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柑橘显微结构和miRNA对硼毒害的响应

摘要第10-13页
ABSTRACT第13-17页
第一章 文献综述第18-30页
    1.1 植物B营养概述第19-27页
        1.1.1 植物对B的吸收、转运与再分配第19-20页
        1.1.2 B在植物细胞内的分布第20-21页
        1.1.3 B的生物学功能第21-24页
        1.1.4 植物B毒害的发生与耐B毒机理第24-27页
    1.2 柑橘B毒害研究进展第27-29页
    1.3 本研究的意义第29-30页
第二章 B毒害处理对柑橘根、叶显微结构以及体内B分布的影响第30-50页
    2.1 材料与方法第30-32页
        2.1.1 柑橘实生苗培养与B毒害处理第30-31页
        2.1.2 植株的生物量测定第31页
        2.1.3 B与叶绿素含量测定第31页
        2.1.4 BOR1、NIP5;1和BOR4的半定量qPCR分析第31-32页
        2.1.5 气体交换指标、叶绿素荧光测定第32页
        2.1.6 显微观察与形态指标测定第32页
        2.1.7 实验设计与统计分析第32页
    2.2 结果与分析第32-46页
        2.2.1 B毒害对柑橘生物量的影响第32-33页
        2.2.2 B毒害对叶绿素含量、总B含量、B分布的影响第33-36页
        2.2.3 B毒害对叶片BOR1、NIP5;1和BOR4相对表达量的影响第36页
        2.2.4 B毒害对叶片气体交换、荧光参数的影响第36-38页
        2.2.5 B毒害对柑橘根、叶解剖结构的影响第38-40页
        2.2.6 B毒害对柑橘根、叶超微结构的影响第40-46页
    2.3 讨论第46-49页
        2.3.1 B毒害对柑橘植株生长的影响第46页
        2.3.2 B毒害对柑橘根、叶显微结构的影响第46-48页
        2.3.3 柑橘中B的吸收与转运第48页
        2.3.4 柑橘耐受B毒害的可能机制第48-49页
    2.4 小结第49-50页
第三章 柑橘叶片miRNA对B毒害的响应第50-68页
    3.1 材料与方法第51-52页
        3.1.1 试验材料及其培养和B毒害处理第51页
        3.1.2 RNA提取与质量检测第51页
        3.1.3 柑橘小RNA文库构建与Solexa测序第51页
        3.1.4 小RNA文库序列分析与miRNA预测第51页
        3.1.5 miRNA差异表达分析第51页
        3.1.6 靶基因预测第51-52页
        3.1.7 靶基因的GO分析第52页
        3.1.8 茎环结构法检测miRNA表达量第52页
        3.1.9 靶基因的表达量分析第52页
        3.1.10 靶基因剪切产物5'-RACE验证第52页
        3.1.11 细胞壁多糖的细胞化学分析第52页
    3.2 结果与分析第52-63页
        3.2.1 B毒害对植株的影响第52-53页
        3.2.2 小RNA文库测序结果的初步分析第53-54页
        3.2.3 保守与非保守miRNA的鉴定及生物信息学分析第54-57页
        3.2.4 B毒害胁迫下的miRNA差异表达分析第57-58页
        3.2.5 差异表达miRNA的qRT-PCR验证第58-59页
        3.2.6 差异表达miRNA靶基因的预测与GO分析第59-60页
        3.2.7 候选靶基因的qRT-PCR分析第60-61页
        3.2.8 柑橘miRNA剪切靶基因的RLM-RACE验证第61-62页
        3.2.9 miR397a表达量改变引起柑橘叶脉细胞壁次生沉积第62-63页
    3.3 讨论第63-67页
        3.3.1 柑橘miRNA的序列多样性第64页
        3.3.2 miRNA与其靶基因的互作第64-65页
        3.3.3 miRNA对B毒害的响应第65-66页
        3.3.4 柑橘叶片的可能耐B毒机制第66-67页
    3.4 小结第67-68页
第四章 B毒害响应miR397a靶向LACs调控木质素次生合成对维管组织B转运的影响第68-94页
    4.1 材料与方法第68-71页
        4.1.1 试验材料及其培养和B毒害处理第68页
        4.1.2 miR397a及其靶基因的克隆与序列分析第68-69页
        4.1.3 木质素代谢相关基因的qRT-PCR检测第69页
        4.1.4 细胞壁主要成分的含量检测第69-70页
        4.1.5 木质素的细胞化学定位第70页
        4.1.6 miR397a及其靶基因的原位表达分析第70页
        4.1.7 次生木质素转运途径的亚细胞分析第70页
        4.1.8 自由态B和结合态B的检测第70页
        4.1.9 B的原位检测第70-71页
        4.1.10 试验设计和统计分析第71页
    4.2 结果与分析第71-87页
