19页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第19页 |
| 2.1.2 试剂 | 第19页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第19页 |
| 2.2 方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 根肿菌生理小种鉴定 | 第19-20页 |
| 2.2.2 根肿菌侵染处理 | 第20页 |
| 2.2.3 大白菜根组织总RNA的提取及检测 | 第20页 |
| 2.2.4 转录组测序 | 第20-21页 |
| 2.2.5 生物信息学分析 | 第21-22页 |
| 2.2.6 差异基因定量分析 | 第22-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-44页 |
| 3.1 根肿菌生理鉴定结果 | 第25-26页 |
| 3.2 根肿菌接种感病分析 | 第26-27页 |
| 3.3 RNA质量检测结果 | 第27-30页 |
| 3.4 测序结果统计 | 第30-31页 |
| 3.5 基因表达分析 | 第31-33页 |
| 3.5.1 序列比对统计结果 | 第31-32页 |
| 3.5.2 差异基因表达筛选 | 第32页 |
| 3.5.3 差异基因表达模式聚类 | 第32-33页 |
| 3.6 差异基因功能注释 | 第33-39页 |
| 3.6.1 差异表达基因的GO分类 | 第34-36页 |
| 3.6.2 差异表达基因的COG分类 | 第36-38页 |
| 3.6.3 差异表达基因的代谢通路 | 第38-39页 |
| 3.7 差异基因定量分析 | 第39-44页 |
| 3.7.1 细胞周期相关基因的定量分析 | 第39-42页 |
| 3.7.2 胼胝质沉积相关基因的定量表达 | 第42-44页 |
| 4 讨论 | 第44-49页 |
| 4.1 转录组分析 | 第44-45页 |
| 4.2 细胞周期相关基因 | 第45-47页 |
| 4.3 胼胝质沉积相关基因 | 第47-49页 |
| 5 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-58页 |
| 附录 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
