| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩略语 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-25页 |
| 1.1 高通量测序研究进展 | 第11-22页 |
| 1.1.1 NGS模板的制备 | 第11-13页 |
| 1.1.2 NGS测序方法 | 第13-16页 |
| 1.1.3 长读序列 | 第16-19页 |
| 1.1.4 基因组比对和装配 | 第19-20页 |
| 1.1.5 基因组富集 | 第20页 |
| 1.1.6 NGS的应用 | 第20-22页 |
| 1.2 立题依据 | 第22-25页 |
| 第二章 材料和方法 | 第25-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第25页 |
| 2.1.2 引物设计及合成 | 第25-26页 |
| 2.1.3 试剂和试剂盒 | 第26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-33页 |
| 2.2.1 T4及T5代OsRhoGDI2过表达转基因水稻阳性植株的检测 | 第26-27页 |
| 2.2.2 T4及T5代OsRhoGDI2过表达转基因水稻的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.2.3 水稻成熟期农艺学性状统计 | 第28页 |
| 2.2.4 水稻雌雄蕊形成期幼穗的转录组测序 | 第28-31页 |
| 2.2.5 转录组测序结果的验证 | 第31页 |
| 2.2.6 T5代OsRhoGDI2过表达水稻幼穗组织植物激素含量的检测 | 第31-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-49页 |
| 3.1 T4代OsRhoGDI2过表达转基因水稻的筛选和鉴定 | 第33-34页 |
| 3.2 T4代OsRhoGDI2过表达转基因水稻农艺学性状的统计 | 第34-35页 |
| 3.3 转录组测序分析 | 第35-46页 |
| 3.3.1 测序数据质量评估 | 第35-36页 |
| 3.3.2 样本reads读取的分布 | 第36页 |
| 3.3.3 样本之间的相似性和聚类分析 | 第36-37页 |
| 3.3.4 差异表达基因转录本的数量分析 | 第37-38页 |
| 3.3.5 差异表达基因的层次聚类及功能富集 | 第38-46页 |
| 3.4 转录组测序结果的验证 | 第46-47页 |
| 3.5 T5代OsRhoGDI2过表达转基因水稻的筛选、鉴定及植物激素含量检测 | 第47-49页 |
| 第四章 讨论 | 第49-53页 |
| 4.1 OsRhoGDI2过表达对水稻幼穗穗营养物质合成和分配的影响 | 第49-50页 |
| 4.2 OsRhoGDI2基因过表达对水稻植物激素信号转导途径的影响 | 第50-53页 |
| 第五章 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 附录 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第71-72页 |