        4.2.1 miR397a的5'-RACE克隆与序列分析第71-73页
        4.2.2 LAC4、LAC17的ORF全长克隆与序列分析第73-75页
        4.2.3 B毒害对柑橘叶片细胞壁主要成分含量的影响第75-76页
        4.2.4 B毒害对柑橘叶片漆酶家族基因表达的影响第76-78页
        4.2.5 B毒害对柑橘叶片木质素细胞化学的影响第78-79页
        4.2.6 miR397a及其靶基因的原位表达分析第79-81页
        4.2.7 B毒害柑橘叶脉次生木质素合成与转运途径的亚细胞定位第81-83页
        4.2.8 B毒害对柑橘叶片不同结合态B含量的影响第83-84页
        4.2.9 B毒害对柑橘叶片主脉中~(11)B和~(13)C空间分布的影响第84-87页
    4.3 讨论第87-93页
        4.3.1 miR397a的转录、加工及其与靶基因的互作第87-88页
        4.3.2 miR397a靶向LACs对维管细胞壁木质素次生合成的调控第88-89页
        4.3.3 木质素的细胞壁转运与聚合第89-90页
        4.3.4 木质素次生合成对B转运的影响第90-91页
        4.3.5 基于木质素次生合成的柑橘耐B毒机制第91-92页
        4.3.6 LA-ICP-MS技术的优缺点第92-93页
    4.4 小结第93-94页
第五章 柑橘根尖miRNA对B毒害的响应第94-109页
    5.1 材料与方法第94-96页
        5.1.1 试验材料第94页
        5.1.2 RNA提取与质量检测第94页
        5.1.3 根尖小RNA文库构建与高通量测序第94-95页
        5.1.4 测序数据质量控制与sRNA分类注释第95页
        5.1.5 miRNA表达量分析第95页
        5.1.6 miRNA靶基因预测第95页
        5.1.7 miRNA靶基因注释与GO分析第95页
        5.1.8 差异表达miRNA的stem-loop qRT-PCR验证第95页
        5.1.9 候选靶基因的表达量分析第95-96页
        5.1.10 靶基因剪切产物5'-RACE验证第96页
    5.2 结果与分析第96-104页
        5.2.1 B毒害处理对柑橘根系的影响第96页
        5.2.2 高通量测序结果的初步分析第96-98页
        5.2.3 B毒害胁迫下的根尖miRNA差异表达分析第98-99页
        5.2.4 差异表达miRNA靶基因的预测与GO分析第99-101页
        5.2.5 差异表达miRNA的stem-loop qRT-PCR验证第101页
        5.2.6 候选靶基因的qRT-PCR分析第101-102页
        5.2.7 miRNA剪切靶基因RLM-5'-RACE的验证第102-104页
        5.2.8 Ciclev10000756m.g.v1.0编码蛋白的生物信息学初步分析第104页
    5.3 讨论第104-108页
        5.3.1 柑橘miRNA响应B毒害的组织特异性第105页
        5.3.2 miRNA与靶基因的互作第105-106页
        5.3.3 根尖miRNA对B毒害的响应第106-107页
        5.3.4 柑橘根系对长期B毒害的适应性调节第107-108页
    5.4 小结第108-109页
第六章 结论第109-110页
参考文献第110-129页
攻读博士学位期间发表的学术论文第129-130页
致谢第130-131页
附录第131-187页
    Supplementary Table 3-1第131-132页
    Supplementary Table 3-2第132-133页
    Supplementary Table 3-3第133-134页
    Supplementary Dataset 3-S1第134-162页
    Supplementary Dataset 3-S2第162-165页
    Supplementary Dataset 3-S3第165-170页
    Supplementary Table 4-1第170页
    Supplementary Table 4-2第170-171页
    Supplementary Table 4-3第171页
    Supplementry Fig.4-1第171-172页
    Supplementry Fig.4-2第172-173页
    Supplementry Fig.4-3第173-174页
    Supplementry Fig. 4-4第174-175页
    Supplementary Table 5-1第175-176页
    Supplementary Table 5-2第176页
    Supplementary Table 5-3第176-177页
    Supplementary Dataset 5-S1第177-184页
    Supplementary Dataset 5-S2第184-186页
    Supplementary Dataset 5-S3第186-187页

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