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谷子NBS类抗病基因的生物信息学分析及在锈菌胁迫中的表达

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 引言第11-17页
    1.1 植物抗病基因研究进展第11-14页
        1.1.1 植物抗病基因的结构及分类第11-13页
        1.1.2 植物 R 基因的克隆第13-14页
    1.2 实时荧光定量 PCR第14-17页
        1.2.1 Q-PCR 的基本原理第14页
        1.2.2 Q-PCR 的重要参数第14-15页
        1.2.3 Q-PCR 中的标记方法第15页
        1.2.4 内参基因第15-17页
2 材料和方法第17-26页
    2.1 试验材料第17页
        2.1.1 谷子基因组 DNA 信息的获得第17页
        2.1.2 试验仪器第17页
    2.2 谷子 NBS 类抗病基因的生物信息学分析第17-19页
        2.2.1 NBS 类抗病基因的筛选第17-18页
        2.2.2 NBS 类型基因的分类第18页
        2.2.3 NBS 类型基因的物理定位第18页
        2.2.4 NBS 类型基因系统进化树的构建第18-19页
    2.3 谷子 Q-PCR 的内参基因筛选第19-22页
        2.3.1 叶片采集第19页
        2.3.2 RNA 的提取第19-20页
        2.3.3 cDNA 的第一链合成第20-21页
        2.3.4 内参基因表达稳定性的 Q-PCR 分析第21-22页
        2.3.5 数据处理和分析数据第22页
    2.4 NBS-1、NBS-2 在锈菌胁迫下的基因表达分析第22-26页
        2.4.1 NBS-1、NBS-2 基因的生物信息学分析第22-25页
        2.4.2 基因表达分析第25-26页
3 结果与分析第26-40页
    3.1 谷子 NBS 类 RGAs 的生物信息学分析结果第26-33页
        3.1.1 NBS 类候选数据库的建立第26-28页
        3.1.2 NBS 类型基因的分类第28页
        3.1.3 NBS 类的物理图谱第28-31页
        3.1.4 NBS 类建树分析第31-33页
    3.2 谷子 Q-PCR 的内参基因筛选第33-37页
        3.2.1 总 RNA 的提取第33页
        3.2.2 Q-PCR 引物分析第33-34页
        3.2.3 Q-PCR 中各基因的 Ct 值第34页
        3.2.4 geNorm 分析第34-36页
        3.2.5 NormFinder 分析第36页
        3.2.6 BestKeeper 分析第36页
        3.2.7 适合 Q-PCR 的内参基因确定第36-37页
    3.3 NBS-1、NBS-2 在锈菌胁迫下的基因表达分析第37-40页
        3.3.1 NBS-1、NBS-2 基因的生物信息学分析第37-38页
        3.3.2 NBS-1、NBS-2 基因的表达分析第38-40页
4 讨论第40-43页
    4.1 谷子 NBS 类 RGAs 的数量、种类及进化关系研究第40页
    4.2 谷子 Q-PCR 内参基因的筛选第40-41页
    4.3 谷子 RGAs 在抗病过程中的功能第41-43页
5 结论第43-44页
参考文献第44-51页
在读期间发表的学术论文第51-52页
作者简历第52-53页
致谢第53-54页

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