中文摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
英汉缩略词对照表 | 第10-11页 |
前言 | 第11-20页 |
1 膀胱癌简介 | 第11-12页 |
2 基因芯片技术 | 第12页 |
3 高通量测序 | 第12-13页 |
4 生物信息学 | 第13-14页 |
5 R语言简介 | 第14-15页 |
6 竞争性内源RNA假说 | 第15-16页 |
7 mRNA简介 | 第16页 |
8 miRNA简介 | 第16-17页 |
9 LncRNA简介 | 第17-18页 |
10 本研究目的及意义 | 第18-20页 |
1 材料方法 | 第20-27页 |
1.1 数据的收集与处理 | 第20-22页 |
1.2 膀胱癌中差异表达的RNAs分析 | 第22页 |
1.3 ceRNA网络的构建 | 第22-24页 |
1.4 基因功能富集分析 | 第24-25页 |
1.5 蛋白互作网络(PPI)的构建 | 第25-26页 |
1.6 生存分析 | 第26-27页 |
2 实验结果 | 第27-46页 |
2.1 TCGA数据库组织样本的临床特征 | 第27页 |
2.2 膀胱癌中差异表达的RNAs | 第27-28页 |
2.3 ceRNA网络的分析 | 第28-36页 |
2.4 基因功能富集结果 | 第36-38页 |
2.5 基于差异表达的mRNA的预后风险评分 | 第38-40页 |
2.6 PPI的网络分析 | 第40-43页 |
2.7 临床病理特征与ceRNA网络中的基因表达相关 | 第43-46页 |
3 讨论 | 第46-49页 |
3.1 ceRNA假说的意义 | 第46-47页 |
3.2 数据的收集和筛选 | 第47页 |
3.3 差异表达基因的功能富集分析 | 第47-48页 |
3.4 基于12个mRNA表达谱的整体生存预测模型 | 第48页 |
3.5 PPI网络分析 | 第48页 |
3.6 本研究构建的ceRNA网络中与BC分级、分期相关RNA的分析 | 第48-49页 |
4 结论 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-60页 |
综述:MicroRNA与LncRNA在膀胱癌中的研究进展 | 第60-74页 |
参考文献 | 第68-74页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第74-75页 |
致谢 | 第75-76页 |