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基于TCGA数据库的膀胱癌mRNA表达及内源性RNA表达谱的研究

中文摘要第5-7页
ABSTRACT第7-9页
英汉缩略词对照表第10-11页
前言第11-20页
    1 膀胱癌简介第11-12页
    2 基因芯片技术第12页
    3 高通量测序第12-13页
    4 生物信息学第13-14页
    5 R语言简介第14-15页
    6 竞争性内源RNA假说第15-16页
    7 mRNA简介第16页
    8 miRNA简介第16-17页
    9 LncRNA简介第17-18页
    10 本研究目的及意义第18-20页
1 材料方法第20-27页
    1.1 数据的收集与处理第20-22页
    1.2 膀胱癌中差异表达的RNAs分析第22页
    1.3 ceRNA网络的构建第22-24页
    1.4 基因功能富集分析第24-25页
    1.5 蛋白互作网络(PPI)的构建第25-26页
    1.6 生存分析第26-27页
2 实验结果第27-46页
    2.1 TCGA数据库组织样本的临床特征第27页
    2.2 膀胱癌中差异表达的RNAs第27-28页
    2.3 ceRNA网络的分析第28-36页
    2.4 基因功能富集结果第36-38页
    2.5 基于差异表达的mRNA的预后风险评分第38-40页
    2.6 PPI的网络分析第40-43页
    2.7 临床病理特征与ceRNA网络中的基因表达相关第43-46页
3 讨论第46-49页
    3.1 ceRNA假说的意义第46-47页
    3.2 数据的收集和筛选第47页
    3.3 差异表达基因的功能富集分析第47-48页
    3.4 基于12个mRNA表达谱的整体生存预测模型第48页
    3.5 PPI网络分析第48页
    3.6 本研究构建的ceRNA网络中与BC分级、分期相关RNA的分析第48-49页
4 结论第49-51页
参考文献第51-60页
综述:MicroRNA与LncRNA在膀胱癌中的研究进展第60-74页
    参考文献第68-74页
攻读学位期间发表的学术论文目录第74-75页
致谢第75-76页

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