| 创新点 | 第8-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10页 |
| 前言 | 第11-14页 |
| 第一章 植物内生放线菌和红树林 | 第14-37页 |
| 1. 植物内生菌研究进展 | 第14-17页 |
| 1.1 植物内生放线菌研究意义 | 第14页 |
| 1.2 植物内生放线菌次级代谢产物研究进展 | 第14-17页 |
| 2. 红树林生态 | 第17-22页 |
| 2.1 红树林环境及植物适应性 | 第17-19页 |
| 2.2 红树林植物种类及分布 | 第19-20页 |
| 2.3 红树林其他生物群落 | 第20-22页 |
| 3. 红树林植物内生放线菌研究现状 | 第22-28页 |
| 3.1 红树林植物内生放线菌多样性 | 第22-25页 |
| 3.2 红树林植物内生放线菌次级代谢产物 | 第25-28页 |
| 4. 中国东南沿海红树林概况 | 第28-32页 |
| 4.1 中国红树植物概况 | 第28-31页 |
| 4.2 海南东寨港红树林自然保护区概况 | 第31-32页 |
| 参考文献 | 第32-37页 |
| 第二章 海南东寨港真红树植物内生放线菌多样性 | 第37-65页 |
| 1. 实验材料 | 第37-42页 |
| 1.1 样品 | 第37-39页 |
| 1.2 试剂及耗材 | 第39-40页 |
| 1.3 培养基及抑制剂 | 第40-42页 |
| 1.3.1 分离培养基 | 第40-41页 |
| 1.3.2 菌种纯化和保藏培养基 | 第41页 |
| 1.3.3 大肠杆菌转化培养基 | 第41页 |
| 1.3.4 抑制剂 | 第41页 |
| 1.3.5 配制注意事项 | 第41-42页 |
| 2. 实验方法 | 第42-47页 |
| 2.1 样品处理 | 第42页 |
| 2.2 菌落分离与纯化 | 第42页 |
| 2.3 菌种保藏 | 第42-43页 |
| 2.3.1 斜面保藏 | 第42页 |
| 2.3.2 甘油冷冻保藏 | 第42页 |
| 2.3.3 真空冷冻干燥保藏 | 第42-43页 |
| 2.4 菌株初步鉴定 | 第43页 |
| 2.5 菌株的分子鉴定 | 第43-44页 |
| 2.5.1 菌株总DNA的提取 | 第43页 |
| 2.5.2 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第43-44页 |
| 2.5.3 琼脂糖凝胶电泳检测PCR反应结果 | 第44页 |
| 2.5.4 16S rRNA基因序列测定与分析 | 第44页 |
| 2.6 潜在新物种的初步鉴定 | 第44-47页 |
| 2.6.1 潜在新物种16S rRNA基因序列的克隆测定 | 第44-46页 |
| 2.6.2 形态特征 | 第46-47页 |
| 3. 结果与分析 | 第47-62页 |
| 3.1 菌株分离效果 | 第47-48页 |
| 3.2 培养特征观察和分群 | 第48-49页 |
| 3.3 基因组DNA的提取结果 | 第49-50页 |
| 3.4 真红树植物内生放线菌多样性分析 | 第50-53页 |
| 3.5 潜在新物种的初步鉴定结果 | 第53-60页 |
| 3.5.1 菌株S3Af-1序列测定 | 第53-54页 |
| 3.5.2 菌株S3Af-1系统发育分析 | 第54-55页 |
| 3.5.3 菌株S3Af-1的形态观察结果 | 第55页 |
| 3.5.4 菌株S3Cf-2序列测定 | 第55-56页 |
| 3.5.5 菌株S3Cf-2系统发育分析 | 第56-60页 |
| 3.5.6 菌株S3Cf-2的形态观察结果 | 第60页 |
| 3.6 放线菌在不同植物及植物部位的分布 | 第60-62页 |
