| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第11-13页 |
| 1.2 研究内容与目标 | 第13-15页 |
| 1.3 论文结构 | 第15-16页 |
| 第二章 数据和研究方法 | 第16-21页 |
| 2.1 数据 | 第16-17页 |
| 2.1.1 DNA序列保守数据 | 第16页 |
| 2.1.2 全基因组序列数据 | 第16-17页 |
| 2.2 数据的选取和处理 | 第17-19页 |
| 2.3 研究方法 | 第19-21页 |
| 2.3.1 核苷酸k联体非联配算法 | 第19-20页 |
| 2.3.2 邻接法 | 第20-21页 |
| 第三章 鸟类基因组进化树的构建与分析 | 第21-33页 |
| 3.1 鸟类基因组保守片段k-mer频次统计 | 第21-23页 |
| 3.2 IMU进化树 | 第23-27页 |
| 3.3 IMU进化树与Prum和Jarvis进化树的比较分析 | 第27-32页 |
| 3.3.1 Prum和Jarvis进化树的比较 | 第27-28页 |
| 3.3.2 IMU进化树与Prum和Jarvis等构建进化树的比较分析 | 第28-29页 |
| 3.3.3 三树相关量的比较 | 第29-32页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第32-33页 |
| 第四章 全基因组序列经典进化方程 | 第33-43页 |
| 4.1 鸟类基因组经典进化模型 | 第33-36页 |
| 4.1.1 c值的估算 | 第34页 |
| 4.1.2 α和β值的估算 | 第34-35页 |
| 4.1.3 f值的估算 | 第35页 |
| 4.1.4 边界条件的估算 | 第35页 |
| 4.1.5 全基因组碱基总数初值的估算 | 第35-36页 |
| 4.2 参数的确定 | 第36-39页 |
| 4.2.1 参数α的确定 | 第36-37页 |
| 4.2.2 参数β的确定 | 第37页 |
| 4.2.3 参数f/c的确定 | 第37-38页 |
| 4.2.4 a类鸟的进化规律 | 第38-39页 |
| 4.3 结果 | 第39-41页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第41-43页 |
| 第五章 总结与展望 | 第43-45页 |
| 5.1 全文总结 | 第43-44页 |
| 5.2 工作展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第49页 |