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iTRAQ结合2DLC-MS/MS筛选鼻咽癌转移相关蛋白

摘要第5-8页
Abstract第8-12页
目录第13-17页
1 绪论第17-20页
2 材料与方法第20-37页
    2.1 主要实验材料第20-25页
        2.1.1 细胞株第20页
        2.1.2 主要试剂第20-21页
        2.1.3 主要耗材第21-22页
        2.1.4 主要仪器和设备第22页
        2.1.5 主要试剂的配制第22-25页
        2.1.6 数据库搜索、生物信息学及图像分析软件第25页
    2.2 实验方法第25-36页
        2.2.1 技术路线第25-26页
        2.2.2 细胞培养第26-27页
        2.2.3 细胞总蛋白的提取和浓度测定第27页
        2.2.4 iTRAQ试剂标记蛋白第27-29页
        2.2.5 2DLC-MS/MS第29-30页
        2.2.6 蛋白数据库搜索第30页
        2.2.7 生物信息学分析第30-31页
        2.2.8 qRT-PCR验证部分差异蛋白在5-8F和6-10B中mRNA水平的表达差异第31-32页
        2.2.9 Western blotting验证RAN、TRIM29、ANXA5、SQSTM1在5-8F和6-10B中蛋白水平的表达差异第32-34页
        2.2.10 免疫组织化学检测RAN、TRIM29、ANXA5、SQSTM1在鼻咽癌组织中的表达第34-36页
    2.3 统计学分析第36-37页
3 结果第37-59页
    3.1 蛋白浓度测定结果第37-38页
    3.2 iTRAQ串联2DLC-MS/MS检测并且通过ProteinPilotTM 4.2软件进行Swissprot蛋白数据库搜索及鉴定第38-39页
        3.2.1 ProteinPilotT~(TM)4.2展示的蛋白搜索结果第38页
        3.2.2 蛋白定量匹配肽段第38-39页
        3.2.3 匹配肽段质谱图第39页
    3.3 两次质谱鉴定的结果第39-41页
        3.3.1 两次质谱鉴定结果第39-40页
        3.3.2 两次质谱结果分析第40-41页
    3.4 筛选与鼻咽癌转移相关差异表达蛋白第41-46页
    3.5 生物信息学分析第46-50页
        3.5.1 转移相关差异蛋白GO分析第46-48页
        3.5.2 转移相关差异蛋白KEGG信号通路分析第48-49页
        3.5.3 转移相关蛋白的PPI相互作用网络图第49-50页
    3.6 qRT-PCR检测23个基因在5-8F和6-10B中mRNA表达水平第50-55页
    3.7 蛋白浓度测定结果第55-56页
    3.8 Western blotting验证差异蛋白在两株细胞中的表达第56-57页
    3.9 免疫组织化学验证差异蛋白在发生转移的鼻咽癌组织和未发生转移的鼻咽癌组织中的表达差异第57-59页
4 讨论第59-65页
5 结论第65-66页
参考文献第66-73页
综述第73-90页
    参考文献第83-90页
攻读学位期间主要的研究成果第90-91页
致谢第91-92页

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