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Evoked Membrane Potential Change in Rat Optic Nerve Fibre: Computer Simulation

Abstract第5-6页
摘要第7-12页
1. Rat optic nerve第12-18页
    1.1 Presentation第12-13页
    1.2 RON data第13-18页
        1.2.1 Drugs第13页
        1.2.2 Main phenomena第13-18页
2. Rat optic nerve model第18-44页
    2.1 Introduction第18-19页
    2.2 Methods第19-28页
        2.2.1 Ion channels第24-25页
        2.2.2 Simulation procedure第25-28页
    2.3 Results第28-42页
        2.3.1 Extracellular potassium第28-30页
        2.3.2 Slow potassium第30-36页
        2.3.3 A-current第36-42页
    2.4 Discussion第42-44页
        2.4.1 Link with anterior studies第42页
        2.4.2 Limitations of the model第42-44页
3. Optic nerve data第44-54页
    3.1 General Data第44-46页
        3.1.1 Primates optic nerve第44-45页
        3.1.2 Rat optic nerve第45-46页
    3.2 Electrical data第46-52页
        3.2.1 Sucrose gap第46-47页
        3.2.2 Compound action potential第47-52页
    3.3 Ion concentrations data第52-54页
        3.3.1 General data第52页
        3.3.2 K~+ homeostasis第52-54页
4. Theory of nerve conduction第54-62页
    4.1 Ions第54-56页
        4.1.1 Data第54页
        4.1.2 Resting Equilibrium第54-55页
        4.1.3 Nernst potential & driving force第55-56页
    4.2 Mechanisms第56-62页
        4.2.1 Ion channels第56-57页
        4.2.2 Myelin第57页
        4.2.3 homeostasis第57-62页
5. Nerve model: existing models第62-72页
    5.1 Models based on Hodgkin and Huxley theory第62-69页
        5.1.1 Hodgkin and Huxley model of action potential generation第62-63页
        5.1.2 Notable models第63-64页
        5.1.3 Example of a compartmental model: McIntyre et al第64-68页
        5.1.4 Stimulations第68-69页
    5.2 Individual Channels: Markov第69-72页
6. Nerve model: computation - theory第72-80页
    6.1 Introduction第72-73页
    6.2 Approximation of the derivative: finite difference methods第73-75页
        6.2.1 forward Euler & backward Euler第73-74页
        6.2.2 Other methods第74-75页
    6.3 Implicit & Explicit methods第75页
        6.3.1 The Stiffness issue第75页
    6.4 PDEs第75-80页
        6.4.1 Approximating (?)V/(?)t第76页
        6.4.2 Tridiagonal system第76页
        6.4.3 Notation第76-78页
        6.4.4 Nonlinear Equations第78-79页
        6.4.5 Spatial Variation第79页
        6.4.6 Boundary Conditions第79-80页
7. Nerve model: computation - Matlab第80-83页
    7.1 Program *.mat files第80页
    7.2 Utilisation第80-83页
        7.2.1 Command line第81-82页
        7.2.2 Save第82页
        7.2.3 Example第82-83页
8. Appendix第83-88页
    8.1 Electric equations第83-86页
        8.1.1 Notations第83-85页
        8.1.2 Equations第85-86页
    8.2 Matlab files第86-88页
        8.2.1 Main file第86页
        8.2.2 Parameters & Variables第86-87页
        8.2.3 Equations & Resolution第87页
        8.2.4 Figures第87页
        8.2.5 Auxiliary functions第87-88页
BIBLIOGRAPHY第88-93页
Acknowledgments第93页

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