| 3.6.1 放线菌在不同真红树植物的分布 | 第60-61页 |
| 3.6.2 放线菌在不同真红树植物部位的分布 | 第61-62页 |
| 3.7 放线菌在不同培养基中的分布 | 第62页 |
| 4. 讨论 | 第62-64页 |
| 4.1 放线菌的分离 | 第62-63页 |
| 4.2 放线菌的多样性 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-65页 |
| 第三章 真红树植物内生放线菌活性研究及PKS、NRPS功能基因初步筛选 | 第65-79页 |
| 1. 实验材料 | 第65-67页 |
| 1.1 供试菌株 | 第65页 |
| 1.2 检定菌 | 第65页 |
| 1.3 试剂及耗材 | 第65-66页 |
| 1.4 实验仪器 | 第66-67页 |
| 1.5 培养基 | 第67页 |
| 1.5.1 放线菌发酵培养基 | 第67页 |
| 1.5.2 检定菌培养基 | 第67页 |
| 2. 实验方法 | 第67-69页 |
| 2.1 抗菌活性筛选 | 第67-68页 |
| 2.1.1 发酵与提取 | 第67-68页 |
| 2.1.2 检定菌培养基的制备 | 第68页 |
| 2.1.3 抗菌活性的筛选 | 第68页 |
| 2.2 PKS Ⅰ、PKS Ⅱ和NRPS功能基因的初步筛选 | 第68-69页 |
| 2.2.1 菌株总DNA提取 | 第68页 |
| 2.2.2 NRPS、PKS Ⅰ和PKS Ⅱ基因PCR扩增 | 第68-69页 |
| 3. 结果与分析 | 第69-74页 |
| 3.1 抗菌活性筛选结果 | 第69-70页 |
| 3.2 潜在新物种S3Cf-2和新种S3Af-1的活性筛选结果 | 第70-71页 |
| 3.3 PKS、NRPS功能基因初步筛选结果 | 第71-74页 |
| 4. 讨论 | 第74-78页 |
| 4.1 抗菌活性筛选 | 第74-76页 |
| 4.2 潜在新物种S3Cf-2活性评价 | 第76-77页 |
| 4.3 PKS、NRPS功能基因筛选 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-79页 |
| 第四章 小单孢菌科潜在新物种S3Cf-2活性次级代谢产物研究 | 第79-91页 |
| 1. 实验材料 | 第79-80页 |
| 1.1 试剂及耗材 | 第79页 |
| 1.2 实验仪器 | 第79-80页 |
| 1.3 培养基 | 第80页 |
| 1.3.1 菌株培养基 | 第80页 |
| 1.3.2 菌株发酵培养基 | 第80页 |
| 1.3.3 检定菌培养基 | 第80页 |
| 1.4 检定菌 | 第80页 |
| 2. 实验方法 | 第80-83页 |
| 2.1 发酵周期测定 | 第80-81页 |
| 2.1.1 菌株纯化 | 第80页 |
| 2.1.2 一级菌悬液制备 | 第80-81页 |
| 2.1.3 二级发酵周期测定 | 第81页 |
| 2.1.4 活性测定 | 第81页 |
| 2.2 Sephadex LH-20葡聚糖凝胶柱层析及活性追踪 | 第81页 |
| 2.3 HPLC分析 | 第81-83页 |
| 2.3.1 样品预处理 | 第81页 |
| 2.3.2 HPLC分析条件 | 第81-82页 |
| 2.3.3 活性物质的LC-MS分析 | 第82-83页 |
| 3. 结果与分析 | 第83-90页 |
| 3.1 菌株S3Cf-2活性曲线测定结果 | 第83-84页 |
| 3.2 活性物质TLC分析结果 | 第84页 |
| 3.3 HPLC分离及活性检测 | 第84-90页 |
| 4. 讨论 | 第90-91页 |
| 论文附录 | 第91-118页 |
| 硕士研究生期间收录论文 | 第118-119页 |
| 致谢 | 第119-121页 |